T-COFFEE, Version_12.00.7fb08c2 (2018-12-11 09:27:12 - Revision 7fb08c2 - Build 211)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=1000
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    : 100
C2    : 100
C3    : 100
C4    : 100
C5    : 100
C6    : 100
C7    : 100
C8    : 100
C9    : 100
C10   : 100
C11   : 100
C12   : 100
C13   : 100
C14   : 100
C15   : 100
C16   : 100
C17   : 100
C18   : 100
C19   : 100
con   : 100

C1    -------------------MAENGTISVEELKRLLEQWNLVIGFL
C2    -------------------MAENGTISVEELKRLLEQWNLVIGFL
C3    -------------------MAENGTISVEELKRLLEQWNLVIGFL
C4    ------------------MSGSNHTVPVGEVLEHLRNWSFAWNII
C5    ------------------MSGSNQTVPVGEVLEHLRNWSFAWNII
C6    ------------------MTESNATLPKAEVLAAVRDWNFTLSLF
C7    MNIFCLLCVMALVPYTFADSSTNNSIPVDQVVEHLRNWNFSWNII
C8    -------------------MTDNGTISVEQVVAHLRNWNFSWNVI
C9    -----------------MSNSTSGTIPVEQVVEHLRNWNFSWNVI
C10   -----------------MSNSTSGTIPVEQVVEHLRNWNFSWNVI
C11   ----------------MSGECNNNTVSRTEVIAALKDWNFAVSVL
C12   ------------------MSSSNSTFSKEEVFKAVKDWNFAVAIL
C13   ------------------MSSSNSTFSKEEVFKAVKDWNFAVAIL
C14   -------------------MSSNGSLTKDEVVNIIKDWNFSWSII
C15   ------------------MSSDNSTFSKEEVFKAVRDWNFAVAIL
C16   -------------------MADNGTISVEELKRLLEQWNLVIGFL
C17   -------------------MAENGTISVEELKRLLEQWNLVIGFL
C18   -------------------MSNMTQLTEQQIISIIKDWNFAWSLI
C19   --------------------MSNSSLTNEQIVSIIKDWNFAWSII

con                            ..  ::   :.:*.:   .:


C1    FLAWIMLLQFAYSNRNRLLYIIKLVFLWLLWPVTLACFVLAAV--
C2    FLAWIMLLQFAYSNRNRFLYIIKLVFLWLLWPVTLACFVLAAV--
C3    FLAWIMLLQFAYSNRNRFLYIIKLVFLWLLWPVTLACFVLAAV--
C4    LTVLIVMLQYGNFKYSKILYGIKMAVLWLLWPCVIALSVTNAWAD
C5    LTVLIVMLQYGNFKYSKILYGIKMAVLWLLWPCVIALSVTNAWAD
C6    LLFITILLQWGYPSRCKPLWVVKMCILWLLWPLSIAAAVFAAV--
C7    LTVFLVVLQYGQYKYSVVLYVLKMLVLWLLWPLVLALSIFDAVVS
C8    LTVFLIVLQYGHYKYSVVLYSLKMMILWLLWPLVLALSIFDSWAS
C9    LTIFLIVLQYGQYKYSVVLYGLKMLILWLLWPLVLALSIFDSWAS
C10   LTIFLIVLQYGQYKYSVVLYGLKMLILWLLWPLVLALSIFDSWAS
C11   LLFITVLLQWGYPSRCKPIWVIKMFILWLLWPLSIAAAVFAAI--
C12   LLFVTILLQWGYPSRVKAIWVVKMFILWLLWPVSIAASVFAAV--
C13   LLFVTILLQWGYPSRVKAIWVVKMFILWLLWPVSIAASVFAAV--
C14   FLLITIVLQYGYPSRSMTVYVFKMFILWLLWPASMALSIFSAI--
C15   LLFVTILLQWGYPSRIKAIWVVKMFILWLLWPVSIAASVFAAV--
C16   FLAWIMLLQFAYSNRNRLLYIIKLVFLWLLWPVTLACFVLAAV--
C17   FLAWIMLLQFAYSNRNRLLYIIKLVFLWLLWPVTLACFVLAAV--
C18   FLLITIVLQYGYPSRSMTVYVFKMFVLWLLWPSSMALSIFSAV--
C19   FLLITIVLQYGYPSRSMTVYVFKMFVLWLLWPASMALSIFSAI--

con   :    ::**:.  .    :: .*: .******  :*  :  :   


C1    YRINWVTGGIAIAMACIVGLMWLSYFFASFRLFARTRSMWSFNPE
C2    YRINWVTGGIAIAMACIVGLMWLSYFVASFRLFARTRSMWSFNPE
C3    YRINWVTGGIAIAMACIVGLMWLSYFVASFRLFARTRSMWSFNPE
C4    FNVNWAYFGISIFMLVVTLVLWIMYFLNSFRLYRRTRSFWAFNPE
C5    FNVNWAYFGISIFMLVVTLVLWIMYFLNSFRLYRRTRSFWAFNPE
C6    YPINQVAFGFAIAFACISGLMWLCYFISSFRLLCRTGSAWSFMPE
C7    FGDNWTYFAFSILMACITFVLWIMYFANSFRLYRRTNSFWAFNPE
C8    FGVNWTFFAFSILMCCITFILWVMYFVNSFRLYRRTQTFWAFNPE
C9    FGVNWTFFAFSILMSCLTLILWMMYFINSFRLYRRTQTFWAFNPE
C10   FGVNWTFFAFSILMSCITLILWMMYFINSFRLYRRTQTFWAFNPE
C11   HPINSVSFGFAIAFACISGIMWLSYFISSFRLLCRTGSAWSFMPE
C12   YPINKVAFGFAIAFACITALMWLSYFVSSLRLLCRTGSWWAFMPE
C13   YPINKVAFGFAIAFACITALMWLSYFVSSLRLLCRTGSWWAFMPE
C14   YPISLASQIISGILAAACAGMWLAYFIQSIRLFMRTGSWWSFNPE
C15   YPINKVAFGFAIAFACITALMWLSYFVSSLRLLCRTGSWWAFMPE
C16   YRINWVTGGIAIAMACIVGLMWLSYFFASFRLFARTRSMWSFNPE
C17   YRINWVTGGIAIAMACIVGLMWLSYFVASFRLFARTRSMWSFNPE
C18   YPIDLASQIISGIIAGVSALMWISYFVQSIRLFMRTGSWWSFNPE
C19   YPVDLSTQIISGIIAFISACMWISYFVQSIRLFMRTGSWWSFNPE

con   .  .     ::  :      :*: **  *:**  ** : *:* **


C1    TNILLNVPLRGTIVTRPLMESELVIGAVIIRGHLRMAGHSLGR-C
C2    TNILLNVPLRGTIVTRPLMESELVIGAVIIRGHLRMAGHSLGR-C
C3    TNILLNVPLRGTIVTRPLMESELVIGAVIIRGHLRMAGHSLGR-C
C4    TDSIIVFSVYGTTYSIPVIQAPQGITFTILSGTLLVDGIKIATAV
C5    TDSIIVFSVYGTTYSIPVIQAPQGITFTILSGTLLVDGIKIATAV
C6    TDMLLNVPLLGRTVTRPILADSPAIQFLLVRGEIQFEGFKLGR-C
C7    TDAIITLSVLGRQVSIPIIVAPTGITLTCLNGTLLVEGIKVATGV
C8    TDAIMTLSVLGRQVSIPVIVAPTGITLTVLSGTLLMEGIKVATGV
C9    TDAIITLSVFGRQVSIPTIVAPTGITLTVLSGTLLVEGIKVATGV
C10   TDAIITLSVFGRQVSIPTIVAPTGITLTVLSGTLLVEGIKVATGV
C11   TDMLINIPLLGRTVTRPIIADSPAVQFLIIRGELRFDGFTLGR-C
C12   TNMLLNVPFIGRTVTRPILNDSAALQFFILRGQVQFEGFVLGK-C
C13   TNMLLNVPFIGRTVTRPILNDSAALQFFILRGQVQFEGFVLGK-C
C14   SNCLLNVPIGGTTVVRPLVEDSTSVTAVVNDGHLKMAGMHFGR-C
C15   TNMLLNVPFIGRTVTRPILNDSAALQFFVLRGQVQFDGFILGK-C
C16   TNILLNVPLRGTIVTRPLMESELVIGAVIIRGHLRMAGHSLGR-C
C17   TNILLNVPLRGTIVTRPLMESELVIGAVIIRGHLRMAGHSLGR-C
C18   TNCLLNVPLGGTTVVRPLVEDSTSVTAVVANGYLKMAGMHFGA-C
C19   TNCLLNVPIGGTTVVRPLVEDSTSVTAVVTNGYLKIAGMHFGQ-C

con   :: :: ... *     * :     :      * : . *  ..   


C1    DIKDLPKEITVATSR-TLSYYKLGASQRVGTDSGFAAYNRYRIGN
C2    DIKDLPKEITVATSR-TLSYYKLGASQRVGTDSGFAAYNRYRIGN
C3    DIKDLPKEITVATSR-TLSYYKLGASQRVGTDSGFAAYNRYRIGN
C4    RIDALPQYVTVAKATTTIVFHRVGKAVNERTQTGWLFFVRSGYGD
C5    RIDALPQYVTVAKATTTIVFHRVGKAVNERTQTGWLFFVRSGYGD
C6    DPGDMPDIVTVAKPA-SLHWYKKALTRNIGVKSAIIVYIKYKVGN
C7    QVSQLPTYITVAKPTTTIVYQRAGRSLNARSNTGWAFYVRSKNGD
C8    QVNQLPSYITVAKPTTTIIYQRAGRSLNTRSQTGWAFYVRSKNGD
C9    QVSQLPTYITVAKPSTTIVYQRAGRSLNTRSNTGWAFYVRSKNGD
C10   QVSQLPTYITVAKPSTTIVYQRAGRSLNTRSNTGWAFYVRSKNGD
C11   DPNDMPDIVTIARPN-SLHWYKRALTRNIGTRSAILVYIKYKVGN
C12   APTEMPEVVTVAKAG-SLVWYKKALTRTVGPKSGVVVYIKFKVGN
C13   APTEMPEVVTVAKAG-SLVWYKKALTRTVGPKSGVVVYIKFKVGN
C14   DYDRLPMEITVAKPS-VLIALKMVKRQSYGTNSGVAIFHRYKAGN
C15   APQEMPEVVTVAKAS-SLVWYKKALTRTVGPKSGVVVYIKFKVGN
C16   DIKDLPKEITVATSR-TLSYYKLGASQRVGTDSGFAAYNRYRIGN
C17   DIKDLPKEITVATSR-TLSYYKLGASQRVGTDSGFAAYNRYRIGN
C18   DYDRLPSEVTVAKPN-VLIALKMVKRQSYGTNSGVAIYHRYKAGN
C19   DYRSLPNEVTVAKPN-VLIALKMVKRQDYGTNSGVAIYHRYKAGN

con       :*  :*:* .   :   :          :.   : :   *:


C1    YKLNTDHSGS--NDNIALLVQ
C2    YKLNTDHAGS--NDNIALLVQ
C3    YKLNTDHAGS--NDNIALLVQ
C4    YAAHSTGTGQMTESEKLLHIA
C5    YAAHSTGTGQMTESEKLLHIA
C6    HRVQNTTEDG---ERLAMFVA
C7    YSAVTSGVESITEEEKVLHLV
C8    YSAVTSHSDSVTDEEKVLHLV
C9    YSAVASHSDSLTEDEKVLHLV
C10   YSAVASHSDSLTEDEKVLHLV
C11   HRVQNTTEDG---DRLAMFAA
C12   HRVQNANDDD---GQLAMFLA
C13   HRVQNANDDD---GQLAMFLA
C14   YRWPTIIQDE----ELALLRA
C15   HRVQNANDDD---GQLAMFLA
C16   YKLNTDHSGS--NDNIALLVQ
C17   YKLNTDHSGS--NDNIALLVQ
C18   YRSPPITADS----ELALLRA
C19   YRRPAIVPDA----ELALLRA

con   :             .  :