T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=65
*
BAD AVG GOOD
*
C1 : 48
C2 : 71
C3 : 65
C4 : 69
C5 : 68
C6 : 63
C7 : 67
C8 : 66
C9 : 66
C10 : 66
C11 : 66
C12 : 63
C13 : 68
C14 : 66
con : 65
C1 -----------M---------SEEIMVSILSILPPKSVMRFKCVR
C2 -----------MAG--CKL--PRVMVVQILSRMPPKSLMRFKCVH
C3 -----------MAEF-CKM--PEEMVVPILSRLLPKSLMRFKCIH
C4 -----------MVEF-CKI--SEEIVMQILSRTPPKSLMRFKCIQ
C5 -----------MSEF-SKF--PEEMALHILSRMPPKSLMRFKCVR
C6 -----------MANF-SKLYSSEDLVEQILSGLPPKSLMRFKCVC
C7 -----------MAELICKM--PEEMTLQFLSRLPPKSLMRFKCIH
C8 -----------MAEL-SKF--AEEIMVEIMSRLPPKSLMRFKCVR
C9 -----------MENF-SKL--SEEMVVRILSRLPPKSLIRFRCVR
C10 -----------MGKL-CKL--SEEMVGQFLSRLPPKALMRFKCIH
C11 -----------MMQS-SKL--AEEIVVQFMSRLPPKALMRFKCIR
C12 -----------MTEF-CKI--PEAMGLQILSRLPPKSLMRFKCVH
C13 MALEKDSEIAELTESGKNI--AQDVVEQILSTLPPKSLMRFKCVS
C14 ----------MTLEFGKTI--DEDVVEQILSTLPPKSLKRFQCVS
con . : ::* **:: **:*:
C1 KSWYSLINNSSFIAKHLSNTMCNK--HS---TSILCKSCVLRDIN
C2 KSWNSLISSRHVVAKHLQ--FHNHLSSS---TTILLRRPVIWRTE
C3 KSWHSLINSPQFISKHLH--FHNNLSSS---TTILLKRPVMRRTD
C4 KSWNSMINDPQFAAKHLH--FYNNP---SSSTAFLVKRPVILRSE
C5 KSWYVLINNPSFVAKHLYNSLHNK--QS---TCIFCKRYVFRDIA
C6 DLWCNLIKSPSFVAKHLSGSMR-A--SS---MPVLFKRPVPRDKE
C7 KSWYALINNPKFIDKHLH--LYNK-DSY---TCFLLKRSVVARTQ
C8 RSWNALINNPNFAAKHLASSKRTLL--SSSSTTIIFRHFLIADLN
C9 KLWYNVINSPNFVAKNLTTSKHNKFSSS---TCILAKHTVLKDSN
C10 KSWYNLITSPSFIAKNLSNSKNNKFAST---TRILFKRTVLKDIK
C11 KSWYNLINSPSFVAQNLSYSMNNKFTSS---TCILSKHTVLKDGN
C12 KSWHTLMKDPNFVAKHLSNSMHDNFCRT---TGVLFKRENFKDTG
C13 KWWYHLITSPRFVAKHLSISKHNR--PS---TCALIKSLVSNDAE
C14 NRWHALITTPRFVAKHLSISRHNN--LS---TSVLMKRKVHEDTN
con * ::. . ::* : :
C1 TDEK---------------EVVCSLISLSSNSNND-----EHH-I
C2 TKNE---------------EIVFSLLTLRNENNGD-----EDN-L
C3 TLNE---------------KIVCSFLNLHNANDGD-----EDN-L
C4 TSNE---------------NVVLSYLRLETYTNGD-----DED-L
C5 TKDV---------------ESVVSLITFSDDDVGDTN---HEHIS
C6 NNIM---DEKGVENDDDDVGTLLWSLNLCNEDDND-------YLL
C7 SIKE---------------EILFSFLYVPNDNDDE-----DSH-P
C8 PDEM---------------EMILSLYNFCNDFDG-----------
C9 IKDRNEILEVLRDNSIETKKILLSLCNLCNDNDGD-----DPN-L
C10 DKNE--IFYVLRDNNNDRRYIFLSLLDLCNDNDGD-----DQN-L
C11 ITDRNEILDILTYGNNDKQQILLSLLNLCNDHNGD-----DQE-L
C12 TAER-------------QSESLLSLINFCNANGDG-----EHD-I
C13 AQEP---------------EMVFSLLNFSYENDNNAGGALSTN-L
C14 SDET---------------QEFFSFLHFRNDEDNDVDGVHDEHSF
con . . .
C1 HSAV-EDIHIPLSFGVTTRGQFKGDEVL---LAVSIIGHCDGIIC
C2 DYDI-EDIHFPPSIGLKTRAQFIENPGP-TYECADIVGHCGGIIC
C3 HYDI-KDLEFQPSMGLNTRGQFIEIPNEYYYNCAYIIGQCDGIFC
C4 HFVV-EDIICPPFKGLKARGQFIELPRR--DDSVYIISHCDGIIF
C5 HSVI-QDIDLPLSMSGIPKNHLNEPELL---GAVYITGHCDGIIC
C6 STVL-EELNVPLPAPLKLKHS----------SDLTIAGHCDGIIC
C7 HCVV-EDIYFPTAMGLKTKGHNIELPGSYGGETIYILGHCDGIIC
C8 -CFL-EDIHFPHSMGLECRRKFHEPG-----STFGISCYCDGIIC
C9 NYVV-DDFTVPLPLGLLP-------------FSLEIAGHCDGIIC
C10 HSVV-DDLIVPLPFSICP-------------FSLQIAGHCDGLIC
C11 FSVIKDNFIVPFPFDKCS-------------LSLKIAGHCDGIIC
C12 HCLV-EDVTKGQFSGFEVL------------ESAWIIGHCHGIIC
C13 SSV--EDLTIPTRVV----------------ESLRIIGHCDGIVC
C14 LSSI-QEFHIPFSTGVKTWA-----------EALIIIGHCNGIIC
con .:. * * *:.
C1 LV-AS---------LNIVLWNPAIKEFKILPN-QCL---------
C2 LS-LY-------AAGDLVLYNPAIKEFKVIPE-PCLPRPRQFY--
C3 LT-LY-------AAKDLVLYNPAIKEFKFLPE-SCL---------
C4 LTL---------YTGDLFLYNPAIKEFKIILA-SCC---------
C5 LV-H----------GEIVLWNPAIKQFKILPK-PLL---------
C6 LKL---------FTGNVILCNPAMKEFKLLPK-SFLLLCNDDFDD
C7 LVYHS---------GGLVFYNPSIREFKIIPP-SCL---------
C8 LADYG-------QKPNIVLCNPAIKEFKLLSE-SQLALSSPT---
C9 LN-NS-------FLDDIVLCNPATKESKLLPK-SCLLLPPRHPND
C10 LV-NI-------VNEEVALCNPAIKEFKFLPR-SSLLLPRRHPED
C11 LV-NV---------EDVALCNPSIKEFNHLPK-SCLLLPPKNWDD
C12 LR-NA---------TKIILWNPAIREVKV-TS-PYV---------
C13 LAL-IDYQQRLAKPSQVCLWNPAIQQFKFLPEEPFLPDWSKVPHS
C14 LAQ--------AVSGEVIICNPAIHEYKLLPPSPYL---------
con * : : **: :: :
C1 ----------PNGTL---------NSMA-FGYDPKSKDYKFLNIV
C2 ----------FRCDA--------------FGYDPKSEDYILVNVA
C3 ----------QDKNI---------GSVG-FGYDPKSEDYILVSVV
C4 ----------HDCCW---------STVG-FGYDLKCKDYIILEIA
C5 ----------TNGIV---------NSIG-FGYDARSKDYKVFSFP
C6 LWS-------LSYELRYYT-----EQLG-FGYDPEGKDYKVLRFV
C7 ----------TESF----------SCVGGFGYDPKCKDYKVVNIV
C8 ----------FRKT----------AAVG-FGCDLMLKNYKVVRLI
C9 YDE-------IESDV---------NAVG-FGYDSKAQEYKVVRIV
C10 DDG-------IESDV---------NAVG-FGYDSKTQDYKIVRVI
C11 YENEDDYYEALESES---------NAVG-FGYDSKANVYKVVRIV
C12 ----------PDENL---------SDLG-IGYDPKSDTYKVVHIS
C13 RMVQEFAYLRPISLLNG-------ETMG-FGYDPKSKDYKVIDIG
C14 ----------PDSDWPYSAIFRFRDGLG-FGYDPNFNEYKIVNIG
con :* * . * .. .
C1 DPSE-ETLGE----HRIVYDFP-RIEVYTLSTDSWREMKTYSLET
C2 SYGE-NRYDD-----DRLVIEPLRAEMYTLGTNSWREINIHNLET
C3 SYGHGEQYYN----DDRLVIDPMRAEVYTMSTDCWREIKIHNLET
C4 CYGE-TNYND----PQRLVVDPPIAAVYTLGIDSWREIKTDHLQT
C5 THDE-DRSSE------RDFNYPPHVEVYSLSTDLWTEINADHLET
C6 IYDE-SCYWF-------------KAEVYTMDSNSWREIKTEYNNI
C7 PSGE-DSYDH----NQRLVIYPPRAEVYTLSTDSWRQIKIDYLET
C8 NSGW--RYRD----DQDTVIPHLYAEVYNLRTDSWKEIKIDGLLK
C9 S------FIT----G-VHKPLPSKAEVYTIGTNSWREIKDQ-T--
C10 T------YIT----G-IAYTLPSKAEVYTLSSHSWREIKID-K--
C11 Q------FTS----GYVFTSHPSRVEVYTLGANCWREIKADVL--
C12 YGTQ-EEYGD----GHILIDRP-KTEVYTLGTDSWRQIMTGCLET
C13 FSDS-KFYGDPECYGGHVIVYPPKAVVYTLQTDSWREIKTFSLER
C14 FPAP-ELSTP----DGYNIYNPPKAAVYTLGTDAWRKIKTDTLET
con :*.: . * ::
C1 ETTMFLCFTK-----LYFNGFCYWIGCEKQKDFMDYFDRDDEEW-
C2 ETTMFRPNHFQ----VYFKGNCYGLAEEIKKEFISSFDSLEEYY-
C3 ETTFFWPRHFQ----VYFKGNCYWLAHEKRKEFITLYDRLEEYY-
C4 EDTYFWPTAFD----LYSKGIFYLFGYEEKKEFLDDMERCEETN-
C5 ETTNLYPEFFQ----MYFKGIWYWTGSEQQKEFMVVYDSMDEEW-
C6 IQFVNWSSDQP----IYFNGICYWQVSGSRGEF------------
C7 ETTSFWPDIYQ----MCYKGVFYWLGHEQDKEYLCYYDRLSSPS-
C8 ENKIVVPDSNAQTKGLCSKGILYWCAMEEEKVLEVTCDGDDEQKE
C9 ESHVFWAASFK----LFLKGFYFWWA-----------SICPPEQ-
C10 ECHVFWTPSFE----IHFRGIYYWSA----------LTYPTPGA-
C11 VSTVCWSPSFE----MYFKGIYYWDA----------YSYLTPRQ-
C12 ETTHFWFQDFH----MYFNGFCYWNGREQLKEYQNFYDLQEEHH-
C13 ETSYLWPDTFQ----LYLKGVCYWLGYEQQKEFLCLFQTHQEEEE
C14 ETTILWPQIFQ----MHFKDMCFWLAPEQHKE-LDVLDEDEEQF-
con : .. :
C1 --VRQVIHSFDMSTEVFDHILLPNSLYLYEPLALYFNMHVILWNE
C2 --IREVIVWFNTSDRVFHSALTPDCLY----RYPAHDFNLTVWNN
C3 --IWEAIVCFDTANRIFHNILVPDCLY----EFPMHDLDLAVWHD
C4 ---KQVMILYDTRDELFHIAMLPDSFN--EPACGVHDIHVALLNK
C5 --VRQLIIVFDMNDEVFEDILFPYSLY--GPMIPYLEMRVIVWNE
C6 ------ILSFDMGNELFHEILNPDL----PDKCGVV--RLAVWKE
C7 --IRDVILLYDTGEEVFRTRLLPDSFK--DLGLHALSMSLTMWNG
C8 IDMHACIISFNVGDESFHVINIGSY----DDHCCLIDGVLGLWKE
C9 ----EIILSFDMNEELFHDIYIPESV---RHDIVRCNRGLAVWKE
C10 --DKEAIFAFDMSEETFEEIPIPDGICA-RDGIIKF---LAVWKE
C11 --YKDGILAFDMSDELFYLIYHPETTR-------EFNKSLAVWKE
C12 --IRPVIISFDMGDEVFHNMLLPDFVY--ETYMWSYVLRLMAWNE
C13 -RIARAIISFDTSDEVFHDIMLPHGLLEFYGFDNFLTLHLTEWNE
C14 --IREVIVMFDTGDELFHNIMLPDEFD--YPSKNYFVPNLLVWKD
con : :: . * : :
C1 SIALFGLYHWRSooooooooo-oooooooo-oooooooooooooo
C2 CVALFGYNRCGS--KPFEIWV-MGESDGFT-CSWIKHLSV--DIT
C3 SIALFGFYRGGS--RPFEIWV-MDNFDGLN-SSWVKQLSV--DIA
C4 SIALYGFSIFES-IHSIQIWV-TDDIRGAQEYSWTKYLSL-NPVD
C5 SVALFGQYRFGYADDAFGLWV-MDDI--VK-GSWTKQLTL-EVVV
C6 FISLFTYQEEIVVPPSYDMWVMMDDLGDGK-GSWTKYFTI-GPVE
C7 SIALFGFSYWGPDIESFKIWM-MDDF-----GSWTKHLTY-ETIM
C8 SIAL-CVRGW----TTLDIWV-MDDFGGGK-GSWTKYLAI-EPVV
C9 SIALLAY-GGDSGAQSFDIWV-IDDFGVFK-SSWIKYLTI-GPLE
C10 SVALISCIGDGP--KSFDIWV-MDDSSGIK-GSWTKHLVI-GPIE
C11 SIALITYEGDAP--KCFDLWL-NEDSSCFK-GLWTKYFTI-GPVE
C12 SVAIFGLDHGITSHESWGLWV-MDDFGGVT-GSWIKQFSFVSAVG
C13 SVALFSLLFEDE--HKATMWV-MDAK-----GAWTKQLTF-EYVD
C14 SVALLGIQISQF--SSYGIWV-IDEFGGHNGGAWTKHITFELPVE
con :::
C1 oooooo-----ooooooo--ooooooo-----ooooooooooooo
C2 ESPQPL-----VLWESNQ--SLLVSPR-----IRVALYSFATKTF
C3 KSPIPL-----ALWERNK--ILLVFTH-----TQIALYSFVTETY
C4 NVRRSL-----AFWKIDE--VLMIAKD-----GRVVLCNLLTGKL
C5 GTRMTL-----EMWKSDE--ILMVAND-----NRIFSYNIRTEEI
C6 GDKWPL-----LFWKGDQ--LLMESND-----GQIVLYNIGTQIL
C7 GIYLSL-----VLWRSDD--VLMVAND-----GRIVSYSLSRDRV
C8 KITSQFA----LFGKSDEQFVLVACDD-----SVVIFYDICTNKF
C9 GISIPL-----IFWKSNE--FLMAATD-----GRLVSYNLSTQMF
C10 -CEIPL-----VFWKSDE--LLLVISD-----GRVVSYHLGNKTI
C11 -VEIPL-----VFWKSNE--ILMVNAD-----KHIVSYNLDTQTL
C12 FLDTPL-----QIWKSDE--ILIVSKE-----RRVVSYNLDTEQY
C13 YFPYSLPRKILAFWKSNE--IFGVGEN-----GSIVCYNLNTKIV
C14 ----PL-----IFWKSDR--VLLNDPNDTDYRGLILDYNLDTKKL
con
C1 oooooooooooooooooooo--ooooooooooooooooooooooo
C2 KYLPLCA---AEHFDAIPFV--NSIVPLNRDLVSVNISooooooo
C3 QYLPLYG---ASFFRL--FL--MWIVooooooooooooooooooo
C4 KYFPIHGLHLGDDIQGIVCV--DSIVPLNGRELSRHooooooooo
C5 KYLPIEST-HPTFSAAIVCI--NSIVPVIHGRQQAoooooooooo
C6 KYLPIHFIRDLYYSQELVYV--NSIVSINGGNVLEDIHISAFYGN
C7 KYFPIQG--VWGTYQAFVCVNSNSIVSVKGGNKVESRDIQTSNVL
C8 NYLPLNGV-LLHHTQVVEYA--SSIVSVKECNKLDMEAooooooo
C9 KYLPIHGVEDPPYIQAVVYV--NSIVSVHASNKLEGINNSSoooo
C10 KYLPIHGVEDPQYIHAVVCV--NSMISVKKTKGoooooooooooo
C11 KCLPMHGVEDPEYIYAIIYV--SSIISVNRDNKLECTTTSIoooo
C12 KYLPIHSM-DSDYFEAVVYM--NSIVSVNGSKToooooooooooo
C13 KHLPIRS--VPDYF-------------------PPSRDTFYPFCC
C14 KNLPVQS--ERSDSSAIVYV--SSIVSVLGGSKPKNKDNSTPNVo
con
C1 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo--
C3 oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-
C4 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo------
C5 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo--
C6 GKFYSINKGDVIDISAFYGITSooooooooooooooooooooooo
C7 Looooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-----
C8 oooooooooooooooooooooooooooooooooooo---------
C9 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo--
C10 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11 oooooooooooooooooooooooooooooooooooooo-------
C12 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C13 IAYVNSVVPIMNHVREHI---------------------------
C14 oooooooooooooooooooooooooooooo---------------
con
C1 --
C2 --
C3 --
C4 --
C5 --
C6 --
C7 --
C8 --
C9 --
C10 --
C11 --
C12 oo
C13 --
C14 --
con