T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  92
C2    :  92
C3    :  90
C4    :  80
C5    :  91
C6    :  89
C7    :  92
C8    :  91
C9    :  80
C10   :  92
C11   :  91
C12   :  92
C13   :  92
C14   :  91
C15   :  71
C16   :  92
C17   :  80
C18   :  92
C19   :  91
C20   :  90
C21   :  91
C22   :  92
C23   :  92
C24   :  80
C25   :  80
C26   :  92
C27   :  92
C28   :  91
C29   :  91
C30   :  80
C31   :  91
C32   :  90
C33   :  91
C34   :  91
C35   :  92
C36   :  92
C37   :  92
C38   :  91
C39   :  91
C40   :  80
C41   :  92
C42   :  91
C43   :  92
C44   :  92
C45   :  91
C46   :  92
C47   :  91
C48   :  89
C49   :  90
C50   :  91
con   :  89

C1    MAGRNGDSDEDLLKTVRLIKFLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C2    MAGRSGDSDEDLLKAVRLIKFLYQSNPLPSPEG-TRQARRNRRRR
C3    MAGRSGDSDEDLLKAIRLIKILYQSNPLPSPEG-TRQARRNRRRR
C4    MAGRSGDNDEALLQAVRIIKILYQSNPLPTPEG-TRQARRNRRRR
C5    MAGRSGDNDEALLTVVRIIKLLYQSNPYPAPEG-SRQARRNRRRR
C6    MAGRSGDSDEALLQAVRTIKILYQSNPCPEPRG-TRQARKNRRRR
C7    MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKLLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C8    MAGRSRDEDEDLLRAVRIVKILYQSNPYPPPEG-TRQARKNRRRR
C9    MAGRSGDSDAALLQAVRIIKIIYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C10   MAGRSGDSEEELLNTVRLIKRLYQSNPPPSTEG-TRQARRNRRRR
C11   MAGRSGGTDEELIKAVKIIKILYRSNPFPSSEG-TRQARKNRRRR
C12   MAGRRGDSDEDLLRIIRLIKFLYQTNPPPNLEG-TRQARRNRRRR
C13   MAGRSGDSDVELLETVKLIKILYQSNPLPSPGG-TRQARRNRRRR
C14   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C15   MAGRS--EDDQLLQAIQIIKILYQSNPQPSPRG-SRNARKNRRRR
C16   MAGRSGDSDEELLKAVRLIKLLYQSNPPPRPQG-TRQARRNRRRR
C17   MAGRSGDSDEALLQAVRIIRILYQSNPYPEPRG-TRRARKNRRRR
C18   MAGRSGDSDEDLLKAVRLIKFLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C19   MAGRSGSTDEDLLKAVRIIKILYQSNPFPSSEG-TRQARKNRRRR
C20   MAGRSGDSDEQLLLAVKVIKILYQSNPYPKPHG-SRQARRNRRRR
C21   MAGRSGSTDEQLLQAVRIIKILYQSNPYPPPEG-TRQARRNRRRR
C22   MAGRSGDSDEDLLKAVRLIKLLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C23   MAGRSGNSDEDLLQTVRLIKFLYQSNPPPSSEG-TRQARRNRRRR
C24   MAGRSGDSDAALLQAVKIIKVLYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C25   MAGRSEENDDELLKAVRIIKILYQSNPYPEPRG-TRQARKNRRRR
C26   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPYPSSEG-TRQARKNRRRR
C27   MAGRSGDNDEDLLKTVRLIKDLYRDNPPPSQEG-TRQARRNRRRR
C28   MAGRSGSTDEELLKIVRLIKHLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C29   MAGRSGNADAGLLSAVRIIRILYQSNPYPSAEG-TRQARKNRRRR
C30   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNRYPKPEG-TRQAQRNRRRR
C31   MAGRSGSTDEELLRAVRTIRILYQSNPFPSSEG-TRQARRNRRRR
C32   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPFPSSEGTTRQTRRNRRRR
C33   MAGRSGSTDEELIQAVRIIKILYQSNPFPSSEG-TRQARKNRRRR
C34   MAGRSGDSDEELLRIIRTIKILYDSNPHPKPTG-SRQARKNRRRR
C35   MAGRSGDSDEDLLRTVRLIKFLYQSNPPPRSEG-TRQARRNRRRR
C36   MAGRSGDSDEGLLQVCKIIKILYQSNPYPERAE-TRQARRNRRRR
C37   MAGRSGDGDEELLRTVRLIKQLYQNNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C38   MAGRSGSTDEDLLRAVRIIKILYQSNPPPSSEG-TRQARKNRRRR
C39   MAGRSGSTDEALLRTIRIIKILYQSNPYPPPEG-TRQARKNRRRR
C40   MAGRSGDSDAALLQAVRTIKLLYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C41   MAGRSGDSEEELLKAVRLIKFLYQSNPPPSPAG-TRQARRNRGRR
C42   MAGRSGSTDEELIQAVRIIKILYQSNPYPKPRG-TRQARKNRRRR
C43   MAGRSGDSDEQLLLTVRLIKDLYQSNPPPSSEG-TRRARRNRRRR
C44   MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKFLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C45   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPFPPPEG-TRQARRNRRRR
C46   MAGRREDNDEDLLKAIRLIKFLYQTNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C47   MAGRSGDSDEELLRVVKIIKILYQSNPYPSPKG-SRQARKNRRRR
C48   MAGRSGDSDDQLLKTVRLIKILYQSNPSPKPEG-TRQARRNRRRR
C49   MAGRSGDSDEELLKVIRTIKILYQSNPYPKPTG-TRQARRNRRRR
C50   MAGRSGSTDEELLRAVRIVKILYQSNPYPSAEG-TRQARRNRRRR

con   ****    :  *:   : :: :*  *  *     :*.:::** **


C1    WRARQRQIRTISDWILSNHLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C2    WRARQRQIQAISERILAHYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDYNEDC
C3    WRARQRQINAIGERILSTYLGRLEEPVPLQLPPLERLTLNCDEDC
C4    WRARQRQINSISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLTIDCSESS
C5    WRARQRQINSISERILSTHVGRPAEPVPLPLPPLERLHLDCSENC
C6    WRARQNQIHKISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLHIGDSESS
C7    WRERQRHIRKISERILDTYLGRSEEPVPLPLPPLERLTLDCNEDC
C8    WRARQRHIREISERVLSACLGRPTEPVPLQLPPIERLCLNCSEDC
C9    WRARQRQIHSISERILSTCLGRPTEPVPFQLPPIERLHINCSEDG
C10   WRAKQKQIQLFSGWIIDTYLGRPEEPVPLHLPPLERLTLDCNEGC
C11   WRARQKQISALSERILSACLGRPPEPVPLQLPPLERLQLNCSEDC
C12   WRQRQRQIHSLSGWILNNHLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C13   WRARQRTIREISAWVLSTRLGRLTEPVPLQLPPLDRLTLDCNEDC
C14   WRARQRQIRAISERILSTCLGRPTEPVPLPLPPIERLRIDNNESG
C15   WRRRQAQVDTLAARVLATVVHGPQNNNIVDLPPLEQLSIRDPE--
C16   WRERDRTIREISERILATCLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C17   WRARQRQIHSISERILTTCLGRFTEPVPFQLPPIERLHIGDSESG
C18   WRERQRQIRSISDWILSTHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCHEGC
C19   WRARQKQIHTLSERILTTCLGGPPEPVPLQLPPLERLQLDCSEDC
C20   WRARQNQIDSIGERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLSLDCNEDC
C21   WRRKQRQIHSLSERILSSCLGRPAEPVPLQLPPLERLHLDCSEDS
C22   WREKQRQIRSISERILTTYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLNCSENC
C23   WRERQRQIRTISDWILSTHLGRPAEPVPLQLPPLERLSLDCNEDC
C24   WRARQRQIHSISERILSTCLGRSTEPVPFLLPPIENLHIGDSEGS
C25   WRARQSQIHSISERILSTYLGRSAEPVPLQLPPIERLHISDSESG
C26   WRARQRQVRALSERILSTCLGRSTEPVPLQLPPLEKLTLDCSKDC
C27   WRERQRHIQSISERILRTYLGRPVEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C28   WRERQRQIRTISTWLLSTHLGRPAEPVSFQLPPLERLSLDSSKDC
C29   WRARQRQISQISQRILSSCLGRSEEPVPLQLPPIERLRLDCSEDC
C30   WRARQRQIHSISERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLHIADSKGG
C31   WRARQRQIRAISERILASYLGRSTEPVPLQLPPLERLHLDCNEDS
C32   WRARQRQIREISERILSTCLGRSTEPVPLLLPPIERLHIDCSEDC
C33   WRARQRQIRAISERILTSYLGRPPEPVSLQLPPLERLQLDCSEDC
C34   WRARQRQIDSLSERILSTCLGRPAELVPLQLPPLERLHLDCSEDC
C35   WRARQRQIQAISTWILNDYLDRSAEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C36   WRARQRQIHSISERILHTCLAGPVEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C37   WRERQRQIDSISTWILSTHLGRPAEPVSFQLPPIERLTLDCSEDC
C38   WRARQRQICALSERILSTCVGRSTEPVSFPLPPLERLHLDCNEDC
C39   WRARQRQIHSISERILSSCLGRSAEPVPLQLPPLERLHLDSSEDG
C40   WRARQKQIHSISERILSACLGGSTEPVPLQLPPIERLHIGCSENS
C41   WRQRQRQIRSLSGWILSNYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C42   WRARQRQIDSISERILSTCLGRSAEPVALQLPPLERLRLDCSEDS
C43   WRERQRQIRAISDRILGTYLGRSSEPVPLQLPPLERLTLDCSEDL
C44   WRERQRQIRKISGWILNTYLGRSEEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C45   WRARQRQIRAISERILSTCVGRPTEPVPLQLPPLERLSLKCSEDC
C46   WRARQRQINSIGERIICTYLGRSAEPVPLQLPPLERLNLNSSEDC
C47   WRARQRQIDSISERILGTCLGRPAEPVPFQLPPIERLHIDCSEDC
C48   WRERQRQIRAISDRILSTYLGRPEEPVPLQLPPLERLHINCSEDC
C49   WRARQRQIRGISERILGDYLGRPAEPVPLQLPPLERLHINCSEDC
C50   WRARQRQISALSERILSACLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCSESC

con   ** ::  :  :.  ::   :    :   . ***::.* :   :  


C1    GTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooo
C2    GSSGTQ-------GVGSPHVLVESPAVLDSGTKEoooooooo
C3    GTSGTQ-------GVGSHQISVESPAILDPRTEEoooooooo
C4    GTSGTQQ------SQGNTEGVGNPooooooooooooooooo-
C5    GTCGTQQSQGVETGVGRPQISVESPGILESGTENo-------
C6    GTSGAQ-------QLGSPEISGKPCAVLGSGAEKEooooooo
C7    GTSGTQ-------GVGSPQILVESPTILESGTKEoooooooo
C8    GTSGTQQSQGTETGVGSSQIPGEHPFILGSGDKEo-------
C9    GTSGTQQ------SPGTAEGVGSPooooooooooooooooo-
C10   GTSGTQ-------GVGSPQVLVESPAVLESGTKEoooooooo
C11   GTSGTQQSQGTETGVGRSQISGEPSVILGSGTKNo-------
C12   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLESGAEEoooooooo
C13   GTSGTQ-------GVGDPQILVESPAVLESGTKEoooooooo
C14   GTAGTE-------GVGSSQVSGRSCAVLGSGTKEEooooooo
C15   ---GDQLSEAWTVDPRAEDNoooooooooooooooooooooo
C16   GTSGTP-------GVGTPQVLLESPAILESGTKEoooooooo
C17   GTSGTQQ------SQGTTEGVGNPooooooooooooooooo-
C18   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLEPGTKEoooooooo
C19   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGEPSVILASGTKNo-------
C20   GDSGTQ-------GVENPQVPGESDMLLGTGTKEoooooooo
C21   RTPGTQQPPGTEIGVGRPQISVESPGVLGSGTKNo-------
C22   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPPVLETGTKEoooooooo
C23   GTSGTQ-------GVGSPQVSVESPTVLDSGTKEoooooooo
C24   GTSGTQQ------SQGTTEGLGSPooooooooooooooooo-
C25   GTSGTQQ------SQGTTEGVGSPooooooooooooooooo-
C26   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLDSGTKEoooooooo
C27   GTSGTQ-------GVGRPEILVESPTILESGTKEoooooooo
C28   GTSGTQ-------GVGSSQVLVEPPTVLESGTKEEooooooo
C29   GTSGTQQSQGTETGVGSPQISGESSIILGSGTKEo-------
C30   GTSGIQQ------PQGTTEGVGSPooooooooooooooooo-
C31   GTSGTLQSQGTETGVGRPQISGESSVILGTGTKNo-------
C32   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSVILGPGAKN--------
C33   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGEPSVILGSRTKNo-------
C34   GTSGTQQSQGVETGVGRPQVSVESPVILGSGTKNo-------
C35   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPTILESGTKEoooooooo
C36   GTSGEK-------GVGSPQISVEPPAVLGTGAKEoooooooo
C37   GTSGTQ-------GVGSSQVFVESPPVLESGNKEEooooooo
C38   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGEPSVILGPGTKNo-------
C39   ETSGPQQSQGTETGVGGPQIFVESSVVLGSGAKEo-------
C40   GTSGTQQ------SQGTTEGVGSSooooooooooooooooo-
C41   GESGTP-------GEGNPQILVESPAILESGAKEoooooooo
C42   GTSGTQQSQGAETGVGRPQVSGESSVILGSGTESo-------
C43   GTSGSQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooo
C44   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPSVLESGAKEoooooooo
C45   GTSGTQQPQGTETGVGRPQISGESSVVLGTGTKNo-------
C46   EPSGTQ-------GVGNPQVPVEPPAVLESGTEEoooooooo
C47   GTSGAQQSQGTETGVGRPQVSGESSIILGSGTKNo-------
C48   GQ-GTEG------GLGSPQVSGESHAVLESGTKEoooooooo
C49   GQGTEE-------GVGSPQTSGESRALLESGTKEoooooooo
C50   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESPVVLDPGTKNo-------

con                     .