T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  91
C2    :  90
C3    :  86
C4    :  88
C5    :  88
C6    :  89
C7    :  90
C8    :  93
C9    :  93
C10   :  93
C11   :  86
C12   :  91
C13   :  93
C14   :  90
C15   :  92
C16   :  93
C17   :  93
C18   :  90
C19   :  93
C20   :  93
C21   :  93
C22   :  91
C23   :  93
C24   :  93
C25   :  87
C26   :  93
C27   :  93
C28   :  89
C29   :  85
C30   :  92
C31   :  89
C32   :  89
C33   :  93
C34   :  93
C35   :  90
C36   :  93
C37   :  93
C38   :  93
C39   :  90
C40   :  93
C41   :  93
C42   :  89
C43   :  87
C44   :  93
C45   :  93
C46   :  89
C47   :  90
C48   :  93
C49   :  92
C50   :  93
con   :  91

C1    -MQPI-----QILAIVALVVAAIIAIVVWSIVFIEYRKIKRQRKI
C2    -MVDLLAKVDYRIVIVAFIVALIIAIVVWTIAYIEYRKLLRQRRI
C3    -MVDL----DYKLTAGAFIVALFIAIVVWTIVYIEYRKLVRQKKI
C4    -MQSL-----EIIAIIALVVAAILAIVVWSIVLIEYRKIWRQRKI
C5    -MQPL-----AILAIAALVVAAILAIVVWTIVGIEYRKILRQRKI
C6    -MTPL-----EISAIVGLIVALILAIVVWTIVALEYKKILRQRKI
C7    -MTPL-----EISAIAGLIVALILAIVVWTIVAIEYKKIQKERKI
C8    -MQPL-----VILAIVALVVVAIIAIVVWTIVFIEYRKILRQRKI
C9    -MQSL-----EIGAIVALVLVGIIAIVVWTIVLIEYRKILRQRKI
C10   -MQSL-----EIVSIVALVVATIIAIVVWSIVFIEYRKILRQRRI
C11   MLSPL-----HIGAIVGLVVALILAIVVWTIVGIEYKRILRQRKI
C12   -MSYW-----LAISLVALIVALIIAIVVWTIVYIEYKKLVRQRKI
C13   -MIPL-----QIAGIVALIVAAIIVIIVWTIVFIEYRKLLKQKKI
C14   -MSDFLEKIDYRLAIGALIVALIIAIIVWTIAYIEYRKLVKQRKI
C15   -MTPL-----EISAIAGLIVALILAIVVWTIVAIEFRKIQKQRKI
C16   -MQSL-----QIIAIVALVVAVIIAIVVWTIVFIEYRKILKQKKI
C17   -MQPL-----QIVAIVGLVVAAIAAIVVWSIVFIEYRKILRQRKI
C18   -MQDL-----QIVAIVALVIAAILAIAVWTIVLLQYRKLLRQRRI
C19   -MQSL-----VILAIVALVVAAILAIVVWTIVFLEYRKILRQRKI
C20   -MTPL-----EISAIVGLIVALILAIVVWTIVAIEFRRILRQRKI
C21   -MQPL-----HISAVVGLVVALILAIVVWTIVIIEYRKILRQRKI
C22   -MSYM-----LIVLIVALVVALILAIVVWTIVYIEYKKIVRQRRI
C23   -MPPL-----HIIAIVALVVAAIIAIVVWTIVLLEYRKILRQRKI
C24   -MQPL-----EISAIVALVVAAILAIVVWTIVYIEYRKILRQRRI
C25   -MLPLL----HIFAIVGLIVALIIAIVVWTIVGIEYKKLLKQRRI
C26   -MQSL-----QIAAIVGLIVAFIAAIVVWTIVYIEYRKIRKQKKI
C27   -MQSL-----HIVAIVALVVAAILAIVVWTIVFIEYRKILRQRKI
C28   -MQSV-----QILAIVALVVVAIIAVVVWTIVLIEYRKILRQRKI
C29   -MQSL-----YIVAIVALVVAAIIAIIVWTIVIIEYRKILRQRRI
C30   -MNDL-----IVVSIVALIVAFIIAVVVWTIVFIEYRKLRKQKKI
C31   -MQAL-----VILAIVALVIVSIIAIVVWTIVFIECRRLRRQRKI
C32   -MLAL-----QILAIVALVVVAIIAIVVWTIVLIEYRKILRQRKI
C33   -MQSL-----EIAAIVGLVVAFIAAIAVWTIVYIEYRKILRQKRI
C34   -MQTL-----EIVSIVGLVVAFIAAVVVWTIAGIEYRKWLRQKKI
C35   -MTPL-----EISAIAGLIVALILAIVVWTIVAIEYKKIQKERKI
C36   -MQSL-----QIAAIVALVIVGIIAIVVWTIVFLEYRKILRQRRI
C37   -MQSL-----VILAIVALVVAIILAIVVWSIVFIEYRKILRQKKI
C38   -MQSL-----QILAVVALVVGAILAIVVWTIAVIEYRRIRKQRKI
C39   -MNAL-----EIASIVGLIVAFILAVVVWTIVFIEYKKILRQRRI
C40   -MTPL-----EISAIVGLIVALILAIVVWTIVLVEYRKILKQRKI
C41   -MLAL-----SILAIVALVVAAIIAIVVWTIVLIEYKKLLRQKRI
C42   -MSELLAQVDYRLGVGALIVALIIAIVVWIIAYLEYRKLLKQRKI
C43   -MQSL-----EIAAIVGLVGTAIIAIIVWSIVIIEYRKILRQRKI
C44   -MIPL-----YTLTIVALVLVAIIAIVVWSIVIIEYRKILRQRKI
C45   -MQTI-----QILAIVALVVAAVIAIVVWTIVLIEYRKILRQRKI
C46   -MTPL-----IICAIVALVVVFIIAIVVWTIVGIEYRRLRKQRKI
C47   -MLNLSARVDYRLGIGALIVALIIAIIVWTIVYIEYRKLVRQSRI
C48   -MQSL-----QIVAILALVVVAIIAIVVWSIVIIEYRRILRQRRI
C49   -MTPL-----EISAIVGLIVALILAIVVWTIVLIEYRKILKQRKI
C50   -MQSL-----EIAAIVALVVAIIIAIVVWTIVLIEYKKILRQRKI

con    :              .::   . .: ** *. :: ::  :: :*


C1    DRLIDRITERAEDSGNESEGDQEELSALV----VEM---GHHAPW
C2    DRLIKRTRERAEDSGNESDGDTEELSTM-----VDM---GNLRLL
C3    DWLIERIRERAEDSGNESEGDTEELSTM-----VDM---GRLRLL
C4    DRLIDRIRERAEDSGNESDGDQEELSALVETGHLEM---GHHAPW
C5    NRLLDRIAERAEDSGNESEGDQEELSALVERGHLEM---GHHAPW
C6    DRLIKRIGERAEDSGNESEGDMDDLAKL-----VEM---GDFDHW
C7    DKLIKRIRERAEDSGNESEGDTEELAQL-----VDM---GDFDHW
C8    DRLIDRIRERAEDSGNESEGDQEELSAL-----MEM---GHHAPW
C9    DRLIDRIRERAEDSGNESDGDQEELLAL-----VEV---GHDAPW
C10   DRLIDRIRERAEDSGNESGGDQEELSAL-----VEM---GHDAPW
C11   DRLISRISERAEDSGNESDGDTDELSKL-----VEM---GNYGLG
C12   NRLYKRIRERAEDSGNESEGDVEELAAL-----GEM---GPFIPG
C13   DRLIDRIRERAEDSGNESEGDTEELARL-----VEM---GPHDQW
C14   DWLIKRIRERAEDSGNESEGDTEELSTM-----VDM---GHLRLL
C15   DRLVKRIRERAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GDFDPW
C16   DRLIDRIKERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VEM---GHHAPW
C17   DRLIDRIRERAEDSGNESDGDQEELSAL-----VER---GHLAPW
C18   DRLIDRIRERAEDSGNESEGDQEELSALV----LEM---GHDAPW
C19   DRLIDRIAERAEDSGNESEGDHEELSAL-----MEM---GYNAPW
C20   DRLIKRIRERAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GDFDPW
C21   DRIIKRIAERAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GNFNPW
C22   NSLYERLIERAEDSGNESEGDAEELAGL-----GEV---GPFIPG
C23   DRLIDRIAERAEDSGNESEGDQEELAKL-----VEM---GHHAPW
C24   DRLLERIRKRAEDSGNESEGDQEEISAL-----VGM---GHLAPW
C25   DRLIEKIRERAEDSGNESDGDTEELSTL-----IEM---GNYDLG
C26   EKLLDRIRERAEDSGNESDGDTEELHTL-----VEV---GDDIPW
C27   DRLLDRISERAEDSGNESEGDQEELAAL-----MEM---GHHAPW
C28   DRLINRIIERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VEMG--GHDAPW
C29   DRLIDRIRERAEDSGNESEGDQEQLL-------MEM---GHYAPG
C30   EKLLERISERAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GNFDPW
C31   DWLIERISERAEDSGNESEGDAEELSKF-----VGM---GNYDLG
C32   DRIIDRIRERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VEMG--GNDAPW
C33   DRLIDRIRERAEDSGNESEGDQEELAGL-----VDM---GHHAPW
C34   DRLINRIRDRAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GPHDLW
C35   EKLLKRIGERAEDSGNESEGDTDELAQL-----VDM---GDFDHW
C36   DRLIDRIRERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VER---GHDAPW
C37   DRLLERISERAEDSGNDSDGDQEELSAL-----VEM---GHHAPW
C38   DCIIDRIRERAEDSGNESEGDREELSKL-----VEM---GYPAPW
C39   DRLIKRISERAEDSGNESDGDTEELSAL-----VEM---GNHNLG
C40   DKLVNRIIERAEDSGNESEGDTDELSKL-----VEM---GNFDPW
C41   DRLIDRIRERAEDSGNESDGDQEELSAF-----MEM---GHDAPW
C42   DWLIKRIRERAEDSGNESDGDTEELSTM-----VDM---GNLRLL
C43   DKIIDRIRERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VEMEHHAHHAPW
C44   DSLLERIIERAEDSGNESDGDQEELSAL-----VER---GHLAPW
C45   DRLIDRIAERAEDSGNESEGDQEELSAL-----VEM---GHDAPW
C46   DRLIERISERAEDSGNESEGDEEELSKL-----MEG---GNLALL
C47   DWLVKRIRERAEDSGNESDGDTEELSTM-----VDM---GHLRLL
C48   DRLIDRIAERAEDSGNESDGDQEELSAL-----VEM---GHHAPW
C49   DRLIERIRERAEDSGNESEGDTDELAKL-----VEM---GDFDPW
C50   DKLLERIRERAEDSGNDSDGDQEELSAL-----VER---GHLAPW

con   : : .:  .*******:* ** :::                  


C1    DVDDLoooo---
C2    DVNDL-------
C3    DVNDLoooo---
C4    DVDEL-------
C5    DVNDL-------
C6    VGDNoooooo--
C7    VGDNVooooo--
C8    DVDDLooooo--
C9    DVDDLooooo--
C10   DINDLooooo--
C11   NDNNLoooo---
C12   NIDNLooooo--
C13   NVNDLooooo--
C14   DANDL-------
C15   VGDNLooooo--
C16   DVNDLooooo--
C17   DVNDLooooo--
C18   DVNDQoooo---
C19   NVDDMooooo--
C20   VGDDLooooo--
C21   VGDNLooooo--
C22   NINNLooooo--
C23   DVDDLooooo--
C24   DVNDLooooo--
C25   DDNNLLooo---
C26   NANNLooooo--
C27   NVDDLooooo--
C28   DVDDLoooo---
C29   DIDDLooooooo
C30   VGDNLooooo--
C31   DDNNLooooo--
C32   DVDDLoooo---
C33   DVDDLooooo--
C34   NVDDLooooo--
C35   VGDNVooooo--
C36   VVDDLooooo--
C37   DVNDLooooo--
C38   DIDDMooooo--
C39   FVNDLooooo--
C40   VGDNLooooo--
C41   NVDDLooooo--
C42   DAIoo-------
C43   DINDLoo-----
C44   NVNDLooooo--
C45   PVNDLooooo--
C46   DNNNVooooo--
C47   DANDL-------
C48   DINDLooooo--
C49   VGDNVooooo--
C50   DVNDLooooo--

con