T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  99
C2    :  99
C3    :  99
C4    :  99
C5    :  99
C6    :  99
C7    :  99
C8    :  99
C9    :  99
C10   :  94
C11   :  99
C12   :  99
C13   :  99
C14   :  99
C15   :  99
C16   :  99
C17   :  99
C18   :  99
C19   :  96
C20   :  99
C21   :  99
C22   :  99
C23   :  99
C24   :  99
C25   :  99
C26   :  99
C27   :  99
C28   :  99
C29   :  99
C30   :  99
C31   :  99
C32   :  99
C33   :  99
C34   :  99
C35   :  99
C36   :  99
C37   :  99
C38   :  99
C39   :  99
C40   :  99
C41   :  99
C42   :  99
C43   :  91
C44   :  99
C45   :  99
C46   :  92
C47   :  99
C48   :  99
C49   :  99
C50   :  99
con   :  99

C1    MEQAPPDQGPQREPYNEWTLELLEDLKNEAVRHFPRPWLHSLGQY
C2    MERAPEDQGPQREPHNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQY
C3    MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRTWLHGLGQY
C4    MEQPPEDQGPQREPHNEWTLELLEELKQEAVRHFPRPWLQGLGLY
C5    MEQPPEDQGPQREPYNEWTLEILEELKQEAVRHFPRPWLHNLGQH
C6    MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQY
C7    MEQAPENQGPQREPYNEWALEILEELKQEAVRHFPRPWLHGLGQY
C8    MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKTEAVRHFPRPWLHSLGQY
C9    MEQAPEDQGPQREPYNEWALELLEELKNEAVRHFPRVWLHSLGQH
C10   MEQAPEDQGPQREPNNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQH
C11   MERAPEDQGPQREPFNEWTIELLEELKSEAVRHFPRPWLHNLGQY
C12   MEQVPQDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRIWLHSLGQY
C13   MEQAPEDQGPQREPHNEWTLELLEEIKQEAVRHFPGPWLHGLGQY
C14   MEQAPEDQGPQREPYNEWMLELLEELKHEAVRHFPRPWLHGLGQI
C15   MEQAPEDQGPPREPYHEWTLELLEELKSEAVRHCPRLWLHSLGQY
C16   MEQPPEDQGPQREPYNEWTLEMLEELKQEAVRHFPRPWLHSLGQH
C17   MEQPPEDQGPQREPYNEWALEILEELKQEAVRHFPRPWLHNLGQH
C18   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKQEAVRHFPRPWLHNLGQH
C19   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRVWLHGLGQH
C20   MEQAPEDQGPQREPYNEWALELLEELKHEAVRHFPRPWLHGLGQY
C21   MEQPPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKQEAVRHFPRPWLHGLGQY
C22   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRVWLHGLGQY
C23   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRVWLHGLGQH
C24   MEQAPQDQGPQREPYNEWTLELLEELKREAVRHFPRVWLHSLGQY
C25   MEQAPEDQGPQREPFNEWTLELLEELKSEAVRHFPRPWLHGLGQY
C26   MEQAPEDQGPQREPHNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQI
C27   MEQTPEDQGPQREPYSAWTLELLEELKREAVRHFPRPWLQGLGQY
C28   MEQPPEDQGPQREPHNEWTLEILEELKQEAVRHFPRPWLHSLGQY
C29   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRIWLHGLGQY
C30   MEQPPEDQGPQREPYTEWTLELLEELKQEAVRHFPRPWLHGLGQY
C31   MEQTPEDQGPQREPYNEWALELLEELKQEAVRHFPRPWLHSLGQH
C32   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRPWLHSLGQH
C33   MEQTPEDQGPQREPHNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHSLGQH
C34   MEQIPEDQGPQREPFNGWTLELLEELKSEAVRHFPRVWLQGLGQY
C35   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRVWLHGLGQH
C36   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRVWLHGLGQH
C37   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQY
C38   MEQAPEDQGPQREPYNEWALEILEELKQEAVRHFPRLWLHSLGQH
C39   MEQAPEDQGPQREPRNEWALELLEELKNEAVRHFPRQWLHGLGQH
C40   MEQAPEDQGSQRVPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRPWLHGLGQY
C41   MEQSPEDQGPQREPYTEWTLEILEELKQEAVRHFPRLWLHNLGQH
C42   MEQAPEDQGPQREPYNEWALELLEELKQEAVRHFPRPWLHSIGQY
C43   MEQAPGDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVRHFPRTWLHSLGQY
C44   MEQPPEDQGPQREPYNEWALEILEELKQEAVRHFPRIWLHNLGQY
C45   MEQAPEDQGPQREPFNEWTLELLEELKHEAVRHFPRPWLHGLGQH
C46   MEQVPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKNEAVKHFPRVWLHSLGQY
C47   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRIWLHSLGQY
C48   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEEFKNEAVRHFPRTWLHSLGQY
C49   MEQAPEDQGPQREPYNEWTLELLEELKSEAVRHFPRPWLHSLGQY
C50   MEQPPEDQGPQREPYNEWALEILEDLKQEAVRHFPRLWLHSVGQY

con   **: * :**. * *   * :*:**::* ***:* *  **:.:*  


C1    IYETYGDTWTGVEAIIRTLQQMLFIHFRMGCHHSRIGI-MR--QR
C2    VYNNYGDTWEGVEAIIRMLQQLLFVHFRIGCQHSRIGI-IP--GR
C3    IYETYGDTWAGVEALIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LH--RR
C4    VYETYGDTWAGVEAIIRLLQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LR--QR
C5    IYETYGDTWTGVEALIRILQQLLFVHFRIGCQHSRIGI-LQ--QR
C6    IYNTYGDTWEGVEAIIRTLQQLLFVHFRIGCQHSRIGI-LP--GR
C7    IYETYGDTWTGVEVIIKILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-IR--HR
C8    IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TL--RR
C9    IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TR--RR
C10   IYETYGDTWEGVEAIIRILQQLLFVHFRIGCHHSRIGI-IR-GRR
C11   IYETYGDTWAGVEALVRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-SP--QR
C12   VYETYGDTWAGVEAIIRMLQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TP--QR
C13   IYETYGDTWAGVEALIRILQQLLFIHFRIGCHHSRIGI-LR--QR
C14   IYNTYGDTWTGVEAIIRILQQLLFVHFRIGCQHSRIGL-IR--GR
C15   IYETYGDTWAGVEALIRMLQQLIFIHFRIGCQHSRIGI-TP--RR
C16   IYETYGDTWAGVEALLRILQQLLFIHFRIGCLHSRIGI-MR--QR
C17   IYETYGDTWTGVEALIRTLQQLLFVHFRVGCHHSRIGI-WR--QR
C18   IYETYGDTWIRVEAIIRILQQLLFTHFRIGCPHSRIGI-TR--RG
C19   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCRHGRIGITIR--QR
C20   IYETYGDTWAGVEAIVRILQQLLFIHYRIGCQHSRIGI-TR--QR
C21   IYETYGDTWTGVETLMRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LQ--QR
C22   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LR--QR
C23   IYNTYGDTWEGVEAIIRILQQLLFIHYRIGCQHSRIGI-TP--SR
C24   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQILFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C25   IYETYGDTWAGVQAIVRILQHLLFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C26   IYNNYGDTWEGVEAIIRILQQLLFVHYRIGCQHSRIGI-VP--GR
C27   IYETYEDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCRHSRIGI-LR--QR
C28   IYETYGDTWAGVEALIRTLQQLMFIHFRIGCQHSRIGI-LQ--RR
C29   IYETYGDTWEGVEAIIRTLQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C30   IYETYGDTWTGVEILIRILQQLLLIHFRIGYQHSRIGI-LQ--QR
C31   IYNTYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LR--QR
C32   IYETYGDTWTGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCHHSRIGI-IR--QR
C33   IYDTYGDTWEGVEAIIRILQQLIFVHFRIGCQHSRIGI-IP--GR
C34   IYETYGDTWTGVQAIIRMLQQLLFIHYRIGCHHSRIGI-QQ--RR
C35   IYETYGDTWTGVVAIIRILQQILFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C36   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCRHSRIGI-TL--QR
C37   IYNNYGDTWEGVEAIIRTLQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C38   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LP--QR
C39   IYHTYGDTWEGVEAMIRTLQQLLFVHFRIGCQHSRIGI-IP--GR
C40   IYATYGDTWEGVEAIIRTLQQLLFVHFRVGCQHSRIGI-IP--GR
C41   IYETYGDTWTGVEALIRMLQQLLFIHFRIGCNHSRIGI-VR--QR
C42   IYETYGDTWTGVEAILRILQQLLFIHFRIGCHHSRIGV-LR--QR
C43   IYETYGDTWAGVEALIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-IPRGRT
C44   IYGTYGDTWTGVEALIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LQ--QR
C45   IYETYGDTWAGVEAIIRTLQQLMFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C46   IYETYGDTWAGVEAIIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-T----R
C47   IYETYGDTWAGVEALIRILQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-TR--QR
C48   IYETYGDTWTGVEAIIRILQQLLFIHYRIGCHHSRIGI-IR--MR
C49   IYNTYGDTWAGVEAIVRILQQLLFIHFRIGCRHSRIGI-IQ--QR
C50   IYNTYGDTWTGVEAMIRTLQQLLFIHFRIGCQHSRIGI-LR--QR

con   :* .* ***  *  ::: **:::: *:*:*  *.***:       


C1    RARNGASRSoo--
C2    RGRNGAGRSoo--
C3    IRRNGPSRPoo--
C4    RTRNGASRSoo--
C5    RARNGANRSoo--
C6    RGRNGAGRSoo--
C7    RARNGANRSoo--
C8    RARNGAGRSoo--
C9    RARNGASRPoo--
C10   RVRDGSGRSo---
C11   RARNGASRSoo--
C12   RTRNGSSRSoo--
C13   RARNGANRSoo--
C14   RGRNGSGRSoo--
C15   RARNGASRSoo--
C16   RARNGASRSoo--
C17   RTRNGASRSoo--
C18   RARNGASRSoo--
C19   RTRNGASRSo---
C20   RARNGSSRSoo--
C21   RTRNGARRSoo--
C22   RIRNGSNRSoo--
C23   GVRNGASRSoo--
C24   RARNGSSRSoo--
C25   RARNGASRSoo--
C26   RGRNGAGRSoo--
C27   RARNGASRSoo--
C28   RARNGASRSoo--
C29   RARNGASRSoo--
C30   RARNGARRSoo--
C31   RTRNGASRSoo--
C32   RVRNGSSRPoo--
C33   RGRNGAGRSoo--
C34   RTRNGTSRSoo--
C35   RSRNGASRPoo--
C36   RARGGSSRSoo--
C37   RARNGASRSoo--
C38   RARNGASRSoo--
C39   RGRNGAGRSoo--
C40   RGRNGASRSoo--
C41   RARNGASRSoo--
C42   RARNGASRSoo--
C43   RARNGASRS----
C44   RARNGASRSoo--
C45   RARNGSSRPoo--
C46   RARNGARRSoooo
C47   RARNGSSRSoo--
C48   RGRDGSGRSoo--
C49   RTRNGTSRSoo--
C50   RARNGASRSoo--

con     *.*. *.