T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=88
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  90
C2    :  80
C3    :  87
C4    :  89
C5    :  86
C6    :  85
C7    :  89
C8    :  89
C9    :  88
C10   :  84
C11   :  89
C12   :  90
C13   :  88
C14   :  88
C15   :  89
C16   :  77
C17   :  89
C18   :  90
C19   :  89
C20   :  88
C21   :  90
C22   :  89
C23   :  88
C24   :  90
C25   :  90
C26   :  89
C27   :  90
C28   :  89
C29   :  88
C30   :  90
C31   :  85
C32   :  90
C33   :  90
C34   :  89
C35   :  90
C36   :  89
C37   :  90
C38   :  90
C39   :  90
C40   :  89
C41   :  89
C42   :  84
C43   :  87
C44   :  88
C45   :  89
C46   :  90
C47   :  89
C48   :  90
C49   :  78
C50   :  85
con   :  88

C1    MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKSLYQSNPPPSSEGT-RKARRNRRRR
C2    MAGRSGSSDEELLNAIRIIKILYQSNPYPKPKGS-RQARKNRRRR
C3    MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPFPSSEGT-RQTRKNRRRR
C4    MAGRSGDGDEELLKTVRLIKQLYQSNPPPSSEGT-RQARRNRRRR
C5    MAGRSGDSDEALLQAVKIIKILYQSNPYPKPEGT-RQARKNRRRR
C6    MAGRSGDSDEQLLLAVKVIKILYQSNPYPKPHGS-RQARRNRRRR
C7    MAGRSGDHDDELLKTVRIIKFLYQSNPPPSQEGT-RQARRNRRRR
C8    MAGRSGNSDEDLLKAIRLIKFLYQSNPPPSPEGT-RQARRNRRRR
C9    MAGRSGSTDEELLRAVRIIRILYESNPFPSPEGN-RQTRKNRRRR
C10   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPKPEGT-RQARKNRRRR
C11   MAGRSGDSDKKLLTAIRIIKILYQSNPYPKPRGT-RQARKNRRRR
C12   MAGRREDSDEELLKAVRIIKILYQSNPLPSPEGT-RQARRNRRRR
C13   MAGRSGDSDEALLQAIRIIKILYQSNPYPKPEGT-RQARRNRRRR
C14   MAGRSGDSDEDLLKAIRLIKFLYQSNPLPSPEGT-RQARRNRRRR
C15   MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKSLYQSNPPPSTEGT-RQARRNRRRR
C16   MAGRSG--DEELLKVIRLIKILYQSNPPPSPEGT-RSARRNRRRR
C17   MAGRSGDSDEDLLKAVRVIKILYQSNPPPRPEGT-RQARKNRRRR
C18   MAGRSGNADAGLLSAVRIIRILYQSNPYPSAEGT-RQARKNRRRR
C19   MAGRSGDDDEELLKTVRLIKFLYQSNPPPSSEGT-RQARRNRRRR
C20   MAGRSGSTDEELIRAVRTIKILYQSNPFPSSEGT-RQARKNRRRR
C21   MAGRSGDSDAELLKTVRLIKTIYQSNPPPSTEGT-RQARRNRRRR
C22   MAGRSGDSDEVLLQTVKIIKILYQSNPCPKPEGT-RQARRNRRRR
C23   MAGRSGSTDEDLLRAVRIIKILYQSNPYPSTEGTSRQTRKNRRRR
C24   MAGRSGDPDADLLTAVRIIKILYQSNPYPTPRGT-RQARRNQRRR
C25   MAGRSGDSDEELIKTVRLIKFLYQSNPPPNPEGT-RQARRNRRRR
C26   MAGRSGDNDEDLLKTVRLIKFLYQSNPPPNPEGT-RQARRNRRRR
C27   MAGRSGDSDEQLLRAVRIINILYQSNPYPPPEGT-RQARKNRRRR
C28   MAGRSGDNDEALLLAVRTIKLLYQSNPLPKPEGT-RQARRNRRRR
C29   MAGRSGDSDEELLKAVRLIKVLYQSNPPPSSEGT-RQARRNRRRR
C30   MAGRSGSTDEELLTAVRIIKFLYQSNPLPSSEGT-RQARRNRRRR
C31   MAGRSGSTDEELLRTVKIIRILYESNPFPSSEGT-RQARKNRRRR
C32   MAGRSGSTDEELLRTVRIIKILYQSNPYPSSEGT-RQARKNRRRR
C33   MAGRSGDSDEELLKTVKLIKQIYQSNPLPSSEGT-RQARRNRRRR
C34   MAGRSEDSDAALIQAVKIIKILYQSNPYPEPRGT-RQARKNRRRR
C35   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKSFYQSNPPPKPEGT-RQARRNRRRR
C36   MAGRSGDSVEELLQAVRIIRILYQSNPPPSDRGT-RQARRNRRRR
C37   MAGRSGDSDEELLKTVRLVKRLYQSNPPPNPEGT-RQARRNRRRR
C38   MAGRREDSDEELLKTVKLIKLLYQSNPLPNPEGT-RQARRNRRRR
C39   MAGRSGNSDEELLTAVRIIKILHQSNPYPKPRGS-RQARKNRRRR
C40   MAGRSGDSDEELLKAIRLIKFLYQSNPLPSPQGT-RQARRNRRRR
C41   MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKFLYQSNPPPSSEGT-RQARRNRRRR
C42   MAGRSGDSDEALLQAVKIIKILYQSNPYPELEGT-RQARRNRRRR
C43   MAGRSGDSDEALLQAVRIIRILYQSNPYPKPEGT-RQARRNRRRR
C44   MAGRSGDKDEVLLQAVRTIKILYQSNPYPKPKGT-RQAQRNRRRR
C45   MAGRSGSTDEDLLRAVRTIKILYDSNPYPSAEGT-RQARKNRRRR
C46   MAGRSGDSDEELLNTVRFIKVLYQSNPPPSPAGT-RQARRNRRRR
C47   MAGRSGDPDEDLIQAVRIIKILYQSNPPPPPEGT-RQARRNRRRR
C48   MAGRSGDRDEDLLKAVRLIKLLYQSNPPPSQEGT-RQARRNRRRR
C49   MAGRSGDADEELLRAVRIIKILYQSNPSPPPEGT-RQARKNRRRR
C50   MAGRSGSTDEELLRAVRIIRILYQSNPYPSAEGT-RQTRKNRRRR

con   ****       *: .:: :. :::*** *   *. *.:::*:***


C1    WRERQRQIRSISERVLSTYLGRPEEPVPLHLPLLERLTIDCDEDC
C2    WKARQRQIDSLSERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLHLDCSEDC
C3    WRARQRQIRALSERILSTCLGGPPEPVPLQLPPLERLQLDCSEDC
C4    WRERQRWIHSISSWILSTHLGRPAEPVPLQLPPIERLTLDCSEDC
C5    WRARQRQINSISERILSTCLGRSTEPVPFQLPPIERLHIGDSESS
C6    WRARQNQIDSIGERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLSLDCNEDC
C7    WRARQRQISSLSAWIISTHLGRSTEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C8    WRARQRQINSIGERILSTYLGGSEEPVPLQLPPLERLNLNCSEDC
C9    WRARQRQIRAISERILSAHLGRSTEPVPLPLPPLERLRLDCSEDC
C10   WRARQRQIRSISERILVTCLGRPAEPVPLQLPPIEGLHINCSESG
C11   WRARQEQINAISGRILSSFLGRPAEPVPLQLPPIERLRLDCSEDC
C12   WRARQRQIRALSERILDNFLGGSTEPVPLQLPPLEKLTLDCDKDC
C13   WRARQRQIHSISERILSTCLGRPAEPVPFQLPPIERLTINCSESG
C14   WRARQRQINSIGERIISTYLGRSAEPVPLQLPPIERLTINCNEDC
C15   WRERQRQIRQISGRILDTYLGGSAEPVPLQLPPLERLTLDCSEGC
C16   WRARQRQI----QRILTTFLGRLEEPVPLQLPPLERLNLNCSENC
C17   WRRRQNQIDSISQRVLSACLGRPAEPVPLQLPPLEKLTLNCNEDC
C18   WRARQRQISQISQRILSSCLGRSEEPVPLQLPPIERLRLDCSEDC
C19   WRERQRQIRTISERILGTYLGRPTEPVPLHLPPLERLTLDCNEDC
C20   WRARQRQIRALSQRILIACLGRPPEPGPLQLPPLERLQLDCSEDC
C21   WREKQRHIRSISGWILDTYLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDSSEDC
C22   WRARQRQINSISERILSTCLGRSEEPVPFLLPPIDRLYIGDSESG
C23   WRARQRQIRALSERILSTCVGRPEEPVPFLLPPIERLHLDCSEDC
C24   WRARQRQIDSIGERILSTLVGRSAEPVPLQLPPIERLRLDCSEDC
C25   WRTRQRWIRSISKWILNTHLERPVEPVPFQLPPIERLTLDCDEDC
C26   WRERQRQIRNISEWILSNHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C27   WRARQRQIRALSERILSTCLGRSAEPVPLQLPPLERLHLNCSEDC
C28   WRARQQQIHKISERILSDCLGRPAEPVPLQLPPIEKLHIDCSESS
C29   WRARQRQIRTISKWILDTHLGRSVEPVPLQLPPLERLNIGGSEDC
C30   WRARQRQINTLSERILSTCLGRPTEPVPLQLPPLERLHLGDDKDC
C31   WRARQRRIREISERILITCLGRPTEPVPLLLPPLERLHLDCSEDS
C32   WRARQRQIRALSERILSTFLGRSTEPVPLQLPPLDRLHLDCSEDC
C33   WREKQRQIHQISGWILSAFLGRPAEPVPLQLPPLERLTLHCSEDC
C34   WRARQRQIHSIGDRILSACLGRSPEPVPLQLPPLERLHIADNESG
C35   WRRKQQIIRQISDRILAAFLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C36   WRERQRHIQSISAWILHSHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C37   WRERQRQINKIGGWILSTYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C38   WRARQRQIREISERILDTYLGGSTEPVPLQLPPLERLTLDCSKDC
C39   WRARQQQINSISERILSTCLGRSAEPVPLQLPPLERLHLDCSEDC
C40   WRKRQQQIQSISGWILSNHLGRPTEPVPLQLPPIERLTLDCNESC
C41   WRERQRHIRAISERILSTFLGRPEEPVPLQLPPLDRLTLDCNEDC
C42   WRARQKQIHSISERILSSCLGRSTEPVPLQLPPIERLHIDCSESG
C43   WRAGQRQIHQISERILTTCLGRRTEPVPFQLPPIERLHIDCSESG
C44   WRARQRQIHSISARILSTCLGRSTEPVPLQLPPIEGLHIDCSESG
C45   WRARQRQIRAISDRILSAFVGRSTEPVPLQLPPLERLTLDCEEDC
C46   WRQRQRQVRAISEWLLRNYLGRPAEPVHLPLPPLERLTLDCDEDS
C47   WRARQRQIHSISERILSSCLGRRAEPVPLQLPPLERLHIDCSEDS
C48   WRERQRQIRSLSGWILSDYLGRPAEPVPLPLPPLERLTLDCNEDC
C49   WRARQRQIRALSERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLCLDCSEGG
C50   WRARQRQIRALSERILSSCVGRSTEPVPLQLPPLERLQLDCSEDC

con   *:  *. :      ::   :    **  : ** :: * :  .:. 


C1    GTSGTP-------GVGNPQILV--ESPAVLESGTKEooooooooo
C2    GTSGTG-----------PQVSV--ESTSILGSGTKNooooooooo
C3    GTSGTQ-------GVGNPQISG--EPSGILGSGTKNooooooooo
C4    GTSGTQ-------GVGSSQVLV--ESPTVLGSGTKEEoooooooo
C5    GTTGTQQSQGTTEGVGNPoooo--ooooooooooooooo------
C6    GDSGTQ-------GVENPQVPG--ESDMLLGTGTKEooooooooo
C7    GNSGTQ-------GVGNPQVLV--ESPTVLEFGAKEooooooooo
C8    GSPGTQ-------GVGSNQVLV--ESPAILDSGTKEooooooooo
C9    GTSGTQQSQGTETGVERPQISG--ESPDILGPGTKNooo------
C10   ETSGTQQSQGTTERLGNPoooo--ooooooooooooooo------
C11   GTSGTQQPQGAETGVGRSQVPE--ESSGILDTGTKNooo------
C12   GTSGTQ-------GVGSPQILG--ESPAILDSGTKEooooooooo
C13   GTSGTQRPQGTAGGVGNPWVFG--RPCAVLESGTKEooo------
C14   GTSGTQ-------GVGSSQVSG--ESSAILDTGTKEooooooooo
C15   RDSGTQ-------GVGNPQVLV--ESPAILESRTKEooooooooo
C16   GTSGTQ-------GEGSHQISV--EPPAILDSGTKEooooooooo
C17   GTSGKQ-------GVGDPQISV--ESPTVLGSGAKEooooooooo
C18   GTSGTQQSQGTETGVGSPQISG--ESSIILGSGTKEooo------
C19   GTAGTQ-------GVGTPQVLV--ESPTVLESGAKEEoooooooo
C20   GTSGTQQSQGTETGVGRSQISGEPEPSGILGSGTKNo--------
C21   GASGTQ-------GVGNPQILV--ESPTVLESGTKEooooooooo
C22   GTSGTQQSQGTTEGVGSTEVSG--KSCAVLGSGTKEEoo------
C23   GTSGIQQSQGTETGVGRSQISG--EPSGILDPGTKNoo-------
C24   GTSGTQHSQGTETGVGGPQISG--ESSEILGSGTKEooo------
C25   GTSGTQ-------GVGSPEILV--ESPAVLDSGTKEooooooooo
C26   GDSGTQ-------GVGGPQVLV--ESPAILGSGTKEooooooooo
C27   RDSGTQQPQGTETGLGGPQISV--EPPGVLGSGTKNooo------
C28   GASGTQQSQGTTEGVGSSEISE--RSYTVLGSRTKEEoo------
C29   GTSGTQ-------RLGDPQILV--EHPAVLESGAKEooooooooo
C30   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISG--ESSDILEPGNKNooo------
C31   EHGTET-------GVGSPQISG--ESSVILEPGTKNooooooooo
C32   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISG--ESSVILGTGAKNooo------
C33   GTSGTQ-------GVGTPQVSV--ESPAVLESGTKEooooooooo
C34   GTSGTQQSQGTTEGVGSPEISG--KSCTVLGAGTKKEoo------
C35   GDSGTQ-------GVGSPQVLV--ESPAVLDSGTKEooooooooo
C36   GTSGTQ-------GVGSSQISV--ESSTVLESGTKEooooooooo
C37   GTSGTQ-------GVGSPQVLV--ESPAVLESGTKEooooooooo
C38   GTSGTQ-------GVGSPQILV--ESPAILESGTKEooooooooo
C39   GTSGTQQSQGTETGVGGPQVSV--ESPVVLGSGTKNooo------
C40   GTSGTQ-------GVGDPQILV--ESTTVLESGTKEooooooooo
C41   GTSGTQ-------GVGRPQILL--ESPAVLEPGTEEooooooooo
C42   GTSGTQQSQGTTEGMGSSoooo--ooooooooooooooo------
C43   GTSGTQQSQGTTEGVGNPoooo--ooooooooooooooo------
C44   GSSGTQQSQGTTEGVGSTEISE--KPCAVLGSGTEKECC------
C45   GTSGIQQSQGTETGVGNSQVSG--EPSAILGSGAKNooo------
C46   GTSGTQ-------GVGTPQILV--ESPTVLESGTKEooooooooo
C47   RATGTQQPPGTETGVGGPQTSV--ESPAVLGSGTKEEoo------
C48   GNSGTQ-------GVGNPQILV--ESPTVLESGTKEooooooooo
C49   GASG-----------GSPQISV--EPSDILGSGTEEooooooooo
C50   GQGTET-------GVGRPQISG--ESSVVLGSGTENooooooooo

con                                                


C1    o------
C2    ooooo--
C3    o------
C4    o------
C5    -------
C6    o------
C7    o------
C8    o------
C9    -------
C10   -------
C11   -------
C12   o------
C13   -------
C14   o------
C15   o------
C16   ooooooo
C17   o------
C18   -------
C19   o------
C20   -------
C21   o------
C22   -------
C23   -------
C24   -------
C25   o------
C26   o------
C27   -------
C28   -------
C29   o------
C30   -------
C31   o------
C32   -------
C33   o------
C34   -------
C35   o------
C36   o------
C37   o------
C38   o------
C39   -------
C40   o------
C41   o------
C42   -------
C43   -------
C44   -------
C45   -------
C46   o------
C47   -------
C48   o------
C49   ooooo--
C50   o------

con