T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  92
C2    :  91
C3    :  88
C4    :  93
C5    :  91
C6    :  90
C7    :  89
C8    :  89
C9    :  93
C10   :  91
C11   :  93
C12   :  89
C13   :  93
C14   :  87
C15   :  93
C16   :  93
C17   :  93
C18   :  93
C19   :  85
C20   :  90
C21   :  93
C22   :  90
C23   :  90
C24   :  93
C25   :  90
C26   :  92
C27   :  93
C28   :  92
C29   :  90
C30   :  93
C31   :  93
C32   :  93
C33   :  93
C34   :  90
C35   :  91
C36   :  91
C37   :  89
C38   :  93
C39   :  93
C40   :  92
C41   :  49
C42   :  90
C43   :  90
C44   :  93
C45   :  93
C46   :  88
C47   :  93
C48   :  90
C49   :  90
C50   :  93
con   :  91

C1    MAGRSGDSDEELLKTIRIIKFLYQSNPLPK-PEG-TRQARRNRRR
C2    MAGRSGDSDAELLTAVRIIKILYQSNPPPK-PRG-TRQARKNRRR
C3    MAGRSGDSDEELLKAVRIIKLLYQSNPPPK-PEG-TRQARRNRRR
C4    MAGRREDSDEELLKTVKLIKLLYQSNPLPN-PEG-TRQARRNRRR
C5    MAGRSGSTDEELLRAVRTIRILYQSNPFPS-SEG-TRQARRNRRR
C6    MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPFPS-SEGTTRQTRRNRRR
C7    MAGRSGDADEELLRAVRIIKILYQSNPYPP-REG-TRQARKNRRR
C8    MAGRSGDNDEELLRAVRVIKILYQSNPPPS-AEG-TRQARRNRRR
C9    MAGRSGDGDEDLLTTVRVIKFLYQSNPPPS-SQG-TRQARRNRRR
C10   MAGRSGDSDEELLKTVRFIKLLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C11   MAGRSGDSDEDLLQTVRIIKFLYQSNPPPR-PEG-TRQARRNRRR
C12   MAGRSGDSDEELLKAIRIIKILYKSNPYPK-PRG-TRQARKNRRR
C13   MAGRSGDSDEELLRAVRLIKSLYQSNPPPN-PEG-TRQARRNRRR
C14   MAGRSGNTDEDLLRAVRIIKILYQSNPSPP-PEG-TRQARRNRRR
C15   MAGRSGDSDEELLRTIRLIKILYQSNPLPS-PEG-TRQARRNRRR
C16   MAGRSGDSDEDLLKAVRLIKFLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C17   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKFLYRSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C18   MAGRSGDSDGELLQTVRIIKLLYQSNPPPK-PEG-TRQARRNRRR
C19   MAGRE-DNDEELIRAVRIIKILYQSNPYPEQHRG-TRQARKNRRR
C20   MAGRSGDSDEELLRAVRIIKILYQSNPYPR-PKG-SRQAQKNRRR
C21   MAGRSGDNDVELLKTVRLIKFLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C22   MAGRSGDSDEALLQAVKIIKILYQSNPYPK-PEG-TRQARKNRRR
C23   MAGRSGDSDAALLQAVQIIKILYQSNPYPN-PEG-TRQARRNRRR
C24   MAGRREDNDEELIKAVRLIKFLYQSNPLPS-PEG-TRQARRNRRR
C25   MAGRSGDNDEELIKTVRLIRLLYQSNPPPSNTEG-TRRARRNRRR
C26   MAGRSGTTDEDLLKTVRIIKILYQSNPYPD-PTG-TRQARRNRRR
C27   MAGRSGDSDEELLKTVRIIKFLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C28   MAGRREDSDEELIKTVKLIKLLYQSNPPPN-PEG-TRQARRNRRR
C29   MAGRSGESDKELLKVIQIIKILYQSNPLPS-PEG-TRSARRNRRR
C30   MAGRSGDSDEELLRTVRLIKLIYQSNPPPK-LEG-TRQARRNRRR
C31   MAGRSGDSDEQLLLTVRLIKDLYQSNPPPS-SEG-TRRARRNRRR
C32   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKVLYQSNPPPS-SEG-TRQARRNRRR
C33   MAGRSGDSDEDLLQAVRLIKFLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C34   MAGRSGSTDEELLRVVRAVRILYQSNPYPS-SEG-TRQARKNRRR
C35   MAGRSGDSDEKLLQTVRIIKILYQSNPYPK-PEG-TRQARKNRRR
C36   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILHESNPYPS-AEG-TRQARRNRRR
C37   MAGRSGSTDEDLLRAVRIIKILYQSNPYPS-TEGTSRQTRKNRRR
C38   MAGRSGDSDEDLLRAVRLIKFLYQSNPPPS-PEG-TRQARRNRRR
C39   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKFLYQSNPLPS-PEG-TRQARRNRRR
C40   MAGRSGNSDEKLLKVARIIKFLHQSNPPPS-TEG-TRRARRNRRR
C41   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPS-SED--RQA------
C42   MAGRSGSTDEDLLRAVRIIKILYQSNPYPP-AEG-NRQTRRNRRR
C43   MAGRSGDSDEELLKVIRTIKILYQSNPYPK-PTG-TRQARRNRRR
C44   MAGRSEDRDEDLLKTVRLIKTLYQSNPLPS-PEG-TRQARRNRRR
C45   MAGRSGDSDEELLKIVRLIKQLYQSNPLPS-PEG-TRQARRNRRR
C46   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPE-PKG-TRQARRNRRR
C47   MAGRSGDSDDELIKTVQLIKQIYQSNPPPS-SEG-TRQARRNRRR
C48   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPYPS-GEG-SRQTRKNRRR
C49   MAGRSGSTDEELLKAVRIIKILYQSNPYPP-AEG-SRQTRKNRRR
C50   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKFLYQSNPPPS-QEG-TRQARRNRRR

con   ****    *  *:   : :: ::.*** *    .  * :      


C1    RW-RRRQRWIRSISEWILNTHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSE
C2    RW-RARQRQIDSISERILSTCLGRSTEPVPLQLPPLERLHLDCSE
C3    RWERETETHQRPFSEWILSTHLERPSEPVPLQLPPLERLTLDCNK
C4    RW-RARQRQIREISERIIDTYLGGSTEPVPLQLPPLERLTLDCSK
C5    RW-RARQRQIRAISERILASYLGRSTEPVPLQLPPLERLHLDCNE
C6    RW-RARQRQIREISERILSTCLGRSTEPVPLLLPPIERLHIDCSE
C7    RW-RARQREISALSERILSSCLGGSAEPVPLQLPPIERLSLDCRE
C8    RW-RARQRQIRALSERVLCSCLGRSTEPVPLQLPPLERLSLDSGE
C9    RW-RERQRQIQSISGWILSTHLGRSAEPVPLQLPSLERLTLDCNE
C10   RW-RERQRHIRSISNWLLSNYLGRPTEPVPFQLPPLERLTLDCDE
C11   RW-RQRQRQIQKISGWILSTCLGRPAEPVPLQLPPLEGLTLDCNE
C12   RW-RARQNQIDSISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLCLDCNE
C13   RW-RERQRQIRTISDRILSTFLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCNE
C14   RW-RARQRQIRAISERILGTYLGGSTEPVPLQLPPLERLNLGSSE
C15   RW-RARQRQIHSIGERILNTYLGRSEEPVPLQLPPLERLNLNCNE
C16   RW-RARQRQIHSISERILSTYLGRPEEPVPLQLPPLERLNLNCNE
C17   RW-RARQRQIHEISGWLLSTHLGRSEEPVPLQLPPLDRLTLDCSE
C18   RW-RARQRQIRTISERILSDFLGRSEEPVPFQLPPLERLTLDCNE
C19   RW-RARQKQIHSISERVLSACLGRPTGPVDLQLPPLERLHITDSE
C20   RW-RARQRQIDSISERILSTCLGRSEEPVPLQLPSLETLHLDCHD
C21   RW-RERQRQIRAISGWILSNYLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCNE
C22   RW-RARQRQINSISERILSTCLGRPAEPVPFLLPPIERLHIDCSE
C23   RW-RARQKQIHSISERILSTCLGRSTEPVPFQLPPIERLHIGDSE
C24   RW-RARQRQIREISERILDTYLGGSTEPVPLQLPPLERLTLDCDT
C25   RW-RERQRQIRSISERILSDFLGRPTEPVPLPLPPLERLTLDCSE
C26   RW-RARQRQIHSISERLLAACLGRPAEPVPLQLPPIEKLSLNCSE
C27   RW-RERQRQIRTISGWLLSNHLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCNE
C28   RW-RARQRQIRDISNRILDTFLGGSTEPVPLQLPPLERLTLDCNE
C29   RW-RARQNQIHSIAERVLSTHLGRLEEPVPFQLPPIERLHLDCSE
C30   RW-RERQRQIQTISGWILSNYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSE
C31   RW-RERQRQIRAISDRILGTYLGRSSEPVPLQLPPLERLTLDCSE
C32   RW-RERQRQIHTISRWILSTHLGRSAEPVPLQLPPLERLTLACEE
C33   RW-RQRQRHIKAVSAWILSTHLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCSE
C34   RW-RARQRQISEISERILSACLGRSTEPVPLQLPPLERLQLDCSE
C35   RW-RARQRQIHSIGERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLTLDCSE
C36   RW-RARERQIRAISERVLSSCVGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCNE
C37   RW-RARQRQIRALSERILSTCVGRPEEPVPFLLPPIERLHLDCSE
C38   RW-RERRRQIQAISDWILSTHLGRSTEPVPLQLPPIERLNLDCSE
C39   RW-RERQRQVRKISEWILTTHLGRSEEPVPFQLPPLERLTLDCNE
C40   RW-RERQKQIQSISNWILSNHLGRPTEPAPLQLPPLDRLTLDCSE
C41   --------------------------EHVPLQLPPLERRTLDCSE
C42   RW-RARQRQIREISDRILSTCLGRSTEPVPLQLPPLERLTLDCSE
C43   RW-RARQRQIRGISERILGDYLGRPAEPVPLQLPPLERLHINCSE
C44   RW-RERQRQIREISAWILDTYLGGPKEPVPLQLPPLERLTLDCSK
C45   RW-RERQRQINWISERILNTCLGRSEEPVPLQLPPIERLTLDCNK
C46   RW-RARQRQIHSLSERILSTCLGRSTEPVPLQLPPIERLHIGGSE
C47   RW-RERQRHIREISGWILSTYLGRPTEPVPLPLPPLERLTLDCSE
C48   RW-RARQRQIRAICERILSSCVGRSTEPVPLQLPPLERLQLGCSE
C49   RW-RARQRQISALSERILSTCVGRSAEPVPLQLPPLERLHLTCSE
C50   RW-RERQRQIRTISGWILSNYLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCNE

con                               . : **.::   :    


C1    ECGTSGTQ-------GVGSPQILLESPAVLESGTKEKooooooo-
C2    DCGTSGTQQSQGVETGVGRPQVPVESPAVLGSGTKNo--------
C3    DCGTSGTK-------GVGDPQVLVESPAVLESGIKEooooooo--
C4    DCGTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLDSGTKEoooooooo-
C5    DSGTSGTLQSQGTETGVGRPQISGESSVILGTGTKNo--------
C6    DCGTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSVILGPGAKN---------
C7    DCGTSGTQQSQGTETGVGSPooooooooooooooooo--------
C8    DCGTSGTQQSQGTETRVGGPQISGESSGVLGTGAKNo--------
C9    DCGTSGTQ-------GVGNPQMLVESPTILESGTKEoooooooo-
C10   DCGTSGTQ-------GVGNPQILVEHHPVLEPGTKEoooooooo-
C11   DCGNSGTQ-------GVGTSQVLVESPAILDSGTKEoooooooo-
C12   NGGNSGTQQSQGPETGVGSPQISGESSIILGSGTKEo--------
C13   DCGTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooo-
C14   DCGTSGTQQSQGTETGVERPQISGESSVILGPGTKNo--------
C15   DCGTSGTQ-------GVGSHQISVESPAVLESGTEDoooooooo-
C16   NCGTSGTQ-------GVGSHQISVESPKILDSGTKEoooooooo-
C17   DCGNSGTQ-------GVGSSQVLLESPAILESGTKEoooooooo-
C18   DCGTSGTQ-------GVGSPQVLVESPTILESGTKEoooooooo-
C19   SGGTSGTE-------GVGSPoooooooooooooooooooooooo-
C20   DCGTSGTQQSQGVETGVGRPQVPGEPSTVLGSGTKTo--------
C21   DCGTSGTQ-------GVGNPQILVESPTVLESGAKEoooooooo-
C22   SGGSSGTQQSQGTTEGVGSPooooooooooooooooo--------
C23   SAGTSGTQQSQGTTEGVGSPooooooooooooooooo--------
C24   DCGTSGAQ-------GVGSPQILVEPPAVLDSGTKEoooooooo-
C25   DCGTCGTQ-------GVGSPQVLVESPTVLESGTKEEoooooo--
C26   DCGTSGDK-------GVGSPQIPVEPPAVLGTGAKEoooooooo-
C27   DCGTSGTQ-------GVGSPQILVESPTILEAGTKEoooooooo-
C28   DCGTSGTQ-------GVGSSQILVEHPAVLDSGTKEoooooooo-
C29   DCGTSGTQQSQGTETGVGRPQVSGESSVILGSGTKDo--------
C30   DCGTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLGSGTKEoooooooo-
C31   DLGTSGSQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooo-
C32   GCGTSGTQ-------GVGNPQVLVESPAVLESGTKEoooooooo-
C33   DCGTAGTQ-------GVGSPEILVESPAVLESGTKEoooooooo-
C34   GCGTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSGILGTGTKNo--------
C35   DCGTSGTQQSQGTETGVGRPQVSVESSAILGSGTKDo--------
C36   DCGTSGTQQSQGTESGVGRPQISVESSVILGTGAKNo--------
C37   DCGTSGIQQSQGTETGVGRSQISGEPSGILDPGTKN---------
C38   DCGTSGTQ-------GVGSPQVLGESPAILDSGTKEoooooooo-
C39   DCGTSGTQ-------GVGNPQNSVESPAVLEPGTKEoooooooo-
C40   DCGDSGTQ-------RVGSSQVLLESPAILESGTKEoooooooo-
C41   NPEPSGTE-------EVGNHQVPGKHCPILEHRAKKEoooooooo
C42   DCGTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSVILGPGTKNo--------
C43   DCGQGTEE-------GVGSPQTSGESRALLESGTKEoooooooo-
C44   DCGTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLDSGTKEoooooooo-
C45   DCGTSETQ-------GVGTPQVFVESSTVLASGAKEoooooooo-
C46   SGGTSGTQ-------QLGSPQISGKPCAVLGSGAKKoooooooo-
C47   GCGTCGTQ-------GVGTPQVLVESPTVLESGTKEoooooooo-
C48   DCGTSGTQNSPGTETGVGRPQISGESSVILGSGTKNo--------
C49   DCGTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSVLLGTGTKNo--------
C50   DCGTSGTQ-------GVGNPQIFVESSTVLESGTKEoooooooo-

con                   :                            


C1    -------------------------------
C2    -------------------------------
C3    -------------------------------
C4    -------------------------------
C5    -------------------------------
C6    -------------------------------
C7    -------------------------------
C8    -------------------------------
C9    -------------------------------
C10   -------------------------------
C11   -------------------------------
C12   -------------------------------
C13   -------------------------------
C14   -------------------------------
C15   -------------------------------
C16   -------------------------------
C17   -------------------------------
C18   -------------------------------
C19   -------------------------------
C20   -------------------------------
C21   -------------------------------
C22   -------------------------------
C23   -------------------------------
C24   -------------------------------
C25   -------------------------------
C26   -------------------------------
C27   -------------------------------
C28   -------------------------------
C29   -------------------------------
C30   -------------------------------
C31   -------------------------------
C32   -------------------------------
C33   -------------------------------
C34   -------------------------------
C35   -------------------------------
C36   -------------------------------
C37   -------------------------------
C38   -------------------------------
C39   -------------------------------
C40   -------------------------------
C41   ooooooooooooooooooooooooooooooo
C42   -------------------------------
C43   -------------------------------
C44   -------------------------------
C45   -------------------------------
C46   -------------------------------
C47   -------------------------------
C48   -------------------------------
C49   -------------------------------
C50   -------------------------------

con