T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=93
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  92
C2    :  94
C3    :  95
C4    :  93
C5    :  95
C6    :  92
C7    :  92
C8    :  95
C9    :  93
C10   :  93
C11   :  95
C12   :  90
C13   :  95
C14   :  95
C15   :  94
C16   :  93
C17   :  86
C18   :  95
C19   :  94
C20   :  92
C21   :  95
C22   :  93
C23   :  91
C24   :  88
C25   :  92
C26   :  94
C27   :  95
C28   :  92
C29   :  94
C30   :  95
C31   :  94
C32   :  95
C33   :  92
C34   :  90
C35   :  91
C36   :  93
C37   :  95
C38   :  91
C39   :  94
C40   :  95
C41   :  95
C42   :  93
C43   :  93
C44   :  92
C45   :  94
C46   :  94
C47   :  91
C48   :  93
C49   :  95
C50   :  95
con   :  93

C1    MAGRSGDSDEELLQVARIIKILYQSNPYPEPRG-TRQARKNRRRR
C2    MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKLLYQSNPPPGPEG-TRQARRNRRRR
C3    MAGRSGDSDEDLLKTVRLIKAIYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C4    MAGRSGDSDEGLLKAVRLIKALHQSNPPPSSEG-TRQARRNRRRR
C5    MAGRSGDSDEELLKTVRLIKFLYRSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C6    MAGRSGDSDAALLQAVRIIKILYQSNPYPKPEG-TRQARRNRRRR
C7    MAGRSGNTDEDLYRAIRIIKILYQSNPFPSTEG-TRQARRNRRRR
C8    MAGRSGGSDRELLTAVRIIKILYQSNPHPSPEG-TRQARRNRRRR
C9    MAGRSGDSDVDLLKVIRYIKILYQSNPYPKPEG-TRQARRNRRRR
C10   MAGRSGDSDEELLRAVRIIKILYKSNPYPKPKG-SRQARKNRRRR
C11   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKTIYQSNPPPSSEG-TRQARRNRRRR
C12   MAGRSGSTDDDLLRAVRIIKILYQSNPYPSSEG-TRQARKNRRRR
C13   MAGRSGNSDEDLLQTVRLIKFLYQSNPPPSSEG-TRQARRNRRRR
C14   MAGRSGDNDEELLKTVRLIKVLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C15   MAGRSGDSDEELLRTVRIIKFLYQSNPLPKPEG-TRQARRNRRRR
C16   MAGRSGSDDTELLTAVRIIKILYQSNPYPKPRG-SRQARKNRRRR
C17   MAGRSGDSGEALLQAVRIIKLLYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C18   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKFLHQSNPPPSPTG-TRQARRNRRRR
C19   MAGRSGDRDEELLQTVKIIKFLYQSNPLPSSEG-TRQARRNRRRR
C20   MAGRSGSTDEELLRAVRIIKILYQSNPFPPPEG-TRQARRNRRRR
C21   MAGRSGDSDEELIKTVRLIKFLYQSNPPPSQEG-TRQARRNRRRR
C22   MAGRSGSSDENLLQAVRIIKILYQSNPYPKPKG-TRQARKNRRRR
C23   MAGRSG-SDEELLLAIRTIKILYQSNPSPPPEG-TRQARRNRRRR
C24   MAGRSGSTDEELLRAVRTIKILYQSNPFPSSEG-TRQARKNRRRR
C25   MAGRSGSTDEELLHAVKIIKILYQSNPYPSAEG-TRQTRKNRRRR
C26   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C27   MAGRSGDSDEDLLQTVRLIKPLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C28   MAGRSGDSDEALLQLARIIKIIYQSNPYPGSEG-TRQARKNRRRR
C29   MAGRSGDSDEELLQTIRLIKLLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C30   MAGRSGDNDEDLLKTVRLIKDLYRDNPPPSQEG-TRQARRNRRRR
C31   MAGRSGSTDEELLKIVRLIKHLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C32   MAGRSGDSDEDLLKTIRLIKLLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRRR
C33   MAGRSGDNDEALLQAVRIIKILYQSNPYPKPEGTTRQARKNRRRR
C34   MAGRSGDSDEALLLAVRTIKILYQSNPYPKPEG-TRQARKNRRRR
C35   MAGRSGDSDEALLQAVRTIKILYQSNPRPKPEG-TRQARKNRRRR
C36   MAGRSGDSDEELLRIIRTIKILYDSNPHPKPTG-SRQARKNRRRR
C37   MAGRSGDSEEELLKTVRLIKRLYQTNPPPSTEG-TRQARRNRRRR
C38   MAGRSGDPDAELLTAVRIIKILYQSNPYPTPRG-TRQAQRNQRRR
C39   MAGRSGGSDEELLKAIRYIKILYQSNPFPKPEG-TRQARRNRRRR
C40   MAGRSGDSDEELLKTVRLIKTIYQSNPPPSQEG-TRQARRNRRRR
C41   MAGRSGDSDEELLRAVRLIKFLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRRR
C42   MAGRSGDSDEDLLRAVRAIKILYQSNPYPKAEG-TRQARRNRRRR
C43   MAGRSGVSDDDLLKAVRLIKILYQSNPYPSPEG-TRKARRNRRRR
C44   MAGRSGSTDEELIQAVRIIKILYQSNPYPKPRG-TRQARKNRRRR
C45   MAGRSGDSDEALLQAVRIIKILYQSNPYPNPEG-TRQARRNRRRR
C46   MAGRSGDSDDDLIKTVRLIKHLYQDNPPPSPAG-TRQARRNRRRR
C47   MAGGYEDPDEELLKAVRIIKILYQSNPYPEPRG-TRQARKNRRRR
C48   MAGRSGNSDEELLRGIRIIKILYQSNPYPKPRG-TRQARKNRRRR
C49   MAGRSGDSDEELLWGIRLIKFLYQSNPPPSLEG-TRQARRNRRRR
C50   MAGRSGDSDEELLNTIRLIKFLYQSNPPPRPEG-TRQARRNRRRR

con   ***        *    : ** ::  ** *   * :*::::*:***


C1    WRARQRQIREISERILCTCLGRSTEPVPFLLPPIERLHIGDSEGS
C2    WRQRQRNIRWISERILDSFLDRPEEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C3    WRERQRQIRRISGWILDTYLDRPEEPVPLQLPPLERLSLDCNEDC
C4    WRARQRWIQKASDWIITTHLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCNKDC
C5    WRARQRQIHEISGWLLSTHLGRSEEPVPLQLPPLDRLTLDCSEDC
C6    WRARQRQINSIGERILSTCLGRSAEPVPLQLPPIERLSIGDSESS
C7    WRARQNQIRAISGRILGTCLGRPTEPVPLQLPPLERLQLDCSEDC
C8    WRERQRQIHSISERILSTVLGRSSEPVPLQLPPLDRLTLDCSEDC
C9    WRARQRQIRALSERILSSCLGRLEEPVPLQLPPLERLHINCSEDC
C10   WRARQRQIDSISERILSTCLGRPTEPVPLQLPPLERLHLDCCEDC
C11   WRQRQRQIQSISGWILSTYLGRSAEPVPLQLPPLERLTLDCDKDC
C12   WRARQRRVREISQRILSSYLGRSTEPVPLQLPPLERLNLDCSEDC
C13   WRERQRQIRTISDWILSTHLGRPAEPVPLQLPPLERLSLDCNEDC
C14   WRARQRQIRSISERILSTFLGRLEEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C15   WRKRQRWIRSLSEWILNTHLGRPKEPVSLQLPPLERLSLDCSEEC
C16   WRARQNQIDSLSERILRTCLGRSEEPVPFQLPPLERLHLDCSEDC
C17   WRARQRQIHSISERILIDCLGRSAEPVPLQLPPIEGLHIDCSENS
C18   WRERQKQIRAISQWILNTHLGRLVEPVPLQLPPLERLNLDCSEDC
C19   WRTRQRQIRDISGWILSNYLGRPTEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C20   WRARQRQIRAISERILSTCVGRPTEPVPLQLPPLERLSLKCSEDC
C21   WRERQRQIRTASEWILSNFLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDSDEGC
C22   WRARQQQIDSISERILTTCLGRPSEPVPFQLPPIERLRLDCSEDS
C23   WRARQRQIREISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLNLHCSEDS
C24   WRARHTQIREISDRILSACLGRPTEPVPLQLPPLERLQLDCSEDC
C25   WRARQRQVREISERILSSCLGRSTEPVPLQLPPLERLTLDCSEDC
C26   WRARQRQIRAISERILSTCLGRPTEPVPLPLPPIERLRIDNNESG
C27   WRERQRHIRSISEWLISTRLGRPTEPVPFQLPPLDRLSLDCNEDC
C28   WRARQRQIHSISERILEHCLGRSEEPVPFQLPPIERLHIDCSESG
C29   WRERQRQIRSLSGWLLSNRLGRSTEPVPLPLPPLDRLTLDCKEDC
C30   WRERQRHIQSISERILRTYLGRPVEPVPLQLPPLERLTLDCNEDC
C31   WRERQRQIRTISTWLLSTHLGRPAEPVSFQLPPLERLSLDSSKDC
C32   WRERQRHIRSISERIICTYLGRPEEPVPLPLPPLERLTLDCSEDC
C33   WRARQRQIHSISERILSTCLGRPEEPVPLQLPPIERLHIDCSESG
C34   WRARQRQIRAISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPLERLHIGCSESS
C35   WRARQRQIREISDRILSACLGRPAEPVPLQLPPIEELHIGCSESS
C36   WRARQRQIDSLSERILSTCLGRPAELVPLQLPPLERLHLDCSEDC
C37   WRERQRQIRDLSGWILSTYLGRPEEPVPLPLPPLERLTLDNNEDC
C38   WRARQRQIDSVSERILSTCLGRSAEPVALQLPPIERLHLDCSEDC
C39   WRARQRQIRALSERILSSCLGRPEEPVPLQLPPLERLHINCSEDC
C40   WRERQRQIRNISGWILSTYLGRSEEPVPLQLPPLERLNLDCNEDC
C41   WRERQRQIQAISGWILSNHLGRPAEPVPLPLPPLERLTLDCSEDC
C42   WRARQRQIREISERILVSCVGRSTEPVPLQLPPLERLHINCSEDC
C43   WRARQRQIHSIGERILSTYLGRSEEPVPLQLPPLEKLNLNCSEDC
C44   WRARQRQIDSISERILSTCLGRSAEPVALQLPPLERLRLDCSEDS
C45   WRARQRQIHSISERILISCLGRLEEPVPLQLPPLERLTLNCSEDC
C46   WRERQRQIRRISEWLLSNHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDSSEDC
C47   WRARQRQINTLSERILSTCLGRPAEPVPLLLPPIERLHIGDSESG
C48   WRARQEQINSISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPLERLHLDCREDG
C49   WRQRQRQIRSISEWILSNHLGRPAEPVPLHLPPLERLTLDCSEDC
C50   WRERQRQIRAISGWILSNHLGRSAQPVPLQLPPLERLTLDCNEGC

con   ** *:  :   .  ::   :.*  : *.: ***:: * :   :  


C1    GTSGTQQSQGTPEGVGNPooooooooooooooooo-------
C2    GTSGTQ-------GVGSPQILLESPAVLESGTKEEooooooo
C3    GTSGPQ-------GVGSPQILVESHTVLESGTKEoooooooo
C4    GTSGTQ-------GVGSSQIFVEPATILEPGTEKoooooooo
C5    GNSGTQ-------GVGSSQVLLESPAILESGTKEoooooooo
C6    GTSGTQQPQGTTEGVGNPooooooooooooooooo-------
C7    GTSGTEHSQGTEAGVGRPEISGESSVILGSGTENo-------
C8    GTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLESGTKEoooooooo
C9    GQGTEG-------GVGSPQISGESPAVLGSGTKEoooooooo
C10   GTSGTQQSQGAETGVGRHQVSVESPVILGSGTKNo-------
C11   GTSGTQ-------GVGSPQISVESPAVLDSGTKEoooooooo
C12   GTSGTQ----PETGVGRPQISGESSVILGSGTKDooooo---
C13   GTSGTQ-------GVGSPQVSVESPTVLDSGTKEoooooooo
C14   GTSGTQ-------GVGNPQILVESPTVLEPGTKEoooooooo
C15   GTSGTQ-------GVGNPQILVEPSAVLEPGTKEEooooooo
C16   GTSGTQQSQGTETGVGGPQVLVESPGILGEGTENo-------
C17   GTSGTERVGSPoooooooooooooooooooooooo-------
C18   GTSGTQ-------GVGNPQALVESPAVLESGTKEoooooooo
C19   GTSGTE-------GVGSTQILVESPTVLESGAKEoooooooo
C20   GTSGTQQPQGTETGVGRPQISGESSVVLGTGTKNo-------
C21   GTSGTQ-------GVGTPQILVESPTVLESGTKEoooooooo
C22   GTSGTQQPQGTETGVGRPQVYWESPSILGSGTKEo-------
C23   GTPGTQQPPGTEIGVGGPQISVEHPVVLGSGTKEoo------
C24   GTSGTQQSQGTETGVERPQISGEPSVVLGPGTKNo-------
C25   GTSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSGILGSGTKEo-------
C26   GTAGTE-------GVGSSQVSGRSCAVLGSGTKEEooooooo
C27   GTSGTQ-------GVGNPQVLVESPAILESGTKEoooooooo
C28   GTSGTQQSQGATEGVGSPEIPGKPCAVLGSGAKKE-------
C29   GTPGTE-------GVGSTQILVESPTVLESGTKEoooooooo
C30   GTSGTQ-------GVGRPEILVESPTILESGTKEoooooooo
C31   GTSGTQ-------GVGSSQVLVEPPTVLESGTKEEooooooo
C32   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLDSGTKEoooooooo
C33   GTSGTQQSQGTTEGVGSPoooooooooooooooo--------
C34   GTSGTQQSQGTTEGVGSSooooooooooooooooo-------
C35   GTAGTQQSQGTTERVGSPooooooooooooooooo-------
C36   GTSGTQQSQGVETGVGRPQVSVESPVILGSGTKNo-------
C37   GTSGTQ-------GVGGPQVLLESPSVLESGTKEoooooooo
C38   GTSGTQQSQGTETGVGGPQVSGESTGILGSGTKEo-------
C39   GQGTEQ-------GVGNPPVLVEPPAILDSGTKEoooooooo
C40   GTSGTQ-------GVGSPQVLVESPAILDPGTKEoooooooo
C41   GTSGTQ-------GVGTPQILVEPPTILESGTKEoooooooo
C42   EQGAEE-------RVGNPQVSVESRAVLESGTKKoooooooo
C43   GDSGTQ-------GVGSNQVSVEPPAILDSGAEKoooooooo
C44   GTSGTQQSQGAETGVGRPQVSGESSVILGSGTESo-------
C45   GASGTQ-------GVGSPQISVESSTVLDSGAKEoooooooo
C46   GTSGTQ-------GVGSTQILVEPSTVLESGTKEoooooooo
C47   GTSGTQQPPGTPEGVGSPEISGKSCAVLESGAEKE-------
C48   GTSGTQQSQGVETGVGRPQVSGESPDILESGTKNo-------
C49   GTSGTQ-------GVGNPQILVECPTVLESGNKEoooooooo
C50   GTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooo

con