T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:09 - Revision 1613 - Build 432)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=88
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  90
C2    :  90
C3    :  80
C4    :  91
C5    :  86
C6    :  86
C7    :  91
C8    :  89
C9    :  89
C10   :  91
C11   :  90
C12   :  91
C13   :  90
C14   :  84
C15   :  89
C16   :  90
C17   :  89
C18   :  91
C19   :  68
C20   :  90
C21   :  90
C22   :  88
C23   :  89
C24   :  87
C25   :  90
C26   :  90
C27   :  90
C28   :  86
C29   :  89
C30   :  90
C31   :  89
C32   :  86
C33   :  86
C34   :  87
C35   :  90
C36   :  90
C37   :  85
C38   :  90
C39   :  89
C40   :  88
C41   :  89
C42   :  90
C43   :  90
C44   :  90
C45   :  89
C46   :  84
C47   :  90
C48   :  90
C49   :  89
C50   :  90
con   :  88

C1    MAGRSGDS-DEELLKAVRLIKLLYQSNPPPRPQG-TRQARRNRRR
C2    MAGRSGDS-DDELIKTVQLIKQIYQSNPPPSSEG-TRQARRNRRR
C3    MAGRSGDS-DEALLQAVKAIKILYQSNPYPEPKG-TRQARKNRRR
C4    MAGRSGDS-DEELLRAVRIIKILYQSNPYPKSKG-SRQARKNRRR
C5    MAGRSGDS-DEQLLWAVRVIKILYQSNPYPKLSG-SRQARRNRRR
C6    MAGRSGDS-DEELLKAVRYIKILYQSNPYPKPEG-TRQARRNRRR
C7    MAGRSGST-DEELLKAVRIIKILYQSNPYPSSEG-TRQARRNRRR
C8    MAGRSGDS-EEELLKAVRLIKFLYQSNPPPSPAG-TRQARRNRGR
C9    MAGRSGDS-DEELLKTVRIVKFLYQSNPPPSPAG-TRQARRNRRR
C10   MAGRSGNT-DEELLRIIQTIKILYQSNPYPPSEG-TRQARKNRRR
C11   MAGRSGDS-DEELLKAARLIKLLYQSNPYPKPEG-TRQARRNRRR
C12   MAGRSGDS-DEELLQVVRIIKILYRSNPYPKPRG-TRQARKNRRR
C13   MAGRSGST-DEELLAAVRIIKILYQSNPYPSSEG-TRQTRKNRRR
C14   MAGRSGDS-DEALLQAVRIIKILYQSNPYPKPRG-TRQARKNRRR
C15   MAGRSGSTDDEELLRVVRIIKILYQSNPYPSSEG-NRQTRRNRRR
C16   MAGRSGDP-DEDLIQAVRIIKILYQSNPPPPPEG-TRQARRNRRR
C17   MAGRSGDS-DEALLQAVRIIKILYQSNPHPSPEG-TRQARRNRRR
C18   MAGRSGDS-DEDLLRTVRIIKILYQSNPYPKPEG-SRQARRNRRR
C19   MAGRSDDV---PLLHTIRIIKILYQSNPQPSPIG-SRSARRNRRR
C20   MAGRSGST-DEELLRAVRIVKILYQSNPYPSSEG-TRQARKNRRR
C21   MAGRSGGT-DEELLQAVRIIKILYQSNPFPSPEG-TRQTRKNRRR
C22   MAGRSGS--DEELLLAIRTIKILYQSNPSPPPEG-TRQARRNRRR
C23   MAGRSGNS-DEELLKAVSIIKILYNSNPYPKPKG-SRQARRNRRR
C24   MAGRSGDS-DAELLQAVRIIKILYQSNPYPNPEGATRQARKNRRR
C25   MAGRSGNA-DAGLLSAVRIIRILYQSNPYPSAEG-TRQARKNRRR
C26   MAGRSGST-DEELLTTVRIIKILYQSNPIPPPEG-TRQTRKNRRR
C27   MAGRSGGT-DEELIKAVKIIKILYRSNPFPSSEG-TRQARKNRRR
C28   MAGRSGDS-DEALLQAVRIIKILYQSNPYPEPKG-TRQARKNRRR
C29   MAGRRGDS-EEDLIQTVKLIKLLYQSNPIPSPEG-TRQARRNRRR
C30   MAGRSGDS-DDELLKTVRLIKLLYQSNPPPCPEG-TRQARRNRRR
C31   MAGRSGDS-DEELLRTIRLIKILYQSNPLPSPEG-TRQARRNRRR
C32   MAGRSGDN-DEQLLAAIRAIRILYQSNPYPQQQG-SRQARRNRRR
C33   MAGRSGDS-DEALLKAVRIIKILYQSNPYPEPRG-TRQARKNRRR
C34   MAGRSGDN-DEALLQAVRTIKILYQSNPDPKPEG-TRQARKNRRR
C35   MAGRSGDS-DEELLKTVRLIKVLYQSNPLPSPEG-TRQARRNRRR
C36   MAGRSGDR-DEDLLQTVRFIKFLYQSNPPPSLEG-TRQARRNRRR
C37   MAGRSEDR-DEELLRTVRIIKFLYQSNPIPSPEGTTRQARRNRRR
C38   MAGRSGDS-DEELLRTVRLIKFLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRR
C39   MAGRSGDS-DEELLRAVRIIKILYQSNPFPSPEG-TRQARRNRRR
C40   MAGRSGST-DEELLRAVRIIRILYQSNPYPSAEG-TRQTRKNRRR
C41   MAGRSGDS-DEELIKTIRLIKRLYQSNPLPSPEG-TRQARRNRRR
C42   MAGRSGDS-DKKLLTAIRIIKILYQSNPYPKPRG-TRQARKNRRR
C43   MAGRSGDS-DEDLLKAVRLIKLLYQSNPPPSPEG-TRQARRNRRR
C44   MAGRSGST-DEELLRAVRIINILYQSNPFPPAEG-TRQTRRNRRR
C45   MAGRSGDA-DQELLRAVRIIKILYQSNPYPSSEG-TRQARKNRRR
C46   MAGRSGDS-DEALLQAVRIIKILYQSNPYPRPEG-TRQAQRNRRR
C47   MAGRSGDS-DEDLLKTVRLIKLLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRR
C48   MAGRSGDNSDEELLRAVRTIKILYQSNPLPPSEG-SRQARKNRRR
C49   MAGRSGDS-DEELLKTVRLIKTIYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRR
C50   MAGRSGDS-DEDLLKTVRLIKLLYQSNPPPNPEG-TRQARRNRRR

con   ****  .     *:     :. :*.*** *   * .*.:::** *


C1    RWRERDRTIRAISERILATCLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCNED
C2    RWRERQRHIREISGWILSTYLGRPTEPVPLPLPPLERLTLDCSEG
C3    RWRARQRQIHSLSERILSACLGRPAEPVPFQLPPIERLHIDCSKS
C4    RWRARQRQIDSISERILSTCLGRSTEPVSLQLPPLERLQLGCCED
C5    RWRARQNQIDSISERILSSCLGRSEEPVPLQLPPIERLRLDCTED
C6    RWRARQRQIHEISERILTTYLGRPTEPVLFQLPPLERLTINCSED
C7    RWRARQRQIRDISQRILNSCLGRSTEPVHLPLPPLERLHLDCNED
C8    RWRQRQRQIRSLSGWILSNYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSED
C9    RWRERQRHIQALSDWILRTHLGRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSED
C10   RWRARQRQIHSISERLLSTCVGRSTEPVPLQLPPLERLHIDCNED
C11   RWRARQSQIRAISERIIDTYLGRPEEPVPFQLPPLERLTLGCNED
C12   RWRARQRQIDSISERILSTFLGRSAEPVPLQLPPLERLHLDCQED
C13   RWRARQRQIRAISERILSTCVGRSTEPVPLQLPPLERLHLGCSED
C14   RWRARQRQIDSISERILSTCLGRSAEPVPLQLPPLERLHLD----
C15   RWRARQRQIRALSERFLSSCLGRSTEPVPLQLPPLERLNLDNNED
C16   RWRARQRQIHSISERILSSCLGRRAEPVPLQLPPLERLHIDCSED
C17   RWRARQRQIRAISERILSTYLGRSEEPVPLQLPPLERLNLNCNED
C18   RWRARQRQIDSIGERILSACLGRPAEPVPLQLPPLERLRLDCCED
C19   RWRRRQAQIDTLAARFLASVVHGPQDNNLVELPPLEQLSIRDPDG
C20   RWRARQRQIREISDRVLSSCLGRSPEPVPLQLPPLERLHLDCSED
C21   RWRARQRQIRAISERILSTCLGRSTEPVPLPLPPIERLNLDCSED
C22   RWRARQRQIREISERILSTCLGRPAEPVPLQLPPIERLNLHCSED
C23   RWRARQNQIDSLSERILSTCLGRPAEPVPLQLPPLERLCLDCQED
C24   RWRARQKQIHSISERILSSCLGRPAEPVPLQLPPIERLHIDCSES
C25   RWRARQRQISQISQRILSSCLGRSEEPVPLQLPPIERLRLDCSED
C26   RWRARQRQIHSISERILSTCLGRSTEPVPLQLPPLERLNLDCSED
C27   RWRARQKQISALSERILSACLGRPPEPVPLQLPPLERLQLNCSED
C28   RWRARQRQIHSISERILRTCLGRSAEPVPLQLPPIERLHIGGSES
C29   RWRERQRKINSLSAWILSTHLGRPEEPVPLQLPPLDRLTLDCSED
C30   RWRERQRQIRSISGWIIDTYLGRPEEPVPLQLPPLERLTLDCNED
C31   RWRARQRQIHSIGERILNTYLGRSEEPVPLQLPPLERLNLNCNED
C32   RWRARQNQIDSISQRILSSCLGRSEEPVPLELPPIERLHLDCSED
C33   RWRARQRQIHSISERILSACLGRPAEPVPLQLPPIERLHISGSES
C34   RWRARQRQIRAISERILSACLGRPAEPVPFQLPPIERLTIGDSES
C35   RWRKKQRWIRSISDWILRNHLGRSTEPVPLQLPPIERLTLDCNED
C36   RWRARQRQIGRISDWLLRNHLGRPAEPAPLQLPPLERLTLDCSED
C37   RWRERQRQIRDISQRILDTYLGRSQEPVPLQLPSLERLTLDCNED
C38   RWRERQRQIRSISDWILSNHLGRPAEPVPLQLPPIERLTLDCNED
C39   RWRARQRQIHSIGERILSTHLGRLEEPVPLQLPPIEKLNINCSED
C40   RWRARQRQIREISERILRSCLGRSAEPVPLQLPPLERLHLGCSED
C41   RWRERQRQIHKIGGWILSTYLGRPEEPVPLQLPPLDRLTLDCNED
C42   RWRARQEQINAISGRILSSFLGRPAEPVPLQLPPIERLRLDCSED
C43   RWREKQRQIRSISERILTTYLGRPAEPVPLQLPPLERLTLNCSEN
C44   RWRARQSQIRAISERILSTILGRPTEPVPLQLPPLERLHLDCSED
C45   RWRARQRQISALSERILSTCLGRPTEPVPLLLPPIERLSLDCTEG
C46   RWRARQRQINSISERILSTCLGRPAEPLPFLLPPIERLYIGDSEG
C47   RWRERQRHIRKISERILDTYLGRSEEPVPLPLPPLERLTLDCNED
C48   RWRARQRQIGAISERILRACLGRSAEPVPLQLPPLERLSLNCNED
C49   RWRERQRQIRTISNWILSTYLGRSTEPVPLQLPPIDRLTLDCNED
C50   RWRARQRQIRWLSTKLLSTYLDRPAEPVPLQLPPLERLTLDCSED

con   *** ::  *  :.  .:   :    :   . **.:::* :     


C1    CGTSGTP-------GVGTPQVLLESPTVLESGTKEoooooooooo
C2    CGTCGTQ-------GVGTPQVLVESPTVLESGTKEoooooooooo
C3    VGTSGTE-------GVGSPoooooooooooooooooooooooooo
C4    CGTSGTQQSQGVETGVGSPQVSVESPVVLGSGTKKooo-------
C5    CGNSGTQ-------GVGDPQIPGEPGVLLGTGTKEoooooooooo
C6    CGQGSER-------GVGSPQISVESHAALGSGIKEoooooooooo
C7    CGTSGTQQSQGTETGVGRPQIFGESSGILEPGTKNooo-------
C8    CGESGTP-------GEGNPQILVESPAILESGAKEoooooooooo
C9    CGTSGTQ-------GVGSPEILVESPAVLESGTKEEooooooooo
C10   SGTLGTQQSQGTETGVGGPQIPVESSVVLGSGTKEooo-------
C11   CGTSGTQ-------GVGSPQILVESPTVLESGTKEoooooooooo
C12   CGTSGTQQSQGVETGVGRPQVSVESPGILGSGTKNooo-------
C13   CGNSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSGILGSGTKNooo-------
C14   ---SGTQQSQGTETGVGRPQVSVESSAILGPGTKNoooooooooo
C15   CGTSGTQQSQGTEAGVGRPEISGECSVILGPGTKNoo--------
C16   SRATGTQQPPGTETGVGGPQTSVESPAVLGSGTKEEoo-------
C17   CGNSGTQ-------GVGSPQIPVESSTVLGSGTKEoooooooooo
C18   CGTSGTQQSQGTETGVGRPQVSGESPGILGSGTKEooo-------
C19   DQPSGT--------GTVDPRTEDNooooooooooooooooooooo
C20   CGISGTQQSQGTETGLGRPQISGESSDILEPGTKNooo-------
C21   CGTSGTEQSQGTETGVGRPQISGESSVILGSGTENooo-------
C22   SGTPGTQQPPGTEIGVGGPQISVEHPVVLGSGTKEoooo------
C23   CGTSGTQQSQGVETRVGRPQVSVESSGVLGSGAKEECH-------
C24   GGTSGTQQSQGTTEGVGSPoooooooooooooooooo--------
C25   CGTSGTQQSQGTETGVGSPQISGESSIILGSGTKEooo-------
C26   CGTSGTQQSEGTETGVGRPQISGESSVLLGPGTKNooo-------
C27   CGTSGTQQSQGTETGVGRSQISGEPSVILGSGTKNooo-------
C28   GGTSGTQ-------QLGSPQISGKSCAVLGSGAKKoooooooooo
C29   SADSGTQ-------GVGSPQILVEPSAVLESGTKEoooooooooo
C30   CGTSGTQ-------GVGNPQILVESPTVLEAGTKEoooooooooo
C31   CGTSGTQ-------GVGSHQISVESPAVLESGTEDoooooooooo
C32   CGNSGTQ-------GVGESQIPGESCTILGPRTEToooooooooo
C33   GGTSGTQQSQGTTERVGSPooooooooooooooooooo-------
C34   SGTSGTQQSQGTSEGVGNPooooooooooooooooooo-------
C35   CGTSGTQ-------GVGSPQISVESPAVLESGTEEoooooooooo
C36   CGTSGTQ-------GVGSPQILVESPAVLESGTKEoooooooooo
C37   CGTSGTQ-------GGGSPPVLVEPPAVLDSGTKNooooooooo-
C38   CGTSGTQ-------GVGNPQILVESPAILESGTKEoooooooooo
C39   CGTSGTQ-------GVGSHQVLVESPTVLDSGAKEoooooooooo
C40   SGTSGTQ-------GVGRPQISGESSDILEPGTKKoooooooooo
C41   CGTSGTQ-------GVGNSQVLVESPAVLESGTKEoooooooooo
C42   CGTSGTQQPQGAETGVGRSQVPEESSGILDTGTKNooo-------
C43   CGTSGTQ-------GVGSPQILVESPPVLETGTKEoooooooooo
C44   CGNSGTQQSQGTETGVGRPQISGESSGILGPGTKNooo-------
C45   RGTSGTQQSQGTETRVGSPQTSGESSVILGSGTKEooo-------
C46   SGTSGTQQSQGTTEREGSPooooooooooooooooooo-------
C47   CGTSGTQ-------GVGSPQILVESPTILESGTKEoooooooooo
C48   SGTSGTQQSQGTKTGVGSPQISVESSVILGSGTKEoo--------
C49   CGTSGTQ-------GVGSSQVLVESSTVLESGTKEoooooooooo
C50   CGTTGTQ-------GVGDPQILVESPAVLESGTKKoooooooooo

con       .                                        


C1    ---
C2    ---
C3    ---
C4    ---
C5    ---
C6    ---
C7    ---
C8    ---
C9    ---
C10   ---
C11   ---
C12   ---
C13   ---
C14   ---
C15   ---
C16   ---
C17   ---
C18   ---
C19   ooo
C20   ---
C21   ---
C22   ---
C23   ---
C24   ---
C25   ---
C26   ---
C27   ---
C28   ---
C29   ---
C30   ---
C31   ---
C32   ---
C33   ---
C34   ---
C35   ---
C36   ---
C37   ---
C38   ---
C39   ---
C40   ---
C41   ---
C42   ---
C43   ---
C44   ---
C45   ---
C46   ---
C47   ---
C48   ---
C49   ---
C50   ---

con