T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=91
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  90
C2    :  88
C3    :  92
C4    :  93
C5    :  92
C6    :  93
C7    :  92
C8    :  92
C9    :  91
C10   :  90
C11   :  91
C12   :  93
C13   :  91
C14   :  91
C15   :  90
C16   :  91
C17   :  92
con   :  91

C1    --------------MKELPQDVVIYILVMLPVKSLLRFKCSCKTF
C2    --------------MKELPQDVVIYIFVMLPVKSLLRSKCTCKTF
C3    ---------MVDGIMKKFHEDVVIYILFRLPVKSLMRLKCISKTW
C4    MKLDCKEYKMPDGIIMKLHQDIIIYMLLRLPVKFLLRFKCISKYC
C5    ---------MMDGTMKKLPEDMRIYILLRLPVKSLTRFKCVTKSW
C6    MKIALEEIHDGNGVVKKLPKDVVNNITLKLPVKSLLRFKCVSQFW
C7    ---------MGDEIVEKLPKDIVIYIFLMVPVKSLIRFKCVSKVW
C8    ---------MADEIVIKLPKDVVMYILLKFPVKSLLRFKRVSRNL
C9    ---------MADGIVIKLPKDVVTYIFLTFPVKSLLRLKCVSRNL
C10   --------------MKKFHEDMMIYILLRFPVKSLLRFKCISKVY
C11   -----------MTAMKKLPIYVVINILFRLPVKSLTRFKCVTKSW
C12   MKLYRKEYKMADRIIMKLPQDVFIHILLRLPVKLLLRFRCVSKSC
C13   -------MKMPHGIMKKLPEDVILCIFLRIPVKSLMRFKCVSKNY
C14   ---------MADGIIKKLSEDVVIFIFFRLPVKSLMRFKFVSKSF
C15   --------MMLDGIMKHLPEDISMYILLRFPVKSLLRFKFISKSW
C16   ---------MANGVLKKLPEDLVCLILLTFPVKSLMRFKCISKTW
C17   ---------MAEGILKRLFGDVMIYILLRLPLKTLLLFKCISKTF

con                 : .:   :   : . .*:* *   :   :  


C1    CNIIKSSTFIYLHLNHTT-NVKDELVLLKRSFKTDDYNFYKSILS
C2    CHIIKSSTFINLHLNHTT-NFNDELVLLKRSFETDEYNFYKSILS
C3    YTLMQSSNFINLHLNRIT-TYNDEVIFFKRSIK-LEPDLFKNILS
C4    HTLTKSSTFINIHLNRAT-TSEDEYILFKRSFK-EDVESYKGIFS
C5    HTLIQSFNFINFHLNRKS-TTKDEFILFRRSTK--HPDGFSHVLS
C6    YAYIQSWAFIILQRNCAS-SVNDEIILFKRSFK-EEHDHFKSIMS
C7    YTLIQSSTFINLHFNRTTATTKDEYMLVKRSFK-EESNRFRSVMS
C8    YTLIQSSIFINLHLNCNI-TTNDDLILFKRSLK-EEPNLFRSIMS
C9    HTFIQSSAFINLHLNRTS-IINEEFILFKRSLK-EEPDRFRNIMS
C10   YTLILSNTFVKLHLNRIR-TTKDEFVLFIRTFR-EEPDQLKSIAS
C11   YSLIQSADFINHHLNRAT-AIKDEFILFKRSFK--EQEGFRNVMS
C12   YTLIQSSTFINIHLHRTT-TSEDEYILFKRSFK-LDVESYKGVFS
C13   YTLLQSTTFINLHLNRTT-TVKDEFILLKRSFK-EDINQYKTIFS
C14   FSLIQSSSFINLYLYNTT--FRDEYILLKRCFI-QENNQYKTILS
C15   STLIESSTFINIHLNRAT-TTNNEFLLFSRSYR-EETEGFKNVLS
C16   SILIQSTTFINRHVNRKT-NTKDEFILFKRAIK-DEQEEFRDILS
C17   YNIIQSSTFINLHLNRTT-TTNDEFILFNRSIK-EAHNEFKSVMS

con        *  *:           .:: ::. *       :    : *


C1    FLSSKEGY--DFKSISPDVEIPHLTTTS-ACVFHQLIGPCNGLIA
C2    FLFAKKDY--DFKPISPDVKIPHLTTTA-ACICHRLIGPCNGLIV
C3    FLSSDNED--DLNPVSPDIDVPYLTSDY-CSRFHQLIGPCRGLIA
C4    FLSSNNGD--DLNCIFPDLDVPNMTSLY-SITQDKLIGPCHGLVA
C5    FLVDHEGK-DSLVPICPDIDMPYLTTGFASSTSHQFTGPSNGLIL
C6    FLSSGHDDSDDFHHVSPDLEVPYLTNTT-SCTFHRFIGPCHGLIV
C7    FLSGGLDD-DDLYPVSPDLDVPYLTTTN-SCTFHRIMGPCNGLIV
C8    FLSSGHDD-YDLHHVSPDLDVPYLTNTG-GCTFHRFMGPCHGLIV
C9    FLSSGHDN-YDLHHVSPDLDVPYLTTTG-ACTSHRFMGPCHGLIV
C10   FFSCDDNN--DLNTLSPDLDVSDLTSTC-DTIFNQLIGPSHGLIA
C11   FLVGGVGE-DDLDPISPDVDVPYLSTSY-SCICHQLTGPCHGLIL
C12   FYSSHNDD-GDLNSIFPDLDVPNMTSLY-SIDYDKIIGPCHGLIA
C13   FLSGDGDH-DYLNPIFSDFDVPNMTDTQ-SIIFDQLVGPCHGLIA
C14   FLAGGDDD--YLNPIFQDLDVTHLTSTR-NCDHDQLIGPCHGLMA
C15   ILSSGNED--NLIHTISDLDLPYLTFTQ-HYLFNKLVGPCNGLIV
C16   FLSGHDDV---LNPLFADIDVSYMTSKC-NCAFNPLIGPCDGLIA
C17   FYACSHDN-YDIHSISPDLDVPNMKPSI-SSVSHRLIGPCHGLIV

con   :          :     *..:. :.        . : **. **: 


C1    LTDSLTT-IVFNPATRKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFD
C2    LTDSLTT-IVFNPATLKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFD
C3    LTDFTVI-VLLNPATRKYRLLPGSPFVCPKGFTFVTR-GVGFGYS
C4    VMNVSST-ILLNPATRKYRLLPSSPFGVPKGFYRDIE-NGGFGFD
C5    LTDSLNF-LLLNPATRSYRLLPPNPFCCSRGFLRLIY-GVGFGYD
C6    LTDKVTT-VLFNPATRNYRLLKPSPFGSPLGFHRSIN-GIAFGFD
C7    LTDKITT-LLFNPATRSYRLLQPGLFGCPVGFHRSIN-GVGFGFD
C8    LTDCEET-VLFNPSTRNYRLLQPSPYDSPLGFHRSIN-GIAFGFD
C9    FTDGEETEVLFNPSTRNYRLLTPSPFDSPLGFHRSID-GIAFGFD
C10   LTDSFII-IVLNPATRKYIVLPPSPFGCPKGYHRSVE-GIGFGFD
C11   LTDSTNL-VLLNPATRNYRLLPPSPFGIQRGFYRSVA-GVGFGYD
C12   VMDSRST-ILFNPSTRKYRLLPSSPFGIPKGYYQSID-SGGFGFD
C13   LMDDFTT-IIFNPSTRIFRLLPPSPFDRPKGYHRSIK-CLGFGFD
C14   LMDTQTT-ILFNPSTRNYRPLRPSPFGCPQGFHRCIQ-AVGFGFD
C15   LTDFEII-VLFNPATKSYMLIPPSPFVCPKGFHRSFRGGVGFGFD
C16   LTDTIIT-IILNPATRNFRLLPPSPFGSPKGYHRSVE-GVGFGLD
C17   LTDTVET-ILLNPATRNYRILRPSPFDCPLGFCRSIV-GVGFGFD

con   . :     :::**:*  :  :    :    *:        .** .


C1    SDANDYKVVRLSEVYK-EP-----CDKEMKVDIYDFSVDSWREL-
C2    SDANDYKVVRLSEVYK-GT-----CDKKMKVDIYDFSVDSWREL-
C3    TAENYYKLVRIFEVYT-DPYDRDLDARHSKVEVYDSCTDCWRDLD
C4    SVVNDYKVFIISEVYT-EDRYGYPEEGERKVEVYELGIDVWRELD
C5    SIQKNYKVIRVSRVYG-DPPYNDRSEMSWESEVYDSGTDSWRQLT
C6    SIANEYKIVRLAEIRG-EPPFYCYTVREWRVEVYELSIDSWREVE
C7    SVANSYKIVRIAEVNG-EPPFYCYTMREWKVEIYESSVDAWREQD
C8    SIGNEYKIARLAELRG-EPPFNCFTMKEWRVEVYELSIDSWREIE
C9    SIGNDYKIVRIAELHG-EPPFNCFSTREWRVEVFEMSIDSWREVE
C10   SIVNDYKVVRLSDVYW-DPPTDYPGPREPKVDIYDLGIDSWREL-
C11   SVHKTYKVVRISEVYG-EPPFNCPSVMEWKGEVYNSSTDSWRELD
C12   SVVNDYKVFRISDVYT-EDRYGYPEEGERKVEVYEVGIDIWRELD
C13   SVVNDYKVVRISEFLK-DDCYGYVQVEEENVEIYELGIDCWRELD
C14   TVSNDYKVVRISIIYKVDYDDEYPEERERKFEVYDLGIDYWRELD
C15   SIVKDYKFVTISEVFK-DSEW-VPDEKEQKVEVYDMRIDSWRDLN
C16   TISNYYKVVRISEVYC-EEDGGYPGPKDSKIDAFDLSTDSWRELD
C17   SIASDYKIVRVLEDYG-DPPFYDFALRKWKIDVHELTIDSRRELD

con   :  . **.  :                  . : .:   *  *:  


C1    -LGQEVPIVYWLPCAEILYKRNFHWFAFAD--DV-VILCFDMNTE
C2    -LGQDVPFVFWFPCAEILYKRNFHWFAFAD--DV-VILCFDMNTE
C3    LTVKLLPKVRRFACSEIFYKETFHWCAHDD--AV-MILCFDISPE
C4    HVDQQLPKLFWMTSS-MPYNGTYHWLITLSYEHRLILLCFDMSTE
C5    NVDQELPGPYMHPYSELFYKGTFHWYAQGH--MR-LLLCFDINTE
C6    NVDRQLPYVHWYPCAELFYKGTSHWFGNTN--TV-VILGFDMSTE
C7    QVYRQLPNVFWYPCSEMFYKGASHWFAHAN--TM-VILCFDMITE
C8    NVDQQLPYVHWYPCGELFYKGASHWFGHAN--RARVILCFDMSTE
C9    NVDQQLRYVHWYPSADLFYKGASHWFGNEN--RVHVIVCFDMCTE
C10   D--VEFPPIYYLPCSEMYYKEAVHWFIVTE--TV-VIFCFDISTE
C11   CVDQELPWPYNFAYSEIFYEGAFHWYAHKN--VV-LILCFDVNTE
C12   HVDQDLPRLFWLTSS-MYYNGAYHWITTLNHEDKLIILCFDMSTE
C13   HVNQQFPTIFWVPCSQIFYMGTFHWIAQR------VILCFNMSTE
C14   NLSQELTTFCVTHCSQMFYKGACHWIASLDI-DAYIILCFDMSSE
C15   HVDQQLPTVYYYPCFEMLYNGAFHWYAINDLFDH-VILSFDISTE
C16   H--VQLPLIYWLPCSGMLYKEMVHWFATTD--MSTVILCFDMSTE
C17   YMELQLPHIHRYPCSEMFYNGATHWFGRTE--TV-VILCFDMSTE

con        .          : *    **          ::. *:: .*


C1    KFHNLGMPDACHFDDGKCYGLVILCKCMTLICYPDPMPS-SPTEK
C2    KFHNMGMPDACHFDDGKSYGLVILFKCMTLICYPDPMPS-SPTEK
C3    TFHYMKLPDHCHFWDNKGYGLTVLSNYLTFITYPNPRCALDPGQE
C4    IFRYIKTPNTRYFSSGTRHSLVLLNDCLSFMCHPFPGPEIDPTKD
C5    NFRTMQVPKTCAVRDEKCHSLVVFDECLTFICYPDPRRESSPVQE
C6    TFRNIKMPNTCHFKDRKCYGLVVLNESLTLICYPYPGCEIDPAID
C7    TFRRMKFPNTCHFQDENCYSLVILNDSLTLIVYPYPEKVVEHEKD
C8    TFRDIKMPNTCHYKDRKCYGLVVLNECLTLICYPYPGCVIDPAID
C9    IFRTFKMPSTCHYKDKNFYCLVVLNKCLTLICYPYLGYEIDPAID
C10   TFRTMKMPGSCTFFDGPRYGLAILNGHLTLICYPDPMSSIDPTED
C11   TFRTMEVPEPCASYDEKCHSLLVLDEFLTLFCYPDPRRESSPIQE
C12   IFRNINTPDTRQFSSGTCHSLVLLDECLSFMCHPYLGPEIDPTTD
C13   IFHHIRMPDPCH--NIRNHSLVILNESLTLICYRSVAPTSDPIED
C14   TFRSLKIPESCHIIYGPTCKLALVHDTLTLIYYPYPEPEIPVEKD
C15   IFYSIKMPAT----GAKYYGLIVLNESLTLICYPNPDNKMDPTKD
C16   MFRNMKMPDTCSVTHKQYYGLVILCESFTLIGYPNPVSPIDPAHD
C17   TFRNMKMPDACHFKDRKSYGLVVLNDSLTLICYRHPGCIIDPTKD

con    *  :  *            * :.   :::: :           .


C1    LTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWMDEILLLQS
C2    LTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWKDEILLLHS
C3    FTDIWIMEEYGVNGTWIKKYTIRPLPI--ESSLSIWKDHLLLLQS
C4    FIDIWMMKDYNVYESWINIYTIRILPIH-EFPLAIWKDSLLFFQG
C5    TIEIWIMQEYSVNESWIKKYTIRPPPI--ESPLAIWKDRLLLLQD
C6    FMEIWIMKEYGVNDSWSKKYTIVPLAI--ESPLAIWKNHLLLLQS
C7    FMEIWIMMEYGVDESWIKKYSITPLSI--ETPLAVWNDHLLLLES
C8    FMEIWMMKEYGVSESWNMKYKITPLAI--ESPLAVWKDHLLLLQS
C9    FMEIWIMKEYGIYESWSKTYRIRPLAI--ESPLAIWKDHLLLLQS
C10   LIEIWMMKEYGASESWIKIYTIKPVPIPIESPLAIWKDHLLLLQT
C11   TIEIWTMQEYKVNESWIKKHTIKSPPI--ESPLAIWKDRLLLFQD
C12   LIDIWMVKDYNVYESWIKKYTIRVLPID-ESPLAVWKDSLLFFQE
C13   LIEIWILKDYDVSESWVKKYTIRSLPI--KIPLAIWKDNLLLFQN
C14   LINIWFMKEYNVYESWIRKYTIRGLLI--DSPLTVWKGYLLLYQS
C15   SMDIWIMMEYGVYESWTKKYIIKPLPI--ESPLTIWRDHLLLLQS
C16   KMHIWVMMEYGVSESWIMKYTIRPLSI--ESPLAVWKKNILLLQS
C17   FMEIWTMKEYGVGESWIKKYTITPLSI--QSPLAVWKNHFLLFEY

con     .** : :*    :*     *       . .*::*   :*: . 


C1    K-IGHLIAYDHNSDEVKELDLHGLPTSLRVIIYRESLTLIP-RSK
C2    K-MGHLIAYDLNSNEVQELDLHGYPESLRIIIYRESLTAIP-RNN
C3    T-SGTLGSYNLRSDELKEFNFQGFTSTLRLVIYKESLTIIP-RES
C4    K-TGYLISYNLNTDEVKELSLNGCKRSIRAIVYKESLAPIP-EGS
C5    K-SGVLISYDLNLDEVKESKLHGHPESLRVIVYKESLTPIP-IGS
C6    I-TGHLISYNLNSDEIKEFNLHGWPKSLRVKIYKESLTLIP-KES
C7    R-SGSLISYDLNSGEVKQLNLHCWPTSFRIAVYKESLTLIP-EER
C8    I-SGHLISYDLNTDEVEEFNLNGWPESLRVNVYKESLALIP-KDR
C9    I-SGYLISYDLNSGEVKEFELNGWPDSLRVTVYKESLALIP-NSK
C10   K-RGFLISYDLNSNDVKEFNLNCNFESLRVVVYTESLTAIS-RIS
C11   K-SGILISYDLNSDEVKEFKLDGYPATLRVIIYKESLTPIP-KGS
C12   K-SGYLMSYDFKSEEVKEWNLHGCQKSMRAIVYKESLVPIP-RGS
C13   R-SGYLMVYDLRTDNVKELNIHGCPESMRVTVYKENLTIIP-SGS
C14   R-SGFLMSYNLNSNDIREFNFHGYPKSLRAIVYKDSLTSIP-RES
C15   K-SGLLVSYDLSSNEVKEFDLHGYPTSLRVIVYKESLISIPKRGC
C16   R-SGLLISYDLNSGQAKELNLHGFPDSLSVIVYKECLTSIQ-NGS
C17   RPSGVLFSYDLNSDDVKELNLHGWPQSLRVTIYKESLTLIP-KGS

con      * *  *:    : .: .:.    ::   :* : *  *     


C1    D-SIDLEQFooooooooooooooooooooooooooo
C2    D-CIELQNFRCNoooooooooooooooooooooooo
C3    EDGTKVQTFooooooooooooo--------------
C4    ESSTQVHNFo--------------------------
C5    ---TQVENFooooooooooooooo------------
C6    EFNTAQooooo-------------------------
C7    EHSTKCPKILESoooooooo----------------
C8    EHNIRLSIoooooooooooo----------------
C9    RPRAooooooooooooooo-----------------
C10   EHGTKVQQFooooooooooooooooooo--------
C11   ---THVQNFoooooooooooooooooo---------
C12   QSSTQLQNI---------------------------
C13   ESNTPVYKFooooooooooooooo------------
C14   EHTKQVYKFLoooooooooo----------------
C15   EHGTKIINCooooooooooooo--------------
C16   EYSTKVQNFooooooooooooooo------------
C17   SIVLKFKIoooooooooooo----------------

con