T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame
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SCORE=91
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BAD AVG GOOD
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C1 : 92
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C6 FTLIQSSVFINLHLNRNITANDEFILFKRSLK-DEPNLFRSIMSF
C7 HTLIQSSAFINLHLNRTSIINEEFILFKRSLK-EEPDRFRNIMSF
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C9 YTLILTNTFVKLHLNRITTTKDEFILFIRTFR-EEPEQLKSIASF
C10 YALIQSVDFINRHLNRATTITDEFILFKRSFK--EQEGFRNVMSF
C11 YTLIQSSTFINIHLHRTTTSEDEYILFKRSFK-EDVESYKGIFSF
C12 YTLLQSTTFINLHLNRTTTVKDEFILLKRSFK-EDINQYKTIFSF
C13 FTLIESSTFINLYLYNTTASRDEYILLKRCFI-QENNQYKTILSF
C14 STLIESSTFINIHLNRATTTKNEFLLFSRSYR-EETEGFKNVLSI
C15 CNIIKSSTFINLHLNHTTNVKDELVLLKRSFKTDEYNFYKSILSF
C16 YSLLQSTIFINLHLNSTTTVKDEFILLKRSFK-EDINQYKTIFSF
C17 YTLIQSSAFVDLHLNRKTTSKDECILLKRSLE-EGINRYKTSLSF
con : : *:. :: * ::: * : *:
C1 LSSFQDNNCLHHVSPDIEVPHLTTTT-SCIFQRLIGPCHGLIALV
C2 LFAKEDY-DFKPISPDVEIPHLTTTA-ACICHRLIGPCNGLIVLT
C3 LYSDNED-DLTPVYPDINVPYLTSDY-CSRFHQLIGPCRGLIALT
C4 LSGNGD--DLNCIFPDLDVPNMTSLY-SITQDKLIGPCHGLVAVM
C5 LVDHEGKDDLDPICPDIDMPYLTTGFASSTSHQFTGPTNGLILLT
C6 LSSGHDDYDLHHVSQDLDVAYLTNTG-GCTFHRFMGPCHGLIVLT
C7 LSSGHDNYDLHHVSPDLDVPYLTTTG-ACTSHRFMGPCHGLIVFT
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C9 LCCDDNN-DLNSLFPDLDVSDLTSTC-YTIFNQLIGPCHGLIALT
C10 LVGGVGEDDLDPISPDVDVPYLSTSY-SCICHQLTGPCHGLILLT
C11 YSSHNDDGDLNSIFPDLDVPNMTSLY-SIDYDKIIGPCHGLIAVM
C12 LSGDGDHDYLNPIFSDFDVPNMTDTQ-SIIFDQLIGPCHGLIALM
C13 LAGDDDD-YLNPIFQDLDVTHLTSTR-NCDHDQLIGPCHGLMALM
C14 LSSGNND-DLIPVVSDLELPYLTFTE-YYLFNKLVGPCNGLIVLT
C15 LYSKEDY-DFTPISPDVEIPHLTTTS-ACVFYQLIGPCNGLIALT
C16 LSGDGDHDYLNPIFPDFDVPNMTDTQ-NIIFDQLIGPCHGLIALM
C17 LCGDDHD-YLSPIIHDVDVTHLTTNC-NFCHDQLVGPCHGLIALM
con : : *.::. :: : ** **: .
C1 DNISV-VLFNPATRSYRLLKPSPFGCPFGFRRSIN-GIAFGFDSI
C2 DSLTT-IVFNPATLKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFDSD
C3 DFTVI-VLLNPATRKYRLLPGSPFVCPKGFTFVTR-GVGFGYSTT
C4 NVSSI-ILLNPATRKYRLLPSSPFGVPKGFYRDIE-NGGFGFDSV
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C11 DSRST-ILFNPSTRKYRLLPSSPFGIPKGYYRSID-SGGFGFDSV
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C13 NTQTT-ILFNPSTRNYRPLRPSPFGCPQGFHRCIQ-AVGFGFDTV
C14 DFEII-VLFNPATKNYMLIPPSPFVCPKGFHRSFRGGVGFGFDSI
C15 DSLTT-IVFNPATRKYRLIPPCPFSIPRGFRRSIS-GIGFGFDSD
C16 DDLTT-IIFNPSTRNFRLLPSSPFDRPKGYHRSIK-GLGFGFDSV
C17 HSPTT-VLFNPSTRKYKLLPPSPLRHLKGFYRSME-GEGFGFDSI
con . :::**:* : : * *: .**:.:
C1 TNEYKIVRLAEVRGQPPFY-CLSLRELRVEVYELSIDSWREVEHV
C2 ANNYKVVRLSEVYKEPCD------KEMKVDIYDFSVDSWREL--L
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C6 GNEYKIARLAELRGEPPFN-CFTMKEWRVEVYELSIDSWREIENV
C7 GNDYKIVRIAELLGEPPFN-CFSTREWRVEVFEMSIDSWREVENV
C8 SNYYKVVRISEVYCEEADG-YPGPKDSKIDVCDLSTDSWRELDHV
C9 VNDYKVVRLSDVYWDPPTD-YPGPREPKVDVFDLAIDSWRELDL-
C10 HKTYKVVRISEVYGEPPFN-CPSVMEWKGEVYNSSTDSWRELDCV
C11 VNDYKVFRISDVYTEDRYG-YPEEGERKVEVYEVGIDIWRELDLV
C12 VNDYKVVRISEFLKDDCYG-YVQVEEENVEIYELGIDCWRELNHV
C13 SNDYKVVRISIIYKVDYDDEYPEERERKFEVYDLGIDYWRELDNL
C14 VKDYKFVTISEVFMDSEW--VPDEKEQKVEVYDLRFDSWRDLNHV
C15 ANDYKVVRLSEVYKEPCD------KEMKVDIYDFSVDSWREL--L
C16 VNDYKVVRISEFLKDDCYG-YVQVEKENVEIYELGIDCWRELDHV
C17 INNYKVVKISTIYKVDHFD-YLEEIGRKVEVYDLSTDSWRELDHV
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C1 DQQLPFVRLYPCSELFYKGSSHWFA---NTNTV--VILCFDMTTE
C2 GQDVPFVFWFPCAEILYKRNFHWFA---FADDV--VILCFDMNTE
C3 VKLLPKVRRFACSEIFYKETFHWCA---HDETV--MILCFDISLE
C4 DQQLPKLFWMTSS-MPYNGTYHWLITLSYEHRL--ILLCFDMSTE
C5 DQELPGPYMHPYSELFYKGTFHWYA---QGHKR--LLLCFDINTE
C6 DQQLPYVHWYPCGELFYKGASHWFG---HANRA-RVILCFDMSTE
C7 DQQLRYVHWYPSADLFYKGASHWFG---NENRV-HVIVCFDMCTE
C8 --QLPSIYWVPCAGMLYKEMVHWFA---TTDTS-MVILCFDMSTE
C9 --EFPSIYYLPCSEMYYKEAVHWFI---IRDTV--VILCFDISTE
C10 DQELPWPYNFAYSEIFYEGAFHWYA---HKNVV--LILCFDVNTE
C11 DQDLPRLFWLTSS-MYYNGAYHWITTLNHEDKL--IILCFDMSTE
C12 NQQFPTIFWVPCSQIFYMGTFHWIA------QS--VILCFNMSTE
C13 SQELTTFCVTHCSQMFYKGACHWIA---SLDIEAYIILCFDMSSE
C14 DQQLPTVYYYPCFEMLYNGAFHWYA---INDRLEHVILSFDISTE
C15 GQEVPIVYWLPCAEILYKRNFHWFA---FADDV--VILCFDMNTE
C16 NQQFPKIFWVPCSQIFYMGTFHWIA------QR--VIHCFNMSTE
C17 AQELTTLCCVECTQMFYKGACHWIA---TQDLDAFRILCFDMSSE
con . : * ** : .*:: *
C1 TFRNIKMPNTC-HFEDRKCYGLVILNEYLTLICYPYPGCEINPEM
C2 KFHNMGMPDAC-HFADGKSYGLVILFKCMTLICYPDPMPS-SPTE
C3 TFHYMKLPDHC-HFWDNKGYGLTVLNNYLTFITYPNPRCALDPGQ
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C5 TFRTMQVPKTC-AVRDEKCHSLVVFDESLTFICYPDPRRESSPVQ
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C7 IFRTFKMPSTC-HYKDKNFYCLVVLNKCLTLICYPYLGYEIDPAI
C8 MFHDMKMPDTCSRITHELYYGLVVLCESFTLIGYSNPISSIDPVE
C9 IFRIMEMPGSC-TFLDGPRYGLAILYECLTLICYPDPMSSDDPTE
C10 TFRTMEVPEPC-ASYDEKCHSLLVLDEFLTLFCYPDPRRESSPIQ
C11 IFRNINTPDTR-QFSSGTCHSLVLLDECLSFMCHPYLGPEIDPTT
C12 IFHHIRMPDPC-H--NIRNHSLVILNESLTLICYSSVAPTSDPIE
C13 TFRSLKIPESC-HIINGPTCRLALVHDTLTLIYYPYPEPEIPLEK
C14 IFHSIKTPAIG-KSSGGKKYGLIVLNESLTLICYPNPDCEMDPSK
C15 KFHNIGMPDAC-NSNDGKCYGLVILCKCMTLICYPDPMPS-SPTE
C16 NFHHIRMPDPC-H--NIRNHSLVILNVCLTLICYRSIAPTSDPIE
C17 VFRSLKIPENC-HLFEGPWCRLALIQESLTLIYYRYPDQSTAQGK
con *: : * * :. :::: :
C1 DFMEIWVMNDYGVNESWIKKSTLTPLPI--ESPLAIWKDHLLILQ
C2 KLTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWKDEILLLH
C3 EFTDIWIMGEYGVNGTWIKKYTIRPLPI--ESSLAIWKDHLLLLQ
C4 DFIDIWMMKDYNVYESWINIYTIRILPIH-EFPLAIWKDSLLFFQ
C5 ETIEIWIMQEYSVNESWIKKYTIRPPPI--ESPLAIWKDRLLLLQ
C6 DFMEIWIMKEYGINESWCMKYKLTPLAI--ESPLAIWKDHLLLLQ
C7 DFMEIWIMKEYGIYESWSKTYRIRPLAI--ESPLAIWKDHLLLLQ
C8 DKMHIWVMMEYGVSESWIMKYTIRPLSI--ESPLAVWKNHILLLQ
C9 DLIDIWIMEKYGISESWIKKYTIRPVPIPIESPLAIWKDQLLLLQ
C10 ETIEIWTMQEYRVNESWIKKHTIKSPPI--ESPLAIWKDRLLLFQ
C11 DLIDIWMMKDYNVYESWTKKYTITVLPID-ESPLAVWNDSLLFFQ
C12 DLMEIWILKDYDVSESWVKKYTIRSLPI--KIPLAIWKDNLLLFQ
C13 DLINIWFMKEYNVYESWIRKYTIRGLLI--DSPLTGWKGYLLLYQ
C14 DSMDIWIMMEYGIYESWTKKYIIKPLPI--ESPLTIWRDHLLLLQ
C15 KLTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWKDEILLLQ
C16 DLMEIWILKDYDVSESWVKKYTIRSLPI--KIPLAIWKDNLLLFQ
C17 DSSVVWIMKDYSVHESWVKNYTITSVPI--HSPLAVWKGYLLVFE
con . :* : .* :* : . .*: *.. :*. .
C1 TISGHLISCNLNSNEVKQFNLHGWPKSLRVTIYKESLHNTRSTT-
C2 SKMGHLIAYDLNSNEVQELDLHGYPESFRIIIYRESLTAIPRNND
C3 SISGTLSSYNLNSDELKEFNFQGFTSTLRLVVYKESLTIIPRDSE
C4 GKTGYLMSYNLNTDEVKELSLNGCKRSMRAIVYKESLAPIPEGSE
C5 DKSGVLISYDLNLDEVKEFKLRGHPESLRVIVYKESLTSIPIGT-
C6 SISGYLISYDLNSDEIKEFELNGWPESLRVNIYKESLALIPKDQ-
C7 SISGYLISYDLNSGEVKEFELNGWPDSLRVTVYKESLTLIPNSK-
C8 SRSGLLISYDLNSGEAKELNLHGFPDTLSVKVYKECLTSIPKGSE
C9 TKSGFFIAYDLTSDELKEFNLNGHFESLRVIVYTENLTTITRISD
C10 DKSGILISYDLNSDEVKEFKLDGYPATLRVIIYKESLTPIPKGS-
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C15 SKMGHLIAYDHNSDEVKELDLHGLPTSLRVLIYRESLTPIPRSND
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C17 GKSGCLMSYDLICNKIKELNFHGFPESLRALVYKDSLISIPIGSE
con * : : . : .: * :: :* : *
C1 -LERIISLTooooooooooooo--------
C2 -CIELQNFRCSooooooooooooooooooo
C3 HGTKVQNFooooooooooooo---------
C4 SSTKVHNFooooooooooo-----------
C5 --TQVEKFooooooooooooooo-------
C6 -CKEooooooooooooooooo---------
C7 --RPRAooooooooooooooo---------
C8 YSTKVQKFoooooooooooooo--------
C9 NGTQVQQFooooooooooooooo-------
C10 --TQVQNFoooooooooooooooooo----
C11 SSTQLKNI----------------------
C12 SSTPVHKFooooooooooooooo-------
C13 HTKQVYQFoooooooooo------------
C14 -CKHGTKFoooooooooooo----------
C15 -SIELQQFoooooooooooooooooooooo
C16 NSTPVHKFooooooooooooooo-------
C17 HSAQVHRFooooooooooo-----------
con