T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=90
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BAD AVG GOOD
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C1 : 88
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con : 90
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C2 ---------MVDGIMKKFHEDVVIYILLRLPVKSLMRLKCISKTW
C3 ----------MDGTMKKLPEDMRIYILLRLPVKSLMRFKCVTKSW
C4 --------MMADGVVKKLPKDVVNNITLKLPVKSLLRFKCVSQFW
C5 ---------MSDEIVIKLPKDVVMYMLLKFPVKSLLRFKRVSRNL
C6 --------------MKKLPEDVVIYILFRLPVKSLTRFKRVTKRW
C7 ---------MAEGILKRLFGDVMIYILLRLPLKTLLRFKCISKTF
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C9 ---------MADRITKRLTQDVIVHILIRLAVKPLMRLKCVSKSC
C10 ---------MANGILKKLPEDLLFLILLTFPVKSLMRFKCISKAW
C11 -------------MMKKLPIDVVIYVLLKFPVKSLMRFKCISKAL
C12 --------------MKKLPKDVVINILFRIPVKSLFRFKCVTKSW
C13 MKLNSKKYKMSDRIIMKLPQDVFIYILLRLTVKLLLRFRCVSKSC
C14 -------MKMPHGIMKKLPEDVILCIFLRIPVKSLMRFKCVSKNY
C15 ---------MADGIIKKLSEDVVIFIFFRLPVKSLMRFKFVSKSF
C16 --------MMLDGIMKHLLEDIAMYILLRFPVKSLLRFKFISKSW
con : *: : . :.:* * *:: :
C1 CHIIKSSTFINLHLNHTT-NFNDELVLLKRSFETDEYNFYKSILS
C2 YTLIQSSTFINLHLNRTT-AYNDELIFFKRSIK-LEPDLFKNILS
C3 HTLIQSFNFINIHLNRKT-TTKDEFILFRRSIK--HPDGFNHVLS
C4 CAYIQSWAFIILHRNCAS-SVNDEIILFKRSFK-EEHDHFKSIMS
C5 YTLIQSSVLINLHLNRNI-SANNEFILFKRSLK-EEPNLFRSIMS
C6 YSLIRSSSFINLHLTGATNTIKDELILFKRSFK--KREGFKNVLS
C7 YNIIQSSTFINLHRNRTT-TTNDEFILFNRSIK-EAHNEFKSVMS
C8 CNIIKSSTFINLHLNHST-NVKDELVLLKRSFKTDEYNFYKSMLS
C9 YTLIKSSTFLNLHIHRKT-TSKDELILFKRSFK-QNTGQYTTILS
C10 SILIQSTTFINCHANRKT-NTKDEFILFKRAIK-DEEEEFINILS
C11 YILILNNTFVKLHLNRIT-STKDELILFIRTFR-EEPEQLKSIAS
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C13 YTLIQSSTFINIHLDRTT-TSEDEYILFKRSFK-EDVESYKGIFS
C14 YTLLQSTTFINLHLNRTT-TVKDEFILLKRSFK-EDINQYKTIFS
C15 FALIQSSTFINLYLYSPT-TSRDEYILLKRCFI-QENNQYKTILS
C16 STLIESSTFINIHLNRAT-TAKNEFLLFSRSYR-EETEGFKNILS
con : . : : .:* ::: * : *
C1 FLFAKE-DYDFKPISPDVEIPHLTTTA-GCICHRLIGPCNGLIVL
C2 FLSSDN-EDDLTPVYPDIDVPYLTSDY-CSRFHQLIGPCRGLIAL
C3 FLVDREGKDDLDPICPDIDMPYLTTGFASSTSHQFTGPSNGLILL
C4 FLSSGHDINDFHHVSPDLEVPYLTNTT-SCTFHRFIGPCHGLIVL
C5 FLSSGHDDYDLHHVSPDLDVPYLTNTG-GCTFHRFMGPCHGLLVL
C6 FLLGSNAEDDLDPISSGQDVPYLSTRY-SSISHQLTGPCHGLIVL
C7 FYACSHDNYDIHSISPDLDVTNMKPSI-SSVSHRLIGPCHGLIVL
C8 FLSSKE-DYDFEPISPDVEIPHLTTTS-ACVFHQLIGPCNGLIAL
C9 FLSGDD-DDYLNSIFPDLDVTHLTSIH-HYNNDQLVGPCHGLIAL
C10 FFSGHN--DVLNPLFPDIDVSYMTSKC-DCAFNPLIGPCDGLIAL
C11 FFSCDD-NNDLHTLHPDLDVSDLTSSC-CTIFNELIGPCHGLIAL
C12 FLLCGIGDDDLDPFSPDVDVPYLSTSY-SCICHQLTGPCHGLILL
C13 FYSSHNDDGDLNSIFPDLDVPNMKSLY-SIDYDKIIGPCHGLIAV
C14 FLSGDGDHDYLNPIFSDFDVPNMTDTQ-SIIFDQLIGPCHGLIAL
C15 FLSGDD-DDYLNPIFQDLDVTHLTSTR-NCDHDQLIGPCYGLMAL
C16 ILSSDN-SDDLIPIISDLELPYLTFTE-YYLFNKLVGPCNGLIVL
con : : . . ::. :. . : **. **: :
C1 TDSLTTIVFNPATLKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFDSD
C2 TDFTVIVLLNPATRKYRLLPGSPFVCPKGFTFVTR-GVGFGYSTA
C3 TDSLNFLLLNPATRSYRLLPPNPFCCPRGFLRLIY-GVGFGYDSI
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C6 TDSTNFVLLNPATRNYRLLPPSPFVCPRGLYRSIG-GVGFGYDFI
C7 TDTVETILLNPATRNYRILRPSPFDCPMGFCRSIV-GVGFGFDST
C8 TDSLTTIVFNPSTRKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFDSD
C9 MDSHITILFNPSTRIYKLLPPNPFGCQKGFFDSTE-AVGFGFDSI
C10 TDSIITIILNPATRNFRVLPPSPFGCPKGYHRSVE-GVGFGLDTI
C11 ADSFIIIILNPSTRKYVVLPPSPFECPKGYHRSVE-GIGFGYDPI
C12 TDSTNLVLINPATRNYRLLPSSPFGVQRGFYRCFA-GVGFGYDSI
C13 MDSRSTILFNPSTRKYRLLPSSPFGTPKGYYRSID-SGGFGFDSV
C14 MDDFTTIIFNPSTRIFRLLPPSPFDRPKGYHRSIK-CLGFGFDSV
C15 MDTQTTILFNPSTRNYRPLRPSPFGCPQGFHRCIQ-AVGFGFDTV
C16 TDFEIIVLFNPATKNYMLIPPSPFVCPKGFHRSFRGGVGFGFDSI
con * :::**:* : : *: * .** .
C1 ANDYKVVRLSEVYKEPCD------KEMKVDIYDFSVDSWREL--L
C2 ENYYKLVRIFEVYTDPYDR-DLDARHSKVEIYDSCTDCWRDLDLT
C3 QKNYKVIRVSRVYGDPPYN-DRSEMSWESEVYDSSTDSWRQLANV
C4 ANEYKIVRLAELRGEPPFY-CYSMREWRVEVYELSIDSWREVENV
C5 GNEYKIARLAELRGEPPFN-CFTMKEWRVEVYELSIDSWREIENV
C6 QKNYKVVRISEVYGEPPFN-CPSVMEWKGEVYDSSTDSWRELAYV
C7 ANDYKIVWVLEDYGDPPFY-CYGLSKWKIDVYELTIDSWRELDYI
C8 ANDYKVVRLSEVYKEPCD------KEMKVDIYDFSVDSWREL--L
C9 ANDYKVVRISIIYIVN-DG-YPDEHERKVQIYNLSNDYWREIDHA
C10 SNYYKVVRISEVYCEEADG-YPGPKDSKIDVCDLSTDSWRELDHV
C11 VNDYKVVRLSDVYWDPPTD-YFGPREPKVDIYDLGIDSWREL---
C12 EKTYKVVRISEMYGEPPFN-CPSVMEWKGEVYDSSIDSWREVAGV
C13 VNDYKVLRISDVYTEDRYG-YPEEGERKVEVYEVGIDIWRELDHV
C14 VNDYKVVRISEFLKDDCYG-YVQVEEENVEIYELGIDCWRELDHV
C15 SNDYKVVRISIIYKVDYDDEYPEERDRKFEVYDLGIDYWRELDNL
C16 VKDYKFVTISEVFMDSEW--VPDEKEQKVEVYDLRFDSWRDLNHV
con : **. : . :: : * **::
C1 GQDVPFVFWFPCAEILYKRNFHWFA---FADVV--VILCFEMNTE
C2 VKLLPKVRRFACSEIFYKETFHWCA---HDDTV--MILCFDISLE
C3 DQELPGPYMHPYSELFYKGTFHWYA---QGHMR--LLLCFDINTE
C4 DQQLPYVHWYPCAELFYKGTSHWFG---NTNTV--VILGFDMSTE
C5 DKQLPYVHWYPCGELFYKCAAHWFG---HANRAR-VILCFDMSTE
C6 DQELPWPYNFPYSEMFYNGAFHWNA---HRNMV--VILCFDISTE
C7 DLEWSFVYRYPYSDMFYNGATHWFG---GRETV--VILCFDMSTE
C8 GQEVPIVYWLPCAEVLYKRNFHWFA---FADDV--VILCFDMNTE
C9 GQQLTTFFIDQCSQMFYKGTCHWIA---SQDIDAFLVLCFDMSTE
C10 --QLPSIYWVPCSGMLYKEMVHWFA---TTDIM--VILCFDMSTE
C11 DLEFPTIYYLPCSEMYYKEAIHWFI---IAETV--VILCFDISTE
C12 DEELPRPYNFPCSEIFYERAFHWYA---HRNVV--LILCFDINTE
C13 DKDLPRLFWLTSS-MYYNGAYHWITTLNHEDKL--IILCFDMSTE
C14 YQQFPTIFWVPCSQIFYMGTFHWIC---QR-----VILCFNMSTE
C15 SQELTTFCVTHCSQMFYKGACHWIA---SLDIDAYIILCFDMSSE
C16 DQQLPTVYYYPCFEMLYNGAFHWYA---INDRLDHVILSFDLSTE
con . : * ** ::* *::. *
C1 KFHNMGMPDACH-FADGKCYGLVILFKCMTLICYPDPMPS-SPTE
C2 TFHYMKLPDHCH-FWDNKGYGLTVLSNYLTFITYPNPRCALDPGQ
C3 IFHTMQVPKTCA-SRDEKCHSLVVFDECLTFICYPDPRRESSPVQ
C4 TFRNIKMPNTCH-FKDRKCYGLVVLNESLTLICYPYPGCEIDPAV
C5 TFRDIKMPNTCH-YKDRKCYGLVVLNECLTLICYPYPGCQIDTAI
C6 IFRSMQVPESCA-SYDEKRHSLLILDDSLTIICYPDPRRVSSPVQ
C7 TFRNMKMPDACH-FKDRKSYGLVVLNDSLALICYRHPRCVIDPAK
C8 KFHNMGMPDACH-FDDGKCYGLVILCKCMTLICYPDPMPS-SPTE
C9 IFRSFKIPETCH-YSDGPCCRLVLLHDSLTLIYYPYPEPVIPLEK
C10 MFHTMKMPDTCSRITHELYYGLVILCESFTLIGYSNPISSIDPVK
C11 TFRIMKMPGTCT-LLDGPRYGLAVLNEHLTLICYPDPMCSIDPSE
C12 TFRTMEVPETCA-NYDEKCHSLLVLDEFLTLFCYPDPRRESSPIQ
C13 IFRNINTPDTSQ-FSSGTCHSLVLLDACLSFMCHPYLGSEIDPTT
C14 IFHHIRMPDPCH---NIRNHSLVILNKSLTLICYRSVAPTSDPIE
C15 TFRSLKIPESCH-IINGPTCRLALVHDTLTLIYYPYPETEIPVEK
C16 IFHSIKMPATGK-SSGGKKYGLIVLNESLTLICYPNPDCEMDPSN
con *: : * * :. :::: :
C1 KLTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWKDEILLLH
C2 EFTDIWIMEEYGVNGTWIKKYTIRPLPI--ESSLSVWKDHLLLLQ
C3 ETIEIWIMQEYSVNESWIKKYTIRPPPI--ESPLAIWKDRLLLLQ
C4 DFMEIWIMKEYGVNDSWIKKYTIVPLAI--ESPLAIWKNHLLLLQ
C5 DFMEIWMMKEYGIIESWSMKYKITPLAI--ESPLAIWKDHLLLLQ
C6 DTIDIWTMNEYNVNDSWIKKYTIRSPPI--ESPLAVWKDCRLLLQ
C7 DFMEIWTMKEYGVGESWIKKYTITPLSI--ESPLAVWKNHFLLLE
C8 KLTDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP---ESPLAVWKDEILLLQ
C9 EMLNVWVMRDYSTYESWIKKYTITGLPI--ETPLAVWKNCLLLFQ
C10 DKMHIWVMIEYGVSESWIMRYTIKPLSI--ESPLAVWKNHILLLQ
C11 DFIDIWMMEKYGASESWIKISTIRPVPIPIESPLAIWKDHLLLLQ
C12 ETIEIWIMQEYNVNESWIKKHTIKSPPI--ESPLAIWKDRLLLFQ
C13 DLIDIWMMKDYNVYESWTKKYTIRVLPID-ESPLAVWKDSLLFFQ
C14 DLMEIWILKDYDVSESWVKKYTIRSLPI--KIPLAIWQDNLLLFQ
C15 DLINIWFMKEYNVYESWIRKYTIRGLLI--DSPLTVWKG-LLLYQ
C16 DLMDIWIMMEYGVYESWTKKYIIKPLPI--ESPLTIWRDHLLLLQ
con . .:* : .*. :* * . .*::*:. *: .
C1 -SKTGHLIAYDFNSNEVQELDLHGYPESLRIIIYRESLTAIP-RN
C2 -STGGTLSSYNLSSDELKEFNFRGFTSTLRLVVYKESLTIIP-RE
C3 -DKSGDLIAYDLNLDEVKEFNLHGHPESLRVIVYKESLAPIP-IG
C4 -SITGHLISYNLNSDEIKEFNLHGWPKSLRVKSYKESLTLIP-KE
C5 -SISGYLISYDLNSDEVKEFELNGWPESLRVNVYKESLALIP-KD
C6 -NKCGFLISYDFYSNEVKEFKLHGYPGSLRVIVYKECMTPIP-RG
C7 YHRSGVLFSYDLNSDEVKELNLHGWPQSLRVSIYKESLTLIP-KG
C8 -SKMGHLITYDYNSDEVKELDLHGLPTSLRVIIYRESLTLIP-KS
C9 -NRSGCLMSYNLESNEVKELNYHGYPQSLRVAVYKDSLASIP-RE
C10 -SRSGLLISYDLHSGDAKELSLHGFPDSLSVKVYKECLTSIP-EG
C11 -TKGGFLISYDLNSDEVKEFNLNGHLESLRVIIYKETLTTIS-RI
C12 -DKSGNLISYDLNSDEVKEFKLDGYPGTLRVIIYKESLTPIP-KG
C13 -GKSGYLMSYDFKSEEVKEWNLHGCQKSMRAMVYKESLVLIP-RG
C14 -NRSGYLMVYDLRTDNVKELNIHGCPESMRVTVYKENLTIIP-SG
C15 -SRSGCLMSYNLNSNDIREFSFHGYPKSLRAIVYKDSLTSIP-RE
C16 -SKSGLLVSYDLSSNEVKEFDLHGYPKSLRVLVYKESLISIPKRG
con * * *: : :* . * :: *:: : *.
C1 ND-CIELQNFRCNoooooooooooooooooooooooo
C2 SEHGTKVQTFooooooooooooo--------------
C3 NTQVENFoooooooooooooooo--------------
C4 SEFNTAQoooooooooooooo----------------
C5 REHNMRLSIoooooooooooo----------------
C6 STRVQKLoooooooooooooooooooo----------
C7 NEDSTQVQNFLSDITLooooo----------------
C8 KD-SINLEQFoooooooooooooooooooooo-----
C9 TEQVHKFooooooooooooooo---------------
C10 GEYSTKVQKFooooooooooooooo------------
C11 SEHGTQVERFoooooooooooooooooo---------
C12 STQVQNFooooooooooooooooooooo---------
C13 SQSSTQLQNI---------------------------
C14 SESSTPVHKFooooooooooooooo------------
C15 SEHTKQVYKFooooooooooo----------------
C16 CKHGTKIKNCooooooooo------------------
con