T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=92
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  88
C2    :  92
C3    :  92
C4    :  92
C5    :  93
C6    :  92
C7    :  91
C8    :  92
C9    :  91
C10   :  91
C11   :  94
C12   :  92
C13   :  92
con   :  92

C1    --------------MKELPQDVVIYIFVMLPVKSLLRFKCTDKTF
C2    ---------MVDGIMKKFHEDVVIYILLRLPVKSLMRLKCISKTW
C3    ---------MPDGIIMKLHQDIIIYMLLRLPVKFLLRFKCISKYC
C4    ---------MVDGTMKKLPEDMRIYILLRLPVKSLTRFKCVTKSW
C5    MKIALEEILDGNGVVKKLPKDVVNNITLKLPVKSLLRFKCVSQFW
C6    ---------MADEIVIKLPKDVVMYILLKFPVKPLLRFKRVSRNL
C7    ---------MADGIVIKLPKDVVTYIFLTFPVKSLLRLKCVSRNL
C8    ---------MVEGLLKTLPNDLTIYILLILPVKALMRLKCVSKTC
C9    ---------MANGILKKLPEDLVFLILLTFPVKSLLRFKCISKAW
C10   -----------MTAMKKLPIDVVINILFRLPVKSLTRFKCVAKSW
C11   MKLYSKEYKMADRIITKLPQDMFIYILLRLPVKLLLRLRCVSKSC
C12   --------MMLDGIMKHLPEDIAMHILLRFPVKSLLRFKFISKSW
C13   -------MKMPHGIMKKFPEDVILCIFLRIPVKSLLRFKCVSKNY

con                 :  :  *:   : . :*** * *::   :  


C1    CHIIKSSTFINLHLNHTTNFNDELVLLKRSFETDEYNFYKSILSF
C2    YTLMRSSTFINLHLNRTTTYKDELIFFKRSIK-LEPDLFKNILSF
C3    HTLTKSSTFINIHLNRATTSEDEYILFKRSFK-EDVESYKGIFSF
C4    HTLIQSFNFINFHLNRKTTTKDEFILFRRSTK--HPDGFSHVLSF
C5    YACIQSWAFIILQRNCASSVNDEIILFKRSFK-EEHDHFKSIMSF
C6    YTLIQSSVLINLHLNRNITANNEFILFKRSLK-EEPNLFRSIMSF
C7    HTLIQSSAFINLHLNRTSIINEEFILFKRSLK-EEPDRFRNIMSF
C8    YTLIQSSAFVDLHLNRKTTSKDECILLKRSLE-EGINRYKTSLSF
C9    SILIQSTTFINRHINRKTNTKAEFILFKRSIK-DEEEEFINILSF
C10   YSLIQSVDFINRHLNRATTIKDEFILFKRSFK--EPEGFRNVMSF
C11   YTLIQSSTFINIHLYRTTTSEDEYILFKRSFK-EDVESYKGIFSF
C12   FTLIESSTFINIHLNRATTTKNEFLLFSRSYR-EETEGFKNVLSI
C13   YTLLQSITFINLHLYRTTTVKDEFILLKRSFK-EDINQYKIIFSF

con       .*  ::  :       : * ::: ** .    : :   :*:


C1    LFAKEDY--DFKPISPDVEIPHLTTTA-ACICHRLIGPCNGLIVL
C2    LSSEYED--DLSPVSPDIDVPYLTSDY-CSRFHQLIGPCHGLIAL
C3    LSSNNGD--DLNCIFPDLDVPNMTSLY-SITQDKLIGPCHGLVAV
C4    LVDHEGR-DDLDPICPDIDMPYLTTGFASSTSHQFTGPSNGLILL
C5    LSSGHDDSDDFHHVSPDLEVPYLTNT--TCTFHRFIGPCHGLIVL
C6    LSSGHDD-YDLHHVSPDLDVPYLTNTG-GCTFHRFMGPCHGLLVL
C7    LSSGHDN-YDLHHVSPDLDVPYLTTTG-ACTSHRFMGPCHGLIVF
C8    LCGDDHD--YLSPIIHDVDVTHLTTNC-NFCHDQLVGPCHGLIAL
C9    F-SGNDD--VLNPLFPDIDVSYMTSKC-DCTFTPLIGPCDGLIAL
C10   LVGGVGE-DDLDPISPDVDVPYLSTSY-SCICHQLTGPCHGLILL
C11   YSSHNDD-SDLNTIFPDLDVPNMTSLY-SIDYDKIIGPCHGLIAV
C12   LSSDNND--ELIPVVSDLELPYLTFTE-YYLFNKLVGPCNGLIVL
C13   LSGDGDH-DYLNPIFPDFDVPNMTDTQ-SIIFDQLIGPCHGLIAL

con             :  :  *.::. ::          : **..**: .


C1    TDSLTT-IVFNPATLKYRLIPPCPFGIPRGFRRSIS-GIGFGFDS
C2    TDFTVI-LLLNPATRKYRILPGSPFVCPKGFTFVTR-GVGFGYST
C3    MNVSST-ILLNPATRKYRLLPSSPFGVPKGFYRDIE-NGGFGFDS
C4    TDSLNF-LLLNPATRSYRLLPPNPFCCPRGFLRLIY-GVGFGYDS
C5    TDKVTT-VLFNPATRNSRLLKPSPFGSPLGFHRSIN-GIAFGFDS
C6    TDCEET-VLFNPSTRNYRLLQPSPYDSPLGFHRSIN-GIAFGFDS
C7    TDGEETEVLFNPSTRNYRLLTPSPFDSPLGFHRSID-GIAFGFDS
C8    MHSPTT-VLFNPSTRKYKLLPPSPLRHLKGFYRSME-GEGFGFDS
C9    TDTIIT-IVLNPATRNFRVLPPSPFGCPKGYHRSVE-GVGFGFDT
C10   TDSTNL-VLLNPATRNYRLLPPSPFGIQRGFYRSVA-GVGFGYDS
C11   MDSRST-ILFNPSTRKYRLLPSSPFGIPKGYYRSIE-SGGFGFDS
C12   TDFDII-VLINPATKNYMLIPPSPFVCPKGFHRSFRGGVGFGFDS
C13   MDNLTT-IIFNPSTRNFRLLPPSPFDRPKGYHRSIK-CLGFGFDS

con    .     :::**:* .  ::   *     *:        .**:.:


C1    DANDYKVVRLSEVYKEP-----CDKEMKVDIYDFSVDSWREL--L
C2    TENYYKLVRIFEVYTDPYDRDLDARHSKVEVYDSCTDCWRDLDLT
C3    VVNDYKVFIISEVYTEDRYRYPEEGERKVEVYELGIDVWRELDHV
C4    IQKNYKVIRVSRVYGDPPYNDRSEMSWESEVYNSSTDSWRQLANV
C5    IANEYKIVRLAEIRGEPPFYCYTVREWRVEVYELSIDSWREVENV
C6    IGNEYKIARLAELRGEPPFNCFTMKEWRVEVYELSIDSWREIENV
C7    IGNDYKIVRIAELLGEPPFNCFSTREWRVEVFEMSIDSWREVENV
C8    IINNYKVVKISTIYKVDHFDYLEEIGRKVEVYDLSTDSWRELDHV
C9    ISYYYKVVRISEVYCEEADGYPGPKDSKIDVCDLSTDSWRELDHV
C10   VHKTYKVVRISEVYGEPPFNCPSVMEWKGEVYNSSTDSWRELDCV
C11   VVNDYKVFRISDVYTEDRYGYPEEGERKVEVYEVGIDIWRELDHV
C12   IVKDYKFVTISEVFMDSEW-VPDEKEQKVEVYDLRFDSWRDLNHV
C13   VVNDYKVVRISEFLKDDSYGYVQVEEENVEIYELGIDCWRELDHV

con       **.  :  .              . :: :   * **::   


C1    GQDVPFVFWFPCAEILYKRNFHWFAF-AD--VVVILCFEMNTEKF
C2    VKLLPKVRRFACSEIFYKETFHWCAH-DD--TVMILCFDISLETF
C3    DQQLPKLFWMTSS-MPYNGTYHWLITLSYEHKLILLCFDMSTEIF
C4    DQELPGPYMHPYSELFYKGTFHWYAQ-GH--MRLLLCFDINTEIF
C5    DQQLPYVHWYPCAELFYKGTSHWFGN-TN--TVVILGFDMSTETF
C6    DQQLPYVHWYPCGELFYKGAAHWFGH-ANR-ARVILCFDMSTETF
C7    DQQLRYVHWYPSADLFYKGASHWFGN-ENR-VHVIVCFDMCTEIF
C8    AQELTTLCCVECTQMFYKGACHWIAT-QDLDAFRILCFDMSSEVF
C9    --QLPSIYWVPCAGMLYKEMVHWFAT-TDT-SMVILCFDMSTEMF
C10   DQELPWPYNFAYSEIFYEGAFHWYAH-KN--VVLILCFDVNTETF
C11   DQELPRLFWLTSS-MYYNGAYHWITTLNHEDQLIILCFDMSTEIF
C12   DQQLPTVYYYPCFEMLYNGAFHWYAI-NDRLDHVILSFDISTEIF
C13   NIQFPTIFWVPCSQIFYMGTFHWIAQ------RVILCFNMSTEIF

con      .          : *    **           :: *::  * *


C1    HIMGMPDA-CHFADGKCYGLVILFKCMTLICYPDPMPS-SPTEKL
C2    HYMKLPDH-CHFWDNKGYGLTVLNNYLTFITYPNPRCALDPGQEF
C3    RYIKTLNT-RYFSSGTRHSLVLLNDCLSFICHPFLGPEIDPTKDF
C4    RTMQVPKT-CAVRDEKCHSLVVFDESLTFICYPDPRRESSPVQET
C5    RNIKMPNT-CHFKDRKCYGLVVLNESLTLICYPYPGCEIDPAVDF
C6    RDIKMPNT-CHYKDRKCYGLVVLNECLTLICYPYPGCQIDPAIDF
C7    RTFKMPST-CHYKDKNFYCLVVLNKCLTLICYPYLGYEIDPAIDF
C8    RSLKIPEN-CHLFEGPWCRLALIQESLTLIYYRYPDQSTAQGKDS
C9    HDMKMPDTCSRITHELYYGLVVLCESFTLIGYSNPISSIDPVEDK
C10   RTMEVPEP-CASYDEKCHSLLVLDEFLTLFCYPDPRRESSPIQET
C11   RNINTPDT-RQFSSGTCHSLVLLNECLSFMCYPYQGPEIDPTTDL
C12   HSIKMPAT-GKSSSGKKYGLIVLNESLTLICYPNPDCEMDPSKDS
C13   HHIRMPDP-CH--NIRNHSLVILNESLTLICYRSIAPTSDPIEDL

con   : :                * :: . :::: :           . 


C1    TDIWIMKEYGEKESWIKRCSIRLLP--ESPLAVWKDEILLLHSKT
C2    TDIWIMEEYGVNGTWIKKYTIRPLPI-ESSLAIWKDHLLLLQSIS
C3    IDIWMMKDYNVYDSWINIYTIRILPIHEFPLAIWKDSLLFFQGKT
C4    IEIWIMQEYSVNESWIKKYTIRPPPI-ESPLAIWKDRLLLLQDKS
C5    MEIWIMKEYGVNDSWSKKYTIVPLAI-ESPLAIWKNHLLLLQSIT
C6    MEIWMMKEYGIIESWSMKYKITPLAI-ESPLAIWKDHLLLLQSIS
C7    MEIWIMKEYGIYESWSKTYRIRPLAI-ESPLAIWKDHLLLLQSIS
C8    SVVWIMKDYSVHESWVKNYTITSVPI-HSPLAVWKGYLLVFEGKS
C9    MHIWVMMEYGVSESWIMKYTIKPLSI-ESPLAVWKNHILLLQSRS
C10   IEIWTMQEYRVNESWIKKHTIKSPPI-ESPLAIWKDRLLLFQDKS
C11   IDIWMMKDYNVYESWTKKYTIRVLPVDESPLAVWKDSLLFFQGKS
C12   MDIWIMMEYGIYESWTKKYIIKPLPI-ESPLTIWRDHLLLLQSKS
C13   MEIWILKDYDVSESWVKKYTIRSLPI-KIPLAIWKDNLLLFQSRS

con     :* : :*    :*     *   .  . .*::*:. :*.:.. :


C1    GHLIAYDFNSNEVQELDLHGYPESLRIIIYRESLTAIP-RNNDC-
C2    GTLSSYNLNSDELKEFNFQGFTSTLRLVVYKESLTTIP-RESEHG
C3    GYLMSYNLNTDEVKELSLNGCKRSMRAIVYKESLAPIP-EGSESS
C4    GVLISYDLNLDEVKEFKLHGHPESLRVIVYKESLTSIP-IGS---
C5    GHLISYNLNSDEIKEFNLHGWPKSLRVKIYKESLTLIP-KEREFN
C6    GHLISYDLNSDEVKEFELNGWPESLRVNVYKESLALIP-KDREHN
C7    GYLISYDLNSGEVKEFELNGWPDSLRVTVYKESLALIP-NSKRPR
C8    GCLMSYDLICNKIKELNFHGFPESLRALVYKDSLISIP-IGSEHS
C9    GLLISYDLNSGEAKELNLHGFPDTLSVKVYKECLTSIP-KGSEYS
C10   GILISYDLNSDEVKEFKLDGYPATLRVIIYKESLTPIP-KGS---
C11   GYLMSYDFESEEVKEWNLHGCQKSMRGLVYKESLVPIP-RGSQSS
C12   GLLVSYDLSSNEVKEFDLHGYPKSLRVLVYKESLISIPKRGCKHG
C13   GYLMVYDLRTDNVKELNIHGCPESMRVTVYKENMTIIP-SGSENS

con   * *  *::   : :* .:.*   ::   :*:: :  **       


C1    IELQNFRCNoooooooooooooooooooooooo
C2    TKVQNFooooooooooooo--------------
C3    TQVHNFoooooooooo-----------------
C4    TQVEKFooooooooooooooo------------
C5    TAQoooooo------------------------
C6    MRLSIoooooooooooo----------------
C7    Aooooooooooooooo-----------------
C8    AQVHRFooooooooooo----------------
C9    TKVQKFoooooooooooooo-------------
C10   TQVQNFoooooooooooooooooo---------
C11   RQLQNI---------------------------
C12   TKFKNCooooooooo------------------
C13   TPVHNFooooooooooooooo------------

con