T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=66
*
BAD AVG GOOD
*
C1 : 64
C2 : 71
C3 : 67
C4 : 58
C5 : 66
C6 : 61
C7 : 72
C8 : 64
C9 : 52
C10 : 71
C11 : 65
C12 : 71
C13 : 71
C14 : 66
C15 : 72
C16 : 65
C17 : 66
con : 66
C1 -----------------------------KCIRKSWCTLINTPSF
C2 ---MLESETPEEMVVEILSKLPAKSLTRFKCIRKSWCTLINSSSF
C3 MSQVHDSETPEDRVVEILSRLPPKSLMRFKCVQKYWYSLISSLSF
C4 ------------------------------CIRKPWCTLINSPSF
C5 ---------------------------------KSWCTLIKSSSF
C6 -----------------------KSLMrFKCTRKSWCTLINSSSF
C7 ----HESEAPEDRVVEILSRLPPKSLKRFKCIRKSWCTLINSPRF
C8 ------------------SRLLPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C9 ---------------------------------------------
C10 MIHIRESETPEDRVAEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTVINNPSF
C11 MSQVRESETPEDRVVGILSMLSPKSLLRFKCIRKSWCTLINSPSF
C12 MSQVReTETPEDRVVAIMSKLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C13 MSQVCESETPEDQVVEILSRLPPKSLMRLKCIRKSWCTIINSSSF
C14 -----------------------KSLMRFKCVHKSWCTIINSPSF
C15 MSQVRGSETPEDKVVEILSKLPPKSLMrFKCIRKSWCTIINSPSF
C16 ------------RMVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPCF
C17 ---------------------------------------------
con
C1 VAKHLNNSMNNKLSSSTCILLNRCQNHVFPDRSWKPEVFWSIINL
C2 VAKHLNNSVDNKLSSSTCILVNHSQPHIFPDKNWKQEVFWSVINI
C3 VGKHLSNSVDNKLSSSTCIFLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSMINF
C4 VAKHLNNSTDNKLSSSTCILLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSTINL
C5 VAKHLNNSMDNKLSSSTCILLSRSQAHVFPDNSWKPEVFWSMINL
C6 VAKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQMPVFPDKSWKYEILWSMIYL
C7 VAKHLNNSVDNKLSSSTRILLHRSQTPIFPYDSWKREFFWSMINF
C8 VAKQLSNSVDNKFSSSTCILLNRSQTHVFPDNSWKQEVFWSMINi
C9 -------------------LLNRSEMPVFPDDSWKYEVLWSMINL
C10 MAKHLSNSVDNKFSSSTCILLHRSHMPVFPDRSWKREYFWSMINL
C11 VAKHLSNSLDNKLSSSTCILLNRSQFHIFPDQSWKREVLWSMINL
C12 VAKHLSNSVDNKLSSYICILLSRSQVNVLPDKSWKQEVLWSMINL
C13 VAKHLSNSVDNKLSSSSCILLNRCQVHVFPDRSWKQDVFWSMINL
C14 VAKHLSNTVDNKFSSFTRILFNRCQVHVFPDRSWKRDVFWSMINL
C15 VAKHLNNSMDNKLSSTACILLNRCQVHVFtnRSWKQDVFWSMINL
C16 VAKHLSDSVDNKLSSSTCILLNCSQAHIFPDQSWKQGVLWSVINL
C17 ------------------ILLNRTQMhVFPDQSWKYETLWSMMNL
con :. . ::. .** :** : :
C1 SIDSDDHNLHYDVEDL-NIPCPL-EGHDFVEIGGYCNGIVCVLAW
C2 SVDSDEHSLHYDVVDL-NIPFPL-EDHDFVQIHGYCNGIVCVIVG
C3 SIDSDENNLHYDVEDL-NIPFPL-KDHDFVLIFGYCNGIVCVEAG
C4 SIDSDEHNLHYDVEDL-IIPFPL-EDHDFVLIFGYCNGIICVDVG
C5 SIDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPL-EGHDFVQIEGYCNGIVCVIAG
C6 SIYSDEHNHHYDVEDL-NIPFPL-EDHHPVQIHGYCNGIVCVIAG
C7 SIDSDESNLHYDVEDLTNVPLLQWEDHHEVEIHGYCNGIVCVTVG
C8 SIDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPL-EDQDYVLILGYCNGIVCVSAG
C9 SIDSDDHNLHYNVEDL-NIPFPM-EYHHPVLIHGYCDGIFCVITG
C10 SHDSDEHNLYYDVEDL-NIQFPL-EDHEHVSIHGYCNGIVCLIVG
C11 SIDSDVHNLHYDVKPL-NIPFSR-DDHNPVQIHGYCNGIVCLIEG
C12 FNERVAHSLYYDVEDL-NIPFPR-DDHQHVLIHGYCNGIVCVISG
C13 SIDSDTNNLHYDVEDL-NIPFPM-EDQDNVELHGYCNGIVCVIVG
C14 SIDSDEHNLHYDVEDR-NIPFPI-EVQDNVQLYGYCNGIVCVIVG
C15 SIDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPM-EDQDNVEiHGYCNGIVCVIVG
C16 SIDGDE--LHYDIEDLTNVPFLK-DDHHEFEIHGYCDGIVCVTVD
C17 SNYSDEHNLHyDFKDL-NIPFPT-EDHHPVQIHSYCNGIVCVITG
con :*:. : . :. . : .**:**.*:
C1 KTLHWIYVILCNPATGEFRQLPHSCLLQPSRSRR-KFQLNTISTL
C2 K-----NFLLCNPATREFMQLPDSRLLLPPAEG--KFVLDTTFEA
C3 K-----NVILCNPATREFRQLPNSCLLLPSPPEG-KFELETSFQA
C4 K-----NVLLCNPATREFRQLPDSCLLVP-PPKG-KFELETTFQA
C5 TSLYLINVLLCNPATGKFRQLPPSCLLLPSRPKG-KFQLESIFGG
C6 KT----VIILCNPGTGEFRQLPDSCLLVPLPKEK--FQLETIFGG
C7 E-----YFFLCNPATGEFSQLPNSRLLLPLPRGKGKFGLETTVKG
C8 K-----NILLCNPTTREFMRLPSSCLLLPSRPKG-KFELETVFRA
C9 E-----NVVLCNPAIGEFRQLPDSCLLLPAPPER-KFELETTFRA
C10 K-----NAVLYNPATRELKQLPDSCLLLPSPQGG-KFELESTFQG
C11 D-----NVLLCNPSTREFRLLPNSCLLVPHPEGK--FELETTFHG
C12 K-----NILLCNPATREFRQLPDSFLLLPSRLGG-KFELETDFGR
C13 K-----NVLLCNPATGEFRQLPDSSLLLPLPKGR--FGLETVFKG
C14 E-----NVLLCNPATREFKQLPDSSLLLPLPTGK--FGLETLFKG
C15 k-----NVLLCNPaTrEFRQLPNSSLLLPLPKGR--FGLETTFKG
C16 E-----NFFLCNPATGEFRQLPDSCLLLPLPGGKEKFGLETTLKG
C17 KS----VRILCNPATREFRQLPaSCLLlPSPPEG-KFQLETIFEG
con .* ** :: ** * ** * * *::
C1 LGFGYDCKAKEYKVVQVIEN--CEYSDAEQYDYHRIALPHTAEVY
C2 LGFGYDCKGKEYKVVQIIEN--CEYSDDEQTFNHCTTLPHTAEVY
C3 LGFGYDCNAKEYKVVRIIEN--CEYSDEERTFYHRIALPHTAELY
C4 LGFGYDCNSKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTFHHRIALPHTSEVY
C5 LGFGYDCKAKEYKVVQIIEN--CEYSDDQQYYYHRIALPHTAEVY
C6 LGFGYDRKAKEYKVVQIVEN--CEYSDDERTFYHSIPLPHTAEVY
C7 LGFGYDCKAKEYKVVRIIENYDCEYSDGEETYIEHTALPHTAEVY
C8 LGFGYDCKAKEYKVVQIIEN--SEYSDDERTYYHRIPLPHTAEVY
C9 LGFGYDCKAKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTYNHRISLPYTAEVY
C10 MGFGYDSKAKEYKIVKIIEN--CEYSDDERTFSHRIALPHTAEVY
C11 MGFGYDCKANEYKVVQIVEN--CEYSDDEQTYQHCIAYPYTAEVY
C12 LGFGYDCRAKDYKVVRIIEN--CEYSDDERTYYHRIPLPHTAELY
C13 LGFGYDCKAKEYKVVRIIENCDCEYSEGEESYYERILLPHTAEVY
C14 LGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSDGKESYIERILLPYTAEVY
C15 MGFGYDCKAKEYKVVRIIENCDCEYSEDGESYYERILLPHKAEVY
C16 LGSGYDCKANEYKVVRIIDNYDCEYSDDGETYIEHIALPHTAEVY
C17 LGFGYDYKAKEYKVVQIIEN--CEYSDDERRYYHRIALPHTAEVY
con :* *** . ::**:*::::* .***: . . *:.:*:*
C1 TTIANSWREIKIDISSET-----YCYTCSVYLNGFCYWIATDEED
C2 TMSANSWKEIKIDISSTT-----YSWSCSVYLKGFCYWYATDDEE
C3 TTTANSWKEIKIDISSTT-----YSFSRSVFMKGFCYWYATDGEE
C4 TTAANSWKEIKIDISSQT-----YHCSCSVYLKGFCYWFASDNEE
C5 TMAANSWRVIKIDISSET-----YHYSSSVYLNGFFYWFATDGEK
C6 TIAANSWKEIKIDISTKT-----YPSSCSVYLKGFCYWFASDGEE
C7 TTTANSWKEIKINISSKILSLYSYPYSCSVYLKGVCYWLSSDDEE
C8 TTAANSWREIKIDISTKT-----YSCSCQVYLKGFCYWYATDAEE
C9 TTTGNSWKEINIDVSSKA-----YPCSCSVYLKGFCYWFATDGEE
C10 VTTTNSWRVIEIEISSDT-----YNCSCSVYLKGFCYWFASDDEE
C11 TTAANFWKEIKIDISSST-----HPYPFSVYLKGFCYWFATDGEE
C12 TMATNSWKEIKIDISSKT-----YPCSCSVYLKGFCYWLTRDGEE
C13 TMTANSWKEIKIDVTSDT-DPYCIPYSCSVYLKGFCYWFAMDNGE
C14 TTAANSWKEIKIDTSSDT-DPYCIPYSRSMYLKGFCYWFANDNGE
C15 TTTTNSWKEIKIDISIET-RWYCIPYSGSVYLKGFCYWFAYDNGE
C16 TMAANSWKEITIDILSKILSSYSEPYSYSVYLKGFCYWLSCDVEE
C17 TtIANSWKEIKIEISSKT-----YQCYGSEYLKGFCYWLANDGEE
con . * *: * *: . :::*. ** : * .
C1 FILSFDLGDEIFHRIQLPSRRDSDFKFSNLFLCNKSIASFGYCCN
C2 YVLSFDLCDETFHRIQFPSMGESGFTFFYIFLRNESLTSFCSRYD
C3 YILSFDLGDDTFHIIQLPSRRESGFRFYYIFLRNESLASFCSRYD
C4 YILSFYLGDETFHIIQLPSRRESGFTFDYIFLRNESLASFCSPYS
C5 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESDFEFSNIFLCNKSIASFCSCCD
C6 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESSFKFYDLFLYNESITSYCSHYD
C7 YICSFDLGDEIFDRIELPSRRESGFKLDGIFLYNESITYYCTSYE
C8 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESGFKFYYIFLRNESLASFCSRYD
C9 YILSFDLGDEIFSRIQLPARKESGFKFYSLFLYNESVTSYCSHYD
C10 YILSFDLGDDIFHRIQLPRRKESGFLFYDLFLFNESIASFCSHYD
C11 CILSFDLGDEIFHRIQLPSKIESGFNFCGLFLYNESITSYCCRYD
C12 FILSFDLGDERFHRIQLPSRSEFGLEFYYIFLCNESIASFCSLYN
C13 YIFSFDLGDEIFHIIELPSRREFDFKFYGIFLYNESITSYCSRYE
C14 YIFSFDLGDEIFHRIELPFRRESDFKFCGLFLYNESVASYCSCYE
C15 YVFSFDLGDEIFHRIELPSRRESDFKFYGIFLYNESVTSYCYRHE
C16 YIFSFDLANEISDMIELPFRGEFGFKRDGIFLYNESLTYYCTSYE
C17 YILSFDLGDEIFHIIQLPSRREtGFKFYNIFLCNESIASFrCCYD
con : ** * :: *::* : .: :** *:*:: : .
C1 PSDEDS-------------------------------------TL
C2 GSGDS---QSCEIWVMDDYNGAKSSWTKLLTVGSLQGI-EKPLTF
C3 RSEDSE---SCEoooooooooooooooooooooooooo-oooooo
C4 PSEDSK---LFEIWVMDooooooooooooooooooooo-oooooo
C5 PSDEDS--TLCEIWVMDDYDAVKRSWTKLLTFGPLKDI-ENPFTF
C6 PTEDSK---LFEIWVMDooooooooooooooooooooo-oooooo
C7 ERSRLF-----EIWVMDNYDGVKGSWTKHLTAGPFKGo-oooooo
C8 RSDKSE---SCEIWVMHNYDGVoooooooooooooooo-oooooo
C9 PSEDSK---LFEIWVMDoooooooooooooooooooooooooooo
C10 KSDNSGILEVLEIWVMDGCDGVKSSWTKLQTLGPFKDN-ENLLTF
C11 PSoooo-----ooooooooooooooooooooooooooo-oooooo
C12 RSEDS---KSCEIWIMDDFDGVKSSWTKLLVAGPFKGI-EKPLTL
C13 EDRKLF-----EIWVMDDYDGVKSSWTKLLTVGPFKDI-DYPLTL
C14 EDCKLV-----EIWVMDDYDGVKSSWTKLLTVGHoooo-oooooo
C15 EDCeLF-----EIWVMDDYDGVKSSWTKLLTIGPLKDI-DYPLTL
C16 EPSTLF-----ETWVMDooooooooooooooooooooo-oooooo
C17 PKNEDS--TLCEIWVlDDYDGVKSSWTKLLTVGPLKGINENPLAF
con
C1 Yoooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2 WKSDELLMLAYDGRATSYNSSTGNLKYVHIPPILNKVVDFQALIY
C3 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C4 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C5 WKTDELLMVAAGGRATTYNSSTGNLNYLHIPPILNEVRDFEALIY
C6 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C7 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C8 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C9 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C10 WKSDELLMVTSDNRAISYNSSTGNLKYIHIPPIINKVMGFEALIY
C11 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C12 WKCDELLMLATDGRVISYNSNIGYLNYLHIPPIINRVIDSQALIY
C13 GKCDEVLMLGSYGKAAFCNSSTGNLKYLHIPPIINWMIDYVKSIV
C14 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C15 WKCDEILMLGSYGRAASCNSSTGNLEYLHIPPIIKWMMDYVKSIV
C16 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C17 WKSDELLMVSCDooooooooooooooooooooooooooooooooo
con
C1 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2 VESIVPLKooooooo------------------------------
C3 ooooooooooo----------------------------------
C4 oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo---
C5 MESIVPVooooooooooooooooooooooooooooooo-------
C6 oooooooooooooooooooooooooooooooooo-----------
C7 ooooooo--------------------------------------
C8 ooooooooooooooooooooooooooooo----------------
C9 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C10 VESIVSVK-------------------------------------
C11 oooooooooooooo-------------------------------
C12 VESIVPVKooo----------------------------------
C13 Pooooooo-------------------------------------
C14 ooooooooooooooooooooooooooooooo--------------
C15 PVKooooo-------------------------------------
C16 oooooooooooooooooo---------------------------
C17 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
con
C1 ooooooooooooooooooooooo------
C2 -----------------------------
C3 -----------------------------
C4 -----------------------------
C5 -----------------------------
C6 -----------------------------
C7 -----------------------------
C8 -----------------------------
C9 ooooooooooooooooooooooooooooo
C10 -----------------------------
C11 -----------------------------
C12 -----------------------------
C13 -----------------------------
C14 -----------------------------
C15 -----------------------------
C16 -----------------------------
C17 oooooooooooooooooooooooooo---
con