T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame
CPU TIME:0 sec.
SCORE=66
*
BAD AVG GOOD
*
C1 : 56
C2 : 72
C3 : 70
C4 : 73
C5 : 43
C6 : 72
C7 : 66
C8 : 73
C9 : 63
C10 : 56
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C14 : 70
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C17 : 55
C18 : 63
con : 66
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C2 ---MHESGTPEDRVVEILSKLRPKSLMRFKCIRKSWCSLINSPGF
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C5 ---------------------------------------------
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C7 -----ENETLEDRVVEILSRLLPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C8 MSQMRKSETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIHKSWCTLIKSSSF
C9 MTQVRESETPEDRVAEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTVINNPSF
C10 -----------------------------KCIRKSWCTLINSPSF
C11 -------ETLEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCMRKSWCTLINNPSF
C12 ----RESETPEdRVVGILSRLSPKSLLRFKCIRKSWCTLINSPSF
C13 MSQVRETETPEERVVAIMSKLPPKALMrFKCIRRSWCTLINNPSF
C14 -------ETPEDQVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTIINSSSF
C15 -----------DKVVEILSRLSPKSLMRFKCVHKSWCTIINSPSF
C16 MSQVSESETPEDKVVEILSKLPPKSLMRFKCIRKSWCTIINSPSF
C17 ------------------------------CIRKSWCTLINSPCF
C18 MSQVHDSETPEDRVVEILSWLPPKSLMRFKCIRKSWCTLIISPSF
con
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C2 MAKHLHSSMDNKLSTSTCILLNRSQPHVFPDQNWKQEVFWSKINI
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C18 VAKDLSNSVDNKLSSSTCILLNRTQMHIFPDQSWKYETLWSMMNL
con : : . .** : :** : :
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C2 SLDSDEHNLHYDVVDL-NIP-FPLEDQDFVQIHGYCNGIVCVILG
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con :*:. .: : :. : : ***:**.*:
C1 KTLHWIYVTLCNPATGEFRQLPHSCLLQPSRS-RRKFQLNTISTL
C2 K-----HFLLCNPATREFMQLPDSCLLLP-SA-EGKFELDTTFEA
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C8 E-----NVVLCNPAIGEFRQLPDSCLLLPAPP-ERKFELETTFRA
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C11 K-----MILLCNPTTREFRQLPVSCLLLP-PP-KGKFELETTFQA
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C13 K-----NILLCNPATREFRQLPDSFLLLPSPL-GGKFELETDFGG
C14 K-----NVLLCNPATEEFRQLPDSSLLLP-LP-KGRFGLETVFKG
C15 E-----NVLLCNPATREFKQLPDSSLLLP-LP-TGKFGLETLFKG
C16 E-----NVLLCNPSTQEFRQLPNSPLLLP-FP-KGRFGLETTFKG
C17 E-----NFFLCNPATGEFRQLPDSCLLLPLPGGKEKFGLETTLKG
C18 KS----VCVLCNPATREFRQLPDSCLLLPSPP-EGKFQLETICEG
con * ** :: ** * ** . :* *::
C1 LGFGYDCKAKEYKVVQVIEN--CEYSDAEQYDYHRIALPHTAEVY
C2 LGFGFDCKAKEYKIVQIIEN--CEYSDDEQTYYHCTTLPHTAEVY
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C7 LGFGYDCKAKEYKVVQIIEN--SEYSDDERTYYHRIPLPHTAEVY
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C9 MGFGYDSKAKEYKVVKIIEN--CEYSDDMRTFSHRIALPHTAEVY
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C11 LGFGYDCNAEEYKVVRTIEN--CEYSDDEQTFYHRIALPHTAEVY
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C13 LGFGYDCRAKDYKVVRIIEN--CEYSDDERTYYHRIPLPHTAEVY
C14 LGFGYDCKAKEYkVVRIIENCDCEYSEGEESYYERILLPHTAEVY
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C16 MGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSEDGESYYERILLPHTAEVY
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C18 LGFGYDYKAKEYKVVQIIEN--CEYSDDERRYYHRIALPHTAEVY
con :***: .:::**:*: ::* .** : . . * ***:*
C1 TTTANSWREIKIDISSET--YCY---TCSVYLNGFCYWIATDEED
C2 TTVANSWKEIKIDISSNT--YSW---SCSVYLKGFCYWYATDDEE
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C5 TIAANSWKEIKIDISTKT--YPS---SCSVYLKGFCYWFASDGEE
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C8 TTTGNSWKEINIDVSSKA--YPC---SCSVYLKGFCYWFATDGEE
C9 VTTTNSWRVIEIEISSDT--YNC---SYSVYLKGFCYWFASDDEE
C10 TTAANSWRKIKIDISSGT--YDC---SCSTYLKGFCYWFATDGEK
C11 TTTSNSWKEIKIDISSDT--YSC---SCSVYLKGFCYWYARGGEE
C12 TTAANFWKEIKIDISSST--HPY---PFSVYLKGFCYWFATDGEE
C13 TMATNSWQEVKIDISSKT--YPC---SCSVYLKGFCYWFTRDGEE
C14 TMTTNSWKEIKIDVTSDT-DPYCIPYSCSVYLKGFCYWFAMDNGE
C15 TTAANSWKEIKIDTSSDT-DPYCIPYSCSLYLKGFCFWFANDNGE
C16 TTSANSWKEIKIDISIET-CWYCIPYSGSVYLKGFCYWFAYDNGE
C17 TMAANSWKQITIDILSKILSSYSEPYSYSVYLKGFCYWLSCDVEE
C18 TTAANSWKEITIEISSKT--YQC---YGSEYLKGFCYWFANDGEE
con . * *: : *: . **:** :* : . .
C1 FILSFDLGDEIFHRIQLPSRRDSDFKFSNLFLCNKSIASFGYCCN
C2 YVLSFDLGDETFHRIQLPSRGESGFTFFYIFLHNESLASFCSRYD
C3 YILSFDLGDETFHIVQLPSRRESGFTFDYIFLRNESLASFCSPYN
C4 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESDFEFSNIFLCNKSIASFCSCSD
C5 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESSFKFYDLLLYKESITSYCSHYD
C6 YICSFDLGEEIFDRIELPSRRESGFKLDGIFLYNESIAYYCTSYE
C7 YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESGFKFYYIFLRNESLASFCSRYD
C8 YILSFDLGDEIFYRIQLPSRKESGFKFYSLFLYNESVTSYCSHYD
C9 YILSFDLGDEIFHRIQLPYRKESGFLFYDLFLYNESIASFCSHYD
C10 YILSFYLGDEIFRRIQLPFRKESDFKFSNIFLCNESIASFCSCCD
C11 YILSFHVGDETFHIIQFPSKRESGFTFDYIFLRNDSLASFCSPHY
C12 CILSFDLGDEIFHRIQLPSKIESGFNFCGLFLYNESITSYCCRYD
C13 FILSFGLgDERFHRIQLPSRRESSFEFYYIFLCNESIASFCSLYD
C14 YIFSFDLGDEIFHIIELPSRREFDFKFYGIflYNESITSYCSRYE
C15 YIFSFDLGDEMFHRIELPFRRESDFKFCGLFLYNESVASYCSCYE
C16 YVFSFDLGDEIFNRIELPSRRESDFKFYGIFLYNESVTSYCYRHE
C17 YIFSFDLANEISDMIELPFRGEFGFKRDGIFLYNESLTYYCTSYE
C18 YILSFDLGDEIFHIIQLPSRRESGFKFYNIFLCNESIASFCCCYD
con : ** :.:* :::* : : .* ::* :.*:: :
C1 PSDEDSTLYoo-ooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2 QS-GDSQSCEI-WVMDDYDKVKHSWTKLLTIELLQGIEKPLTFWK
C3 PS-EDSKIFEI-WEMDDYDGVKSSWTKLLTVGPFKGIEYPLTFWK
C4 PSDEDSTLCEI-WVMDDYDGVKRSWTKLLTFGPLKDIENPFTFWK
C5 PSEoooooooo-ooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6 ---ERSRLFEI-WVMDNCDGVNSSWTKHLTAGPFKGIEFPLTLWK
C7 RS-DKSESCEI-WVMHNYDGVoooooooooooooooooooooooo
C8 PS-EDSKLFEI-WVMDNYDGVKSSWKKLLTVGPLKGIRYPLTLWK
C9 KS-DNSGMLEILooooooooooooooooooooooooooooooooo
C10 PSDEDSTLCoo-ooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11 PS-EDSKLFEV-WVMDDYDGIKSSWTKLLTVGPFKGIQYPLTLWK
C12 PS-EDSKLFEI-WVMDGYGoooooooooooooooooooooooooo
C13 RS-EDSKSCEI-WVMDDYDGVKSSWTKLLVAGPFKGIEKPLTLWK
C14 ---GDCKLFEI-WVMDDYDRVKSSWTKLLTVGPFKDIDYPLTLGK
C15 ---EDCKLVEI-WVMDDYDGVKSSWTKLLTVGPFKDIESALTFWK
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C17 ---EPSTLFEI-WVMEDYNoooooooooooooooooooooooooo
C18 PKNEDSTLCET-WVMoooooooooooooooooooooooooooooo
con
C1 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C2 SDELLMLASDGRATSYNSSTGNLKYVHIPPIL--NKVVDFQALIY
C3 CDELLMLASNGRAISYNSSTENLKYLHIPPII--NWMIooooooo
C4 TDELLMVAAGGRATTYNSSTGNLNYLHIPPIL--NEVRDFEALIY
C5 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C6 HDELLMIASDGRATSYNSSTENLKYLHIPVIIYRNRVIDYTKSIV
C7 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C8 GDELLMLASDKRVTSYNSSTRNLKYLHIPPII--DEIIDFEALIY
C9 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C10 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C11 CDELLMLASGGRAISYNTSTGNLTSLHIPPII--NRVVDFKALIY
C12 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C13 CDELLMIDTDGRVISYNSGIGYLTYLHIPPII--NRVIDSQALIY
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C15 CDEVLILSSYGKATSYNSSTGNLKYFHIPPII--NWMIDYVETVV
C16 CDEILMLGSYGRAASCNSSTANLKYLHIPPII--NWMIDYVKSIV
C17 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
C18 oooooooooooooooooooooooooooooooo--ooooooooooo
con
C1 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2 TESIVSLKoooooooooooooooooooo-----------------
C3 oooooooooooooooooooooooooooooooo-------------
C4 VESIVPVKoooooooooo---------------------------
C5 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6 PVKRVEGKVPFSPI-------------------------------
C7 ooooooooooooooooooooooooooooo----------------
C8 VKSIVPIKoooooooooooooooo---------------------
C9 ooooooooooooooooooooooo----------------------
C10 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11 VKSIVPLKoooooooooooooooooooooooo-------------
C12 ooooooooooooooooooooooooooooo----------------
C13 VESIVPVKoooooooooooooooo---------------------
C14 oooooooooooooooooooooooooooo-----------------
C15 PVKooooooooooooooooooooooooooooo-------------
C16 PVKoooooooooooooooooo------------------------
C17 ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C18 oooooooooooooooooooooo-----------------------
con
C1 oo------------------------------------------
C2 --------------------------------------------
C3 --------------------------------------------
C4 --------------------------------------------
C5 oooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6 --------------------------------------------
C7 --------------------------------------------
C8 --------------------------------------------
C9 --------------------------------------------
C10 oo------------------------------------------
C11 --------------------------------------------
C12 --------------------------------------------
C13 --------------------------------------------
C14 --------------------------------------------
C15 --------------------------------------------
C16 --------------------------------------------
C17 oooo----------------------------------------
C18 --------------------------------------------
con