T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame 
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C5    ---------------------------------------------
C6    -----------------------KSLMRFKCTRKSWCTLINSSSF
C7    MSQGHESEAPEDRVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPRF
C8    MSQVRESETPEDRVVGILSRLSPKSLLRFKCIRKSWCTLINSPSF
C9    -------ETPEDQVVEILSRLPPKSLMRFKCIHKSWCTLIKSSSF
C10   -----------------------------KCIRKSWCTVINNPSF
C11   -----------------------KSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
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C13   --------------------------------HRSWCAIINSPSF
C14   -SQVHESETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C15   -----------------------KSLMRFKCIRKSWCTIINSPSF
C16   ------------------------------CIRKSWCTLINSPCF
C17   MSQVHESETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF

con                                                


C1    ------------LSSSTCILLNRCQNHVFPDRSWKPEVFWSIINL
C2    ---------------------------------------------
C3    VGKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSKINF
C4    VAKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSTINL
C5    ------------LSSSTCILLNRSQAHVFPDNSWKPEVFWSMINL
C6    VAKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQMPVFPDKSWKYEILWSMIYL
C7    VAKHLNNSVDNKLSSSTRILLHRSQTPIFPYDSWKREFFWSMINF
C8    VAKQLSNSVDNKFSSSTCILLNRSQTHVFPDNSWKQEVFWSMINL
C9    VAKHLSNSMDNKLSTSTCILLNRSEMPVFPDDSWKYEVLWSMINL
C10   MAKHLSNFVDNKFSSSTCILLHRSQMPVFPDRSWKREYFWSMINL
C11   VAKHLSNSLDNKLSSSTCILLNRSQFHIFPDQSWKREVLWSMINL
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C13   VANHLSNSMDNKLSSSTCILLNRCQVHDFPDRSWKQDVFWSMINL
C14   VAKHLSNTVDNKFSSCTRILFNRCQVHVFPDRSWKRDVFWSMINL
C15   VAKHLNNSMDNKLSSTTCILFNRCQVHVFLDRSWKQDVFWSMINL
C16   VAKHLSDSVDNKLSSSTCILLNCSKAHVCSEESWKQEVLWSVINL
C17   VAKYLSNSVDNKLSSSICILLNRTQMHVFPDQSWKYETLWSMMNL

con                                                


C1    SIDSDDHNLHYDVEDL-NIP-CPLEGHDFVEIGGYCNGIVCVLAW
C2    -----------------------------VQIHGYCNGIVCVIVG
C3    SVDSDENNLNYDVEDL-IIP-FPLEDHDFVLIFGYSNGIVCVEAG
C4    SIDSDEQSLHYDVEDL-IIP-FPLEDHDFVLIFGYCNGIICVDAG
C5    YIDSDEHNLHYDVEDL-NIP-FPLEGHDFVEIDGYCNGIVCVIAG
C6    SIYSDAHNHHYDVEDL-NIP-FPLEDHHPVQIHGYCNGIVCVIAG
C7    SIDSDESNLHYDVEDLTNVPLLQWEDHHEVEIHGYCNGIVCVTVG
C8    STDSDEHNLHYDVEDL-NIP-FPLEDQDYVLILGYCNGIVCVSAG
C9    SIDSDEHNLHYNVEDL-NIP-FPMEYHHPVLIHGYCDGIFCVITG
C10   SHDSDEHNLYYDVEDL-NIQ-FPLEDHDHVSIHGYCNGIVCLIVG
C11   SSDSDVHNLHYDVKPL-NIP-FSRDDHNPVQIHGYCNGIVCLIEG
C12   FNDRVACTLYYDVDDL-NIP-FPRDDHQHVLIHGYCNGIVCVISG
C13   SIDSDESNLHYDVEDL-NIP-FPMEDHDNVELHGYCNGIVSVKVG
C14   SFDSDEHNLHYDVEDR-NIP-FPIEVQDNVQLYGYCNGIVCVIVG
C15   SIDSDEHNLHYDVEDL-NIP-FPIEDQDNIELHGYCNGIVCVIVG
C16   SIDGDE--LHYDIEDLTNVP-FLKDDHHEVEIHGYCDGIVCVTVD
C17   SNYSVEHNLHYDFKDL-NIP-FPTEDHHPVQIHSYCNGIVCVITG

con                                : : .*.:**..:   


C1    KTLHWIYV-ILCNPATGEFRQLPHSCLLQPSRS-RRKFQLNTIST
C2    K-----Nv-LLCNPATREFMQLPDSCLLLP-PA-EGKFELDTTFE
C3    K-----NV-LLCNPATREFRQLPDSCLLLPSPP-EGIFELETSFQ
C4    K-----NV-LLCNPATREFRQLPDSCLLLPPP--KGKFELETTFQ
C5    KNLHLINV-LLCNPATGEFRQLPHSCLLLPSRP-KGKFELETIFG
C6    K-----TVIILCNPGTGEFRQLPDSCLLVPLP--KEKFQLETIFG
C7    E-----YF-FLCNPATGDFSQLPNSRLLLPLPRGKGKFGLETTVK
C8    K-----NI-LLCNPTTREFMRLPSSCLLLPSHP-KGKFELETVFR
C9    K-----NV-VLCNPAIGEFRQLPDSCLLLPAPP-ERKFELETTFR
C10   K-----NA-VLYNPATRELKHLPDSCLLLPSPP-EGKFELESTFQ
C11   D-----NV-LLCNPSTREFRLLPNSCLLVPHP--EGKFELETTFH
C12   K-----NI-LLCNPATREFRQLPDSFLLLPSPL-GGKFELETDFG
C13   K-----NV-LLCNPATGKFRQLPNSSLLLPLP--KGRFGLETIFK
C14   E-----NV-LLCNPATREFKQLPDSSLLLPLP--TGKFGLETLFK
C15   K-----NV-LLCNPATREFRQLPNSSLLLPLP--KGRFGLETTFK
C16   E-----DF-FLCNPATGEFRQLPDSCLLLPLPGVKEKFGLETTLK
C17   K-----SVRILCNPATREFRQLPDSCLLVSSPP-EGKFQLETIFE

con   .        .* **   .:  ** * ** .       * *::   


C1    LLGFGYDCKAKEYKVVQVIEN--CEYSDAEQYDYHRIALPHTAEV
C2    ALGFGYDCKGKEYKVVQIIEN--CEYSDDEQTFNHCTaLPHTAEV
C3    ALGFGYDCNAKEYKVVRIIEN--CGYSDEERTFYHRIALPHTAEL
C4    ALGFGYDCNAKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTFHHRIALPHTAEV
C5    ALGFGYDCKDEEYKVVQIIEN--CEYSDDQQYYYHRIALPHTAEV
C6    GLGFGYDRKAKEYKVVQIVEN--CEYSDDERTFYHSIPLPHTAEV
C7    GLGFGYDCKAKEYKVVRIIENYDCEYSDGEETYIEHTALPHTAEV
C8    ALGFGYDCKAKEYKVVQIIEN--SEYSDDERTYYHRIPLPHTAEV
C9    ALGFGYDCKAKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTYNHRISLPYTAEV
C10   GMGFGYDSKAKEYKVVKIIEN--CEYSDDMRTFSHRIALPHTAEV
C11   GMGFGYDCKANEYKVVQIVEN--CEYSDDEQTYQHCIAYPYTAEV
C12   GLGFGYDCRAKDYKVVRIIEN--CEYSDDERTYYHRIPLPHTAEV
C13   GLGFGYDCKTKEYKVVQIIENCDCEYSEGEESYYERILLPYTAEV
C14   GLGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSDGKESYIERILLPYTAEV
C15   GMGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSDDGESYYERILLPHTAEV
C16   GLGFGYDCKAKEYKVVRIIDNYDCEYSDDGETYIEHIALPYTAEV
C17   GLGFGYDYKAKEYKVVQIIEN--CEYSDDERRYYHRIALPHTAEV

con    :***** . ::****::::*  . **:  .   .    *:***:


C1    YTTTANSWREIKIDISSET------YCYTCSVYLNGFCYWIATDE
C2    YTTAANSWKEIKIDISSTT------YSWSCSVYLKGFCYWYAtDD
C3    YTTTANSWKEIKIDISSTT------YSCSRSVFMKGFCYWYATDG
C4    YTMAANSWNEIKIDISSQT----Y--HCSCSVYLKGFCYWFASDS
C5    YTTAANSWREIKIDISGET------YHYSFSVYLKGLCYWFATDG
C6    YTIAANSWKEIKIDISTKT------YPSSCSVYLKGFCYWFASDG
C7    YTTTANTWKEIKINISSKI-LSLYSYPYSCSVYLKGFCYWLSSDD
C8    YTTAANSWREIKIDISSET------YHYSFSVYLKGFCYWFATDG
C9    YTTTGNSWKEINIDVSSKA----Y--PCSCSVYLKGFCYWFATDG
C10   YGTTTNSWRVIEIEISSDT------YNCSCSIYLKGFCYWFASDD
C11   YTTAANFWKEIKIDISSST----H--PYPFSVYLKGFCYWFATDG
C12   YTMATDSWKEIKIDISSKT----Y--PCSCSVYLKGFCYWFTRDG
C13   YTMTANSWREIKIDTSSDTDPYCI--PYSGSVYLKGFCYWFANDN
C14   YTTAANSWKEIKIDTSSDTDPYCI--PYSCSMYLKGFCYWFANDN
C15   YTTTANSWKEIKIDISIETGWYCI--PYSSSVYLKGFCYWFAYDN
C16   YTMAANSWKEITIDILSKI-LSSYSEPFSYSVYLKGFCYWLSCDV
C17   YTTAANSWKEIKIAISRKT------YQCYGSEYLKGFCYWLANDG

con   *  : : *. * *                 * :::*:*** : * 


C1    EDFILSFDLGDEIFHRIQLPSRRDSDFKFSNLFLCNKSIASFGYC
C2    DEYVLSFDLCDETFHRIPFPSRGESGooooooooooooooooooo
C3    DEYILSFDLGDDTFHVIQLPSRRESGFRFYYIFLRNESLAAFCSR
C4    EEYILSFYVGDETFHKIQLPSRRESGFTFDYIFLLNESLASFCSP
C5    EKYILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESDFEFSNIFLCNKSIASFCSC
C6    EEYILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESSFKFYDLFLYNESITSYCSH
C7    EEYICSFNLGDEIFDRIELPSRRESGFKLDGIFLYNESITYYCTS
C8    EKYILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESGFKFYYIFLRNESLASFCSR
C9    EEYILSFDLGDEIFYRIQLPSRKESGFKFYSLFLYNESVTSYCSH
C10   EEYILSFDLGDEIFHRIQLPYRKESGFLFYDLFLYNESVASFCSH
C11   EECILSFDLGDEIFHRIQLPSKIESSFNFCGLFLYNESITSYCCR
C12   EEFILSFDLGDERFHRIQLPSRRESGFEFYYIFLCNESIASFCSL
C13   GEYVFSFDLCDEIFHRIELPSRGEFDFKFYGIFLYNESITSYCSR
C14   GEYIFSFDLGDEMFHRIELPFRRESDFKFCGLFLYNESVASYCSC
C15   GEYVFSFDLGDEIFHRIELPSRRESDFKFYGIFLYNESVTSYCYC
C16   EEYIFSFDLANEISDMIELPFRGEFGFKRDGIFLYNESLTYYCSS
C17   EEYVLSFDLGDEIFHTIQLPSRRESGFKFYNIFLCNESIASFCCC

con    . : ** : ::    * :* : : .                   


C1    CNPSDEDSToooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    YDR-SEDSELCEIWVMooooooooooooooooooooooooooooo
C4    YNP-SEDSKLFEIWVMDDYDGVKSLWTKLLTVGPFKGIEYPLALW
C5    HDPSDEVSTLCEIWVMDDYDRVKSSWTKLLTFGPLKGIENPFAFW
C6    YDP-TEDSKLFEIWVMDoooooooooooooooooooooooooooo
C7    Y---EERSRLFEIWVMDNYDGVKRSWTKHLTAGPFKGIEFPLTLW
C8    YDR-SDKSESCEIWVoooooooooooooooooooooooooooooo
C9    YDP-SEDSKLFEIWVMDNYDGVKSSWKKLLTVGPLKGIRYPLTLo
C10   YDK-SDNSGILEILooooooooooooooooooooooooooooooo
C11   YDP-SEDSKLFEIWVMDGYGGVKSLWTKLLTVGPFKGIEYPLTFW
C12   YDR-SQDSKSCEIWVMDDYDGVKSSWTKLLVAGPFKGIEKPLTLW
C13   Y---EEDCKLFEIWVMDDYDGVKSLWTKLLMVGPFKDIDYPLTFo
C14   Y---EEDCKLVEIWVMDDYDGVKSSWTKLLTVGPFKDIESPLTFW
C15   H---EEDCELFoooooooooooooooooooooooooooooooooo
C16   Y---EEPFTLFoooooooooooooooooooooooooooooooooo
C17   YDPKNEDSTLCETWVMDoooooooooooooooooooooooooooo

con                                                


C1    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C4    KCDELLMLASDGRATSYNSSTRNoooooooooooooooooooooo
C5    KSDELLMVooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
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C8    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C9    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C10   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11   KCDELLMVASGRRVTSYNSoooooooooooooooooooooooooo
C12   KCDELLMIDTDGRVISYNSSIGYLSYLHIPPIINRVIDSQALIYV
C13   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C14   KCDEVLILSSYGKATSYNSSTGNLKYLDIPPIINWMIDYVkSiVS
C15   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C16   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C17   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo

con                                                


C1    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    oooooooooooooooooooooooooooooooooooo---------
C4    oooooooo-------------------------------------
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C6    oooooooooooooooooooooooooooooo---------------
C7    ---------------------------------------------
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C9    oooooooooooooo-------------------------------
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C11   ooooooooooooooooooooooooooooooo--------------
C12   ESIVPVK--------------------------------------
C13   oooooooooooooooooooooooooooooooooooo---------
C14   VKooo----------------------------------------
C15   ooooooooooooooooooooooooooo------------------
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C17   ooooo----------------------------------------

con                                                


C1    ooooooooooooo--------------------------------
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    ---------------------------------------------
C4    ---------------------------------------------
C5    ooooooooooooo--------------------------------
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C7    ---------------------------------------------
C8    ---------------------------------------------
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C10   ---------------------------------------------
C11   ---------------------------------------------
C12   ---------------------------------------------
C13   ---------------------------------------------
C14   ---------------------------------------------
C15   ---------------------------------------------
C16   ---------------------------------------------
C17   ---------------------------------------------

con                                                


C1    ----------------------------------
C2    oooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    ----------------------------------
C4    ----------------------------------
C5    ----------------------------------
C6    ----------------------------------
C7    ----------------------------------
C8    ----------------------------------
C9    ----------------------------------
C10   ----------------------------------
C11   ----------------------------------
C12   ----------------------------------
C13   ----------------------------------
C14   ----------------------------------
C15   ----------------------------------
C16   ----------------------------------
C17   ----------------------------------

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