T-COFFEE, Version_10.00.r1613 (2013-10-22 15:49:04 - Revision 1613 - Build 427)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=56
*
 BAD AVG GOOD
*
C1    :  40
C2    :   0
C3    :  54
C4    :  62
C5    :  65
C6    :  54
C7    :  64
C8    :  63
C9    :  63
C10   :  54
C11   :  59
C12   :  60
C13   :  58
C14   :  61
C15   :  61
C16   :  52
C17   :  64
con   :  56

C1    ---------------------------------------------
C2    ---------------------------------------------
C3    -----------------------------KCIHKSWFSLINSLNF
C4    MSQLHETETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCRLINSPSF
C5    ---------------------------------------------
C6    -----------------------KSLMRFKCTRKSWCTLINSSSF
C7    MSQGHESEAPEDRVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPRF
C8    MSQVRESETPEDRVVGILSRLSPKSLLRFKCIRKSWCTLINSPSF
C9    -------ETPEDQVVEILSRLPPKSLMRFKCIHKSWCTLIKSSSF
C10   -----------------------------KCIRKSWCTVINNPSF
C11   -----------------------KSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C12   MSQVRETETLEDRVVAIMSKLPPKSLMRFKCIRKSWCTVINSPSF
C13   --------------------------------HRSWCAIINSPSF
C14   -SQVHESETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF
C15   -----------------------KSLMRFKCIRKSWCTIINSPSF
C16   ------------------------------CIRKSWCTLINSPCF
C17   MSQVHESETPEDKVVEILSRLPPKSLMRFKCIRKSWCTLINSPSF

con                                                


C1    ------------LSSSTCILLNRCQNHVFPDRSWKPEVFWSIINL
C2    ---------------------------------------------
C3    VGKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSKINF
C4    VAKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQAHIFPDQSWKQEVFWSTINL
C5    ------------LSSSTCILLNRSQAHVFPDNSWKPEVFWSMINL
C6    VAKHLSNSVDNKLSSSTCILLNRSQMPVFPDKSWKYEILWSMIYL
C7    VAKHLNNSVDNKLSSSTRILLHRSQTPIFPYDSWKREFFWSMINF
C8    VAKQLSNSVDNKFSSSTCILLNRSQTHVFPDNSWKQEVFWSMINL
C9    VAKHLSNSMDNKLSTSTCILLNRSEMPVFPDDSWKYEVLWSMINL
C10   MAKHLSNFVDNKFSSSTCILLHRSQMPVFPDRSWKREYFWSMINL
C11   VAKHLSNSLDNKLSSSTCILLNRSQFHIFPDQSWKREVLWSMINL
C12   VAKHLSNSVDNKFSSYIFILLNRSQVHVFPDKSWKHEVLWSMINL
C13   VANHLSNSMDNKLSSSTCILLNRCQVHDFPDRSWKQDVFWSMINL
C14   VAKHLSNTVDNKFSSCTRILFNRCQVHVFPDRSWKRDVFWSMINL
C15   VAKHLNNSMDNKLSSTTCILFNRCQVHVFLDRSWKQDVFWSMINL
C16   VAKHLSDSVDNKLSSSTCILLNCSKAHVCSEESWKQEVLWSVINL
C17   VAKYLSNSVDNKLSSSICILLNRTQMHVFPDQSWKYETLWSMMNL

con                                                


C1    SIDSDDHNLHYDVEDL-NIPCPL-EGHDFVEIGGYCNGIVCVLAW
C2    -----------------------------VQIHGYCNGIVCVIVG
C3    SVDSDENNLNYDVEDL-IIPFPL-EDHDFVLIFGYSNGIVCVEAG
C4    SIDSDEQSLHYDVEDL-IIPFPL-EDHDFVLIFGYCNGIICVDAG
C5    YIDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPL-EGHDFVEIDGYCNGIVCVIAG
C6    SIYSDAHNHHYDVEDL-NIPFPL-EDHHPVQIHGYCNGIVCVIAG
C7    SIDSDESNLHYDVEDLTNVPLLQWEDHHEVEIHGYCNGIVCVTVG
C8    STDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPL-EDQDYVLILGYCNGIVCVSAG
C9    SIDSDEHNLHYNVEDL-NIPFPM-EYHHPVLIHGYCDGIFCVITG
C10   SHDSDEHNLYYDVEDL-NIQFPL-EDHDHVSIHGYCNGIVCLIVG
C11   SSDSDVHNLHYDVKPL-NIPFSR-DDHNPVQIHGYCNGIVCLIEG
C12   FNDRVACTLYYDVDDL-NIPFPR-DDHQHVLIHGYCNGIVCVISG
C13   SIDSDESNLHYDVEDL-NIPFPM-EDHDNVELHGYCNGIVSVKVG
C14   SFDSDEHNLHYDVEDR-NIPFPI-EVQDNVQLYGYCNGIVCVIVG
C15   SIDSDEHNLHYDVEDL-NIPFPI-EDQDNIELHGYCNGIVCVIVG
C16   SIDGDE--LHYDIEDLTNVPFLK-DDHHEVEIHGYCDGIVCVTVD
C17   SNYSVEHNLHYDFKDL-NIPFPT-EDHHPVQIHSYCNGIVCVITG

con                                : : .*.:**..:   


C1    KTLHWIYVILCNPATGEFRQLPHSCLLQPSR-SRRKFQLNTISTL
C2    K-----NvLLCNPATREFMQLPDSCLLLPPA--EGKFELDTTFEA
C3    K-----NVLLCNPATREFRQLPDSCLLLPSP-PEGIFELETSFQA
C4    K-----NVLLCNPATREFRQLPDSCLLLPPP-KG-KFELETTFQA
C5    KNLHLINVLLCNPATGEFRQLPHSCLLLPSR-PKGKFELETIFGA
C6    KT----VIILCNPGTGEFRQLPDSCLLVPLP-KE-KFQLETIFGG
C7    E-----YFFLCNPATGDFSQLPNSRLLLPLPRGKGKFGLETTVKG
C8    K-----NILLCNPTTREFMRLPSSCLLLPSH-PKGKFELETVFRA
C9    K-----NVVLCNPAIGEFRQLPDSCLLLPAP-PERKFELETTFRA
C10   K-----NAVLYNPATRELKHLPDSCLLLPSP-PEGKFELESTFQG
C11   D-----NVLLCNPSTREFRLLPNSCLLVPHP-EG-KFELETTFHG
C12   K-----NILLCNPATREFRQLPDSFLLLPSP-LGGKFELETDFGG
C13   K-----NVLLCNPATGKFRQLPNSSLLLPLP--KGRFGLETIFKG
C14   E-----NVLLCNPATREFKQLPDSSLLLPLP--TGKFGLETLFKG
C15   K-----NVLLCNPATREFRQLPNSSLLLPLP--KGRFGLETTFKG
C16   E-----DFFLCNPATGEFRQLPDSCLLLPLPGVKEKFGLETTLKG
C17   KS----VRILCNPATREFRQLPDSCLLVSSP-PEGKFQLETIFEG

con   .       .* **   .:  ** * ** .       * *::    


C1    LGFGYDCKAKEYKVVQVIEN--CEYSDAEQYDYHRIALPHTAEVY
C2    LGFGYDCKGKEYKVVQIIEN--CEYSDDEQTFNHCTaLPHTAEVY
C3    LGFGYDCNAKEYKVVRIIEN--CGYSDEERTFYHRIALPHTAELY
C4    LGFGYDCNAKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTFHHRIALPHTAEVY
C5    LGFGYDCKDEEYKVVQIIEN--CEYSDDQQYYYHRIALPHTAEVY
C6    LGFGYDRKAKEYKVVQIVEN--CEYSDDERTFYHSIPLPHTAEVY
C7    LGFGYDCKAKEYKVVRIIENYDCEYSDGEETYIEHTALPHTAEVY
C8    LGFGYDCKAKEYKVVQIIEN--SEYSDDERTYYHRIPLPHTAEVY
C9    LGFGYDCKAKEYKVVRIIEN--CEYSDDEQTYNHRISLPYTAEVY
C10   MGFGYDSKAKEYKVVKIIEN--CEYSDDMRTFSHRIALPHTAEVY
C11   MGFGYDCKANEYKVVQIVEN--CEYSDDEQTYQHCIAYPYTAEVY
C12   LGFGYDCRAKDYKVVRIIEN--CEYSDDERTYYHRIPLPHTAEVY
C13   LGFGYDCKTKEYKVVQIIENCDCEYSEGEESYYERILLPYTAEVY
C14   LGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSDGKESYIERILLPYTAEVY
C15   MGFGYDCKTKEYKVVRIIENCDCEYSDDGESYYERILLPHTAEVY
C16   LGFGYDCKAKEYKVVRIIDNYDCEYSDDGETYIEHIALPYTAEVY
C17   LGFGYDYKAKEYKVVQIIEN--CEYSDDERRYYHRIALPHTAEVY

con   :***** . ::****::::*  . **:  .   .    *:***:*


C1    TTTANSWREIKIDISSET-----YCYTCSVYLNGFCYWIATDEED
C2    TTAANSWKEIKIDISSTT-----YSWSCSVYLKGFCYWYAtDDDE
C3    TTTANSWKEIKIDISSTT-----YSCSRSVFMKGFCYWYATDGDE
C4    TMAANSWNEIKIDISSQT-----YHCSCSVYLKGFCYWFASDSEE
C5    TTAANSWREIKIDISGET-----YHYSFSVYLKGLCYWFATDGEK
C6    TIAANSWKEIKIDISTKT-----YPSSCSVYLKGFCYWFASDGEE
C7    TTTANTWKEIKINISSKILSLYSYPYSCSVYLKGFCYWLSSDDEE
C8    TTAANSWREIKIDISSET-----YHYSFSVYLKGFCYWFATDGEK
C9    TTTGNSWKEINIDVSSKA-----YPCSCSVYLKGFCYWFATDGEE
C10   GTTTNSWRVIEIEISSDT-----YNCSCSIYLKGFCYWFASDDEE
C11   TTAANFWKEIKIDISSST-----HPYPFSVYLKGFCYWFATDGEE
C12   TMATDSWKEIKIDISSKT-----YPCSCSVYLKGFCYWFTRDGEE
C13   TMTANSWREIKIDTSSDT-DPYCIPYSGSVYLKGFCYWFANDNGE
C14   TTAANSWKEIKIDTSSDT-DPYCIPYSCSMYLKGFCYWFANDNGE
C15   TTTANSWKEIKIDISIET-GWYCIPYSSSVYLKGFCYWFAYDNGE
C16   TMAANSWKEITIDILSKILSSYSEPFSYSVYLKGFCYWLSCDVEE
C17   TTAANSWKEIKIAISRKT-----YQCYGSEYLKGFCYWLANDGEE

con     : : *. * *                * :::*:*** : *  .


C1    FILSFDLGDEIFHRIQLPSRRDSDFKFSNLFLCNKSIASFGYCCN
C2    YVLSFDLCDETFHRIPFPSRGESGooooooooooooooooooooo
C3    YILSFDLGDDTFHVIQLPSRRESGFRFYYIFLRNESLAAFCSRYD
C4    YILSFYVGDETFHKIQLPSRRESGFTFDYIFLLNESLASFCSPYN
C5    YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESDFEFSNIFLCNKSIASFCSCHD
C6    YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESSFKFYDLFLYNESITSYCSHYD
C7    YICSFNLGDEIFDRIELPSRRESGFKLDGIFLYNESITYYCTSYE
C8    YILSFDLGDEIFHRIQLPSRRESGFKFYYIFLRNESLASFCSRYD
C9    YILSFDLGDEIFYRIQLPSRKESGFKFYSLFLYNESVTSYCSHYD
C10   YILSFDLGDEIFHRIQLPYRKESGFLFYDLFLYNESVASFCSHYD
C11   CILSFDLGDEIFHRIQLPSKIESSFNFCGLFLYNESITSYCCRYD
C12   FILSFDLGDERFHRIQLPSRRESGFEFYYIFLCNESIASFCSLYD
C13   YVFSFDLCDEIFHRIELPSRGEFDFKFYGIFLYNESITSYCSRYE
C14   YIFSFDLGDEMFHRIELPFRRESDFKFCGLFLYNESVASYCSCYE
C15   YVFSFDLGDEIFHRIELPSRRESDFKFYGIFLYNESVTSYCYCHE
C16   YIFSFDLANEISDMIELPFRGEFGFKRDGIFLYNESLTYYCSSYE
C17   YVLSFDLGDEIFHTIQLPSRRESGFKFYNIFLCNESIASFCCCYD

con    : ** : ::    * :* : : .                     


C1    PSDEDSToooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    R-SEDSELCEIWVMooooooooooooooooooooooooooooooo
C4    P-SEDSKLFEIWVMDDYDGVKSLWTKLLTVGPFKGIEYPLALWKC
C5    PSDEVSTLCEIWVMDDYDRVKSSWTKLLTFGPLKGIENPFAFWKS
C6    P-TEDSKLFEIWVMDoooooooooooooooooooooooooooooo
C7    ---ERSRLFEIWVMDNYDGVKRSWTKHLTAGPFKGIEFPLTLWKH
C8    R-SDKSESCEIWVoooooooooooooooooooooooooooooooo
C9    P-SEDSKLFEIWVMDNYDGVKSSWKKLLTVGPLKGIRYPLTLooo
C10   K-SDNSGILEILooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11   P-SEDSKLFEIWVMDGYGGVKSLWTKLLTVGPFKGIEYPLTFWKC
C12   R-SQDSKSCEIWVMDDYDGVKSSWTKLLVAGPFKGIEKPLTLWKC
C13   ---EDCKLFEIWVMDDYDGVKSLWTKLLMVGPFKDIDYPLTFooo
C14   ---EDCKLVEIWVMDDYDGVKSSWTKLLTVGPFKDIESPLTFWKC
C15   ---EDCELFoooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C16   ---EPFTLFoooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C17   PKNEDSTLCETWVMDoooooooooooooooooooooooooooooo

con                                                


C1    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C4    DELLMLASDGRATSYNSSTRNoooooooooooooooooooooooo
C5    DELLMVooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C7    DELLMIASoooooooooooooooooooooooooooooooooo---
C8    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C9    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C10   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C11   DELLMVASGRRVTSYNSoooooooooooooooooooooooooooo
C12   DELLMIDTDGRVISYNSSIGYLSYLHIPPIINRVIDSQALIYVES
C13   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C14   DEVLILSSYGKATSYNSSTGNLKYLDIPPIINWMIDYVkSiVSVK
C15   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C16   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C17   ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo

con                                                


C1    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    oooooooooooooooooooooooooooooooooo-----------
C4    oooooo---------------------------------------
C5    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C6    oooooooooooooooooooooooooooo-----------------
C7    ---------------------------------------------
C8    ooooo----------------------------------------
C9    oooooooooooo---------------------------------
C10   oooooooooooooooooooooooooooooooooo-----------
C11   ooooooooooooooooooooooooooooo----------------
C12   IVPVK----------------------------------------
C13   oooooooooooooooooooooooooooooooooo-----------
C14   ooo------------------------------------------
C15   ooooooooooooooooooooooooo--------------------
C16   oooooooooooooooooooooooooooooo---------------
C17   ooo------------------------------------------

con                                                


C1    ooooooooooo----------------------------------
C2    ooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    ---------------------------------------------
C4    ---------------------------------------------
C5    ooooooooooo----------------------------------
C6    ---------------------------------------------
C7    ---------------------------------------------
C8    ---------------------------------------------
C9    ---------------------------------------------
C10   ---------------------------------------------
C11   ---------------------------------------------
C12   ---------------------------------------------
C13   ---------------------------------------------
C14   ---------------------------------------------
C15   ---------------------------------------------
C16   ---------------------------------------------
C17   ---------------------------------------------

con                                                


C1    --------------------------------
C2    oooooooooooooooooooooooooooooooo
C3    --------------------------------
C4    --------------------------------
C5    --------------------------------
C6    --------------------------------
C7    --------------------------------
C8    --------------------------------
C9    --------------------------------
C10   --------------------------------
C11   --------------------------------
C12   --------------------------------
C13   --------------------------------
C14   --------------------------------
C15   --------------------------------
C16   --------------------------------
C17   --------------------------------

con